Фрукт как звездочка в разрезе название: Экзотический фрукт Карамбола — спасение от авитаминоза

Содержание

Фрукт как звездочка в разрезе название. Полезные свойства и противопоказания карамболы, или старфрута. Что это такое

Туманное прошлое и светлое настоящее

Карамбола в кулинарии

Карамбола нашла применение как в кулинарии, так и в народной медицине. Чаще всего дольками плодов в виде звездочек украшают блюда, десерты и коктейли. Зеленые плоды используют как овощи, их добавляют в горячие блюда, салаты, солят и маринуют.

Из плодов делают сок, повидло, добавляют в напитки и соусы. В жарких странах ценятся кислые сорта карамболы как более освежающие, тогда как в умеренном климате предпочитают сладкие. Кислые и недозрелые плоды часто используют как овощи и добавляют к блюдам, которые при этом приобретают своеобразный привкус и аромат. В некоторых странах плоды сушат, в Китае и Тайване — консервируют в сиропе.

В Индии карамболу включают в состав многих приправ. Благодаря кислому вкусу она идеально сочетается с рыбными и мясными блюдами. В Китае в качестве гарнира используют слегка обжаренные кусочки плодов. В Таиланде карамболу подают с креветками, а на Ямайке плоды сушат.

Помимо использования в кулинарии, карамбола обладает лекарственными свойствами. Плоды богаты антиоксидантами — полифенольными флавоноидами, среди которых кверцитин, эпикатехин и галловая кислота. Общее содержание флавоноидов — 143 мг/100 г. Флавоноиды способствуют окислению свободных радикалов в организме и их выведению. Кроме того, была подтверждена слабая антимикробная активность плодов карамболы.

В Индии применяют плоды в качестве кровоостанавливающего средства. Бразильцы используют измельченные листья при лечении стригущего лишая и ветряной оспы, а сами листья прикладывают к голове при головной боли. Порошок из семян снижает артериальное давление, облегчает колики и приступы кашля, вплоть до астматических. Сок карамболы снимает похмелье эффективнее любого рассола. Корни, перетертые с сахаром, принимают как антидот при отравлениях.

Столь нежный и сложный по форме фрукт плохо переносит транспортировку и имеет небольшой срок хранения. Поэтому при промышленном возделывании плоды снимают не полностью созревшими, а когда желтеет тело плода, соединяющее ребра, а сами ребра еще остаются светло-зелеными. Снятые фрукты могут храниться в холодильнике до 3-х недель. Фрукты, оставленные при комнатной температуре, стремительно дозревают, не прибавляя при этом сахаристости, и хранятся не более 3-5 дней.

Спелые плоды хранятся 2-3 дня при комнатной температуре. Если купленные плоды карамболы на вкус показались вам кислыми, можно добавить их в рыбные и мясные блюда.

Этот необычный экзотический фрукт в разрезе похож на звезду, его употребляют в пищу в странах Европы и Восточной Азии. Это кисло-сладкий фрукт, который способен утолить жажду и богат большим количеством витаминов.

Карамбола – экзотический фрукт, его употребляют в пищу в странах Европы и Восточной Азии. Это кисло-сладкий фрукт, который способен утолить жажду и богат большим количеством витаминов.

Карамбола – вечнозеленое дерево, которое может достигать в высоту 5 метров. Возможно выращивание в домашних условиях.

На вкус плоды желтого кисловаты на вкус, а зленные – сладкие. Имеет приятный освежающий и немного резкий вкус, немного похож на ананас или лимон.

Где растет Карамбола?

Деревья карамболы можно встретить в индонезийских лесах, в США, на Юго-Востоке Азии. Самый благоприятный климат для нее тропический и субтропический, во время низких температур погибает.
Сезон созревания.
Сезон карамболы с октября по октябрь в Тайланде, но на рынке можно найти его в любой сезон.

Состав и польза карамболы.

Плоды карамболы богаты витаминами и органическими кислотами. Является источником витамина С, В1, В2, В5. Цветки плода используют как лекарство. В Индии ее применяют как средство от кровотечения, от геморроя. Сухие листья применимы в качестве лекарства от диареи.

Отваривают листья и плоды в Бразилии – это служит противорвотным средством. Вымытый листок можно прикладывать к вискам, чтобы снять сильные головные боли. Измельченные листья с побегами применяют при стригущем лишае. А корень плодов используют при отравлениях.
Измельченные семена применяют от коликов и как успокоительное. Ион известна своими свойствами, понижающими давление и служит хорошим защитником иммунитета. Очень хороший помощник при авитаминозе.

Как правильно выбрать карамболу?

Чтобы правильно выбрать карамболу, нужно обратить внимание на состояние и цвет плода. Сам фрукт должен при нажатии не оставлять никаких вмятин, не должен быть мягким. Запах похож на цветки жасмина. На плоде не должно быть никаких трещин и повреждений. Размер фрукта не имеет значения. Необязательно спелый фрукт должен быть крупным.

Как едят карамболу?

Едят плоды, предварительно очистив кожуру. Можно мариновать, сушить, то есть есть в любом виде. Карамбола может просто служить украшением на столе. В маринованном виде по вкусу похожа на крыжовник.
Возможно использование плода как овоща и есть в сыром виде.

Что можно приготовить из Карамболы?

Карамбола хороша с любыми сочетаниями. Ее можно запекать, жарить, употреблять в сыром виде. Самый простой рецепт с карамболы – салат. Необходимо взять одинаковое количество фруктов (яблоко, банан, апельсин, киви, виноград, зерна граната), нарезать, присыпать тертым шоколадом и полить ликером.

Человек стремится ко всему необычному – путешествует, узнает новых людей, с удовольствием лакомится незнакомыми кухнями всего мира. Но больше всего нам нравится пробовать экзотические фрукты. Они представляют собой разные формы, вкусы и запахи. Одним из самых удивительных фруктов Юго-Восточной Азии считается карамбола. Карамболу часто называют звездным яблоком из-за своей необычной формы. Порезанная вдоль, карамбола представляет собой подобие пятиконечной звезды, которой можно украсить любое блюдо.

Польза карамболы

Этот фрукт насыщен многими витаминами, минералами и микроэлементами. Его употребление очень полезно для человека.

  1. Карамбола — невероятно низкокалорийный продукт. На 100 грамм мякоти приходится только 35 калорий. Поэтому этот фрукт без ограничения могут есть те, кто следит за своей фигурой.
  2. Витамин В1, который содержится в мякоти этого экзотического фрукта, благотворно влияет на работу нервной системы. При регулярном потреблении карамболы человек становится менее раздражительным, спокойным, уравновешенным. Кроме того, через 10 минут после поедания фрукта улучшается настроение, появляется бодрость, повышается работоспособность.
  3. Карамбола насыщена различными кислотами, что позволяет фрукту благотворно влиять на работу щитовидной железы. Постоянное поедание фрукта снижает риск возникновения пищевой аллергии, сердечных заболеваний, артрита.
  4. Этот фрукт по праву считается лучшим средством для красоты. Его постоянное употребление гарантирует вам крепость ногтей, здоровье волос и увлажненность кожи.
  5. Карамбола содержит тиамин, который влияет на работу пищеварения. Этот фрукт улучшает аппетит, что особенно актуально для детей, пожилых людей, а также больных на этапе реабилитации после серьезных заболеваний.
  6. Жители Шри-Ланки используют сок карамболы для отбеливания зубов, выведения различных пятен с одежды и металлических изделий.
  7. Карамбола укрепляет иммунитет, помогает быстрее справиться с простудными заболеваниями, улучшает сопротивляемость организма.
  8. А еще карамболу с успехом используют для снятия похмельного синдрома. Сок этого фрукта утоляет жажду, снимает интоксикацию, борется с головной болью.

Все полезные свойства этого необычного фрукта говорят нам о том, что есть карамболу нужно! И как можно больше, если у вас, конечно, если такая возможность.

Как выбрать карамболу

Подобно банану, фрукт может быть желтым, сладким и мягким или зеленым и жестким. Как ни странно, но жители Азии больше ценят последний вид карамболы. Они считают, что в недозрелом плоде больше полезных свойств. Вы можете выбрать тот фрукт, который вам нравится больше всего. Это зависит от ваших предпочтений, любите ли вы все приторно сладкое или предпочитаете фрукты с кислинкой.
Узкие ребра карамболы должны быть четко разделены, грани фрукта должны быть мясистыми и в меру мягкими.

По вкусу карамбола напоминает смесь крыжовника, яблока и сливы. Некоторые явно ощущают в карамболе апельсин и даже огурец. Уверенным можно быть только в одном – чтобы почувствовать вкус карамболы, ее нужно попробовать.

В Россию фрукт привозят в незрелом виде, по дороге он почти поспевает. Хранить купленную в магазине карамболу можно 2-4 недели, в зависимости от ее первоначального состояния.

Однако увлекаться карамболой нельзя тем, кто страдает от повышенной кислотности желудка. Фрукт также противопоказан при заболеваниях почек.

Как съесть карамболу

Некоторые жители планеты, живущие далеко от места выращивания этого экзотического фрукта, даже не знают, можно ли его есть. А если можно, то как это сделать?

  1. Съесть фрукт очень просто – он полностью съедобен. Но для начала его нужно тщательно вымыть. Особенно много пыли застревает между гранями фрукта, во впадинах.
  2. Нарежьте фрукт поперек так, чтобы перед вами оказалось несколько звездочек шириной в 1 см.
  3. Крамболу можно съесть прямо с косточками и кожурой, однако некоторые предпочитают полностью очищать фрукт. Для этого вам нужно проткнуть центр звездочки ножом, чтобы очистить плод от мягких косточек. После этого осторожно срежьте тонким ножичком края фрукта, чтобы удалить черные прожилки и желтую кожуру.
  4. Кроме гастрономического удовлетворения карамбола создает эстетическое удовольствие. Ею украшают бокалы коктейлей, десерты, мороженое, выпечку. Красивые желтые звездочки способны украсить любое блюдо.

Чтобы получить максимум пользы от продукта, карамболу, как и любой другой фрукт, нужно есть в свежем виде. Однако из этого сочного плода можно готовить некоторые блюда.

Рецепты с карамболой

Если у вас в запасе много карамболы, из нее можно приготовить массу полезных и вкусных блюд.

  1. В Китае карамболу используют для фаршировки рыбы. Фрукт мелко нарезают, смешивают с лимоном и другими цитрусовыми, начиняют этим рыбу перед запеканием. Такая начинка придает рыбе невероятный аромат и кисло-сладкий вкус.
  2. Если смешать сок карамболы с апельсином и желатином, получится очень вкусное желе. Это блюдо нашло свою популярность на Гавайах.
  3. Карамбола – великолепный соус для мясных блюд. Ее смешивают с измельченным сельдереем, хреном, уксусом и специями.
  4. Кисло-сладкий вкус сока карамболы часто используют в качестве заправок для салатов. Фрукт придает необычный вкус даже самым обыденным продуктам.
  5. Если карамбола недозрела и не набрала сладости, ее с успехом используют в качестве овоща. Из карамболы делают овощное рагу, добавляют фрукт в салаты, тушат и маринуют.
  6. Карамбола не считается аллергеном, поэтому пюре из этого плода зачастую является первым в прикорме малышей Азии.

Если у вас появилась возможность съесть карамболу – не отказывайтесь от нее. Попробуйте сочный кисло-сладкий плод и вберите в себя пользу этого экзотического фрукта.

Видео: как есть фрукт карамбола

Карамболу можно вырастить в домашних условиях. Растение хорошо размножается семенами. Для посадки необходимо выбрать в супермаркете спелый фрукт понравившегося вам сорта. За растением легко ухаживать даже новичку. Посмотрите на фото, какую необычную красивую форму имеет фрукт. Тропической звёздочкой украшают блюда и широко используют в кулинарии.

Сорта и разновидности карамболы

Родиной фрукта считают Азию. На родине он так же популярен, как у нас огурцы или яблоки. В жару фруктом можно утолить жажду, так как мякоть очень сочная и имеет кисло-сладкий вкус. Карамболу акклиматизировали в Бразилии, Израиле, Таиланде, на Гавайских островах. Как только не называют карамболу: тропичекая звезда, камрак, иллициум, карамболь и др. На территории России растёт родственница этого растения – кислица.

Карамболу едят в сыром виде, а также готовят из нее десерты

Карамбола представляет собой вечнозелёное дерево до 12 м. Фрукты едят с кожицей. Причём разные сорта отличаются по вкусу и напоминают наши сливы , яблоко с виноградом, крыжовник с ароматом сливы. Местные жители ценят сорта с кислыми плодами. Недозрелые фрукты используют как овощи, а спелые – как десерт. Листья дерева по вкусу напоминают шпинат, их широко используют в индийской кухне. Цветки используют как специю, добавляют в салаты.

  1. Плоды содержат большое количество витаминов и кислот, макроэлементы. Фрукты, цветы и листья используют как лекарственное растение.
  2. Сок фрукта можно использовать как отбеливатель для удаления пятен с одежды.
  3. Мякотью можно отполировать изделия из меди или латуни.
  4. Сок камрака способен избавить от похмельного синдрома и жажды.
  5. Если плоды приварить в сахарном сиропе они становятся очень ароматными.
  6. Плоды маринуют, солят, добавляют к мясным блюдам и рагу, украшают коктейли.

Мякоть карамболы очень сочная и полезная

Посадка

Не имеет значения, где вы взяли плод карамболы – в местном магазине или привезли из зарубежной поездки. Самое главное выбрать спелый фрукт без повреждений и аккуратно достать из мякоти зрелые семена. Спелая карамбола имеет яркую жёлтую окраску. Обратите внимание на рёбра фрукта. Мясистые указывают на сладкий плод, а узкие обычно бывают с кислинкой. Понюхайте фрукт, чем более выражен у него аромат – тем он спелее. На российских прилавках нет полностью спелой карамболы, так как фрукт импортируют издалека и просто невозможно привезти спелые фрукты товарного вида. Карамбола дозревает несколько недель на прилавках или в холодильнике.

При правильном уходе тропические фрукты можно вырастить на подоконнике

Семена очень быстро теряют всхожесть, поэтому их необходимо посадить без промедления.Семена промывают тёплой водой и замачивают 10 часов. После замачивания семена высевают в индивидуальные горшочки с универсальной почвенной смесью и вермикулитом. На дно обязательно укладывают керамзит – он обеспечит дренаж. Глубина заделки семян – 1 см. Горшочки ставят в маленькую тепличку. Время всхожести у каждого семечка индивидуальное, обычно это занимает от одной недели до месяца. Молодым расточкам обеспечивают подсветку, чтобы световой день составлял 13 часов.

Если вы посадили семена в общий ящик, то при появлении третьего листа, сеянцы необходимо посадить в индивидуальные ёмкости. Более поздняя посадка травмирует корневую систему и уменьшает процент приживаемости растений.

Молодые растения необходимо опрыскивать подогретой водой, чтобы обеспечить высокую влажность воздуха.

Совет. В плодах карамболы содержится щавелевая кислота. Поэтому людям с проблемами желудочно-кишечного тракта следует есть карамболу в небольших количествах, чтобы не вызвать обострение болезни. Чрезмерное потребление плодов может нарушить солевой обмен в организме и привести к почечным патологиям.

Уход, удобрение и подкормка

Карамбола нуждается в минимальном уходе. Так как растение способно цвести и завязывать плоды круглый год – ему требуется много питательных веществ. Подкормку осуществляют один раз в квартал. Используют комплексные удобрения для растений. При недостатке железа у растения может развиться хлороз.

В обрезке растение практически не нуждается. В основном обрезку делают в целях формировки кроны.

Карамбола нуждается в ежегодной пересадке в горшок большего объёма. Почвосмесь должна иметь слабую кислую реакцию, ни в коем случае не щелочную. Обязателен слой дренажа на дно емкости для отвода лишней воды.

Семена карамболы

Растение любит солнце, но прямые солнечные лучи южных окон могут вызвать ожог листьев. Плохо себя чувствует карамболь в сухом климате: необходимо поддерживать влажность воздуха, опрыскивать растение, особенно в жаркие дни. У растения есть одна особенность – на ночь его листики сворачиваются, но если такое произошло днём – нужно бить тревогу. Саженец нуждается в скорой помощи, что-то идёт не так. При недостатке влаги в грунте саженец может полностью сбросить весь листовой аппарат. При поливе важно соблюдать баланс, так как избыток влаги ухудшает дыхание корней и способствует образованию гнилостных заболеваний. Растение может погибнуть.

Оптимальная температура произрастания для деревца в летний период – от 20 0С. Зимой она не должна опускаться ниже 15 0С.

Совет. Карамбола, выросшая из косточки, зацветает на третий или четвёртый год жизни.

Размножение

Растение размножают несколькими способами:

  • прививкой;
  • семенами.

Прививка позволяет получить деревце с плодами, которые обладают определёнными вкусовыми характеристиками. В наших условиях это практически нереально. Для нашей климатичекой зоны доступно только семенное размножение. Выращивая карамболь из семян, невозможно предсказать какого вкуса будут плоды у сеянца. Сладкие или кислые. Цвет кожуры тоже может варьироваться от жёлто-зелёного до абрикосового и коричневого. Поэтому выращивают сразу несколько сеянцев, а когда растение начнёт плодоносить оставляют экземпляр со сладкими плодами.

Саженцы карамболы

Болезни и вредители карамболы

Так как карамбола новичок в наших широтах, то ещё не приобрела «популярности» у вредителей и болезней. Растению может навредить почковая нематода, отмечены случаи поражения плодовой мухой. Избыточный полив или застой воды в поддоне способствует развитию грибковых болезней: антракноза или филлостикоза. Щелочная реакция почвы может вызвать у сеянца хлороз.

Плод карамболы: видео

Карамбола в домашних условиях: фото


Или огурцы . Да и по вкусу он представляет собой что-то среднее между яблоком, крыжовником и огурцом. В Европе тоже достаточно популярна благодаря своей необычной форме. Дело в том, что этот желто-зелёный ребристый фрукт в поперечном сечении имеет форму звезды. Поэтому карамболу ещё называют звездчатым фруктом. Достаточно порезать её поперёк, и украшение для любого стола готово.

Карамбола имеет кисло-сладкий освежающий вкус и содержит много жидкости, поэтому это отличное средство для утоления жажды.

В разных странах карамбола имеет разные названия, среди них «карамболь», «старфрут», «корнишон», «пятый угол» и «звёздное яблоко. Растёт этот фрукт в Индии, Гане. Индонезии, Полинезии, Малайзии, Шри-Ланке и других странах. Также выращивают карамболу на юге Америки, в штате Флорида и на Гавайских островах. В Россию её привозят из Бразилии, Израиля и Тайланда.

Состав и польза карамболы

Одно из достоинств старфрута – низкая калорийность , на 100 г фрукта приходится всего 34-35 ккал. В плодах довольно много кальция, фосфора, железа, натрия, магния и калия. Также он содержит много витамина С, тиамина, рибофлавина, бета-каротина и пантотеновой кислоты. О пользе карамболы для здоровья человека известно не очень много. Однако состав плодов говорит сам за себя – это отличный источник витаминов и минералов.

Тиамин (витамин В1) поддерживает нормальную работу нервной системы . В организме нет запасов этого вещества, поэтому нужно постоянно получать его с пищей. Особенно это актуально для любителей вредной пищи (мучного, сладкого и т.д.), детей во время роста и женщин за 50. При достаточном содержании тиамина в организме человек чувствует себя бодрым, меньше устаёт, не склонен к нервозности и раздражительности. Также витамин В1 помогает улучшить работу пищеварительной системы и аппетит.

Рибофлавин (витамин В2) участвует в процессе образования эритроцитов и антител , помогает регулировать репродуктивные функции организма и работу щитовидной железы. Также это вещество необходимо для поддержания здоровья кожи , волос и ногтей .

Пантотеновая кислота (витамин В5) регулирует обмен жиров, углеводов , синтезирует жизненно важные кислоты, холестерин, гистамин, гемоглобин. Он стимулирует образование гормонов надпочечников. Поддержание нормального уровня пантотеновой кислоты в организме является отличным способом профилактики таких заболеваний как артриты, болезни сердца, колиты и аллергии.

О важности таких минералов как кальций, магний, фосфор и других известно много. Все они необходимы для поддержания организма в нормальном состоянии. А в наше время, к сожалению, организм часто недополучает того или иного полезного вещества. Поэтому карамбола – это замечательный способ помочь своему организму.

В Азии карамболу применяют при слабом иммунитете, авитаминозе , головных болях, лихорадке, коликах и запорах. Довольно много в старфруте и щавелевой кислоты. Она, конечно, тоже полезна для человека, однако людям с заболеваниями почек или пищеварительной системы лучше не увлекаться этим фруктом. А вот на Шри-Ланке, например, люди очень удачно используют содержащуюся в карамболе кислоту для выведения пятен с одежды. Также с помощью старфрута полируют медь и латунь.

Как правильно выбрать карамболу

Азиаты больше всего ценят не совсем зрелые кислые плоды, узкие рёбра которых чётко разделены. А вот любителям сладких плодов нужно искать светло-жёлтую или желто-зелёную карамболу, имеющую мясистые боковые рёбра и тёмно-коричневую полоску на них. В таких плодах есть совсем маленькая кислинка, а по запаху они немного напоминают цветки жасмина. Описать вкус карамболы практически невозможно, кто-то сравнивает её с огурцом и крыжовником, кто-то с виноградом и сливой, а некоторые явно чувствуют вкус апельсина и яблока. Конечно, лучше всего попробовать этот удивительный фрукт и найти в его вкусе что-то своё. К сожалению, в российских магазинах нельзя найти старфрут, созревший до конца на дереве. Как и многие другие фрукты, его срывают и отправляют к нам ещё незрелым, а дозревает он уже в дороге. Но иначе карамболу просто не довезти. Зато храниться в холодильнике она может до 3 недель.

Как едят карамболу

Мы уже знаем, что звездчатый фрукт можно использовать для украшения салатов, коктейлей или мороженого и что он вкусный сам по себе. Однако это не все его достоинства. В разных странах этот фрукт используют для приготовления разнообразных блюд. Самой обычной пище карамбола придаст загадочный экзотический вкус и аромат. На Шри-Ланке карамболу едят в сыром виде, прямо с кожурой. А вот китайцы очень любят готовить рыбу со старфрутом. На Гавайях делают вкуснейший щербет, смешивая сок карамболы и лимона и добавляя к нему желатин. Вообще сок карамболы можно добавлять в коктейли, смешивать с апельсиновым , ананасовым или соком манго .

Можно приготовить соус с карамболой, который отлично подойдёт к мясу . Для его приготовления нужно смешать измельчённый старфрут с хреном, сельдереем , уксусом и специями. А можно переложить кусочки тушёного мяса тонкими кусочками карамболы. Она одновременно и придаст необычный вкус блюду и украсит его.

Недозрелую карамболу используют как овощ . Её можно потушить с другими овощами и получить вкуснейшее рагу. Также её маринуют и солят. Из сладких плодов делают всевозможные пюре, пудинги, желе, соки и другие блюда. В Южной Азии используют в пищу и кисловатые цветки карамболы, добавляя их в салаты.

Тематические материалы:

Обновлено: 14.05.2019

103583

Если заметили ошибку, выделите фрагмент текста и нажмите Ctrl+Enter

Фрукты Сингапура

Дуриан

Этот колючий безумно вкусных фрукт со своим знаменитым ароматом растёт не в Сингапуре, но здесь его очень и очень много. Дуриан круглый год везут в Сингапур из Малайзии. Самый известный сорт дуриана, продаваемого в Сингапуре, это дуриан D24 жёлтый.

Цена от 50 центов до 28 синг.$/кг, в зависимости от сорта и качества дуриана.

(подробнее)


Манго

В Сингапуре продают малазийские и тайские манго, найти их можно только в супермаркетах. А также есть вкуснейшие индийские манго

Цена: 4.5-6.9 синг.$/кг, индийские

(подробнее)

 

Личи

Здесь продают только китайские личи, тайские не везут. И если в Таиланде сезон личи заканчивается уже в конце июня, то в Сингапуре личи есть в продаже и в июле и в августе! Причём очень хорошего качества. Вкус этих маленьких красно-коричневых плодов сочетает в себе смесь из ягод.

Цена: 3.2 синг.$/кг

(подробнее)

 

Мангостины

А этот тёмно-синий фрукт с белыми кисло-сладкими дольками внутри в Сингапур везут только из Таиланда. Но качество у них намного хуже, чем в самом Таиланде.. много порченных и твёрдых неоткрывающихся плодов.

Цена: 3 синг.$ за 1кг, или 5 синг.$ за 2кг.

 

Рамбутаны

Рамбутаны, т.е. маленькие красные волосатые плоды с кисло-сладким вкусом, в Сингапуре привезены из Таиланда и Малайзии. Качество отличное, плоды очень свежие.

Цена: 3-5 синг.$/кг

(подробнее)

 

Ананасы

В Сингапуре продают тайские и малайские ананасы. Часто попадаются такие, которые сильно щипят рот, видать потому что их везут слишком незрелыми.

Цена: 2.2 синг.$/шт

 

Арбузы

Здесь продаются красные и оранжевые арбузы, в основном они завезены в Сингапур из Малайзии.

Цена: 1.7 синг.$/кг или 5.2 синг.$ целый арбуз

 

 

Бананы

В Сингапуре много видов бананов: местные бананы Раджа, индийские очень большие и длинные бананы, треугольные бананы, красные бананы, а также множество малазийских сортов бананов. Едят здесь в основном мини бананы, а индийские, треугольные и Раджа используют для готовки.

Цена: треугольные бананы стоят 1-2 синг.$, мини бананы 1-2 синг.$ за связку.

(подробнее)

 

Авокадо

В Сингапуре продаются только австралийские авокадо, а например малазийских и филиппинских местных сюда по непонятным причинам не завозят.

Цена: 1.5-1.95 синг.$/шт

 

Джекфрут

Сюда везут только малайские джекфруты, не тайские. Самый божественный сорт – королевский джекфрут. Кстати, это самый огромный фрукт в мире, его вес достигает 30-40 кг!

Цена: От 2.7 до 5 синг.$ за упаковку

(подробнее)

 

Чемпедак

Чемпедак в Сингапуре, как и джекфрут, только из Малайзии. Он доступен здесь круглый год, в отличие от Таиланда, но в сезон значительно дешевле. Бывает дуриановый чемпедак (когда кожура сильно напоминает дуриан), джекфрутовый и обычный.

Цена: 3.2-4 синг.$/кг

 

Дыни

В Сингапуре продают испанские, малайские и китайские дыни. Самые наивкуснейшие – испанские дыни.

Цена: 3.65-5.8 синг.$/шт

(подробнее)

 

Лонгконг

Логконг в Сингапуре завезён из Таиланда. Это маленькие бежевые плоды, напоминающие крупный виноград, под их шкуркой скрываются дольки бело-прозрачной сладко-кислой мякоти.

Цена: 2.5 синг.$/кг

 

Лонган

Этот фрукт также из Таиланда, он потемнее, чем лонгконг, и его кожура более гладкая. Внутри также бело-прозрачная мякоть, но не дольками, а цельная, а в середине одна круглая косточка.

Цена: 3 синг.$/кг

 

Сахарное яблоко

Это большие светло-зелёные плоды, внутри с белой мега сладкой мякотью и небольшими тёмными косточками. Название этому фрукту дано не зря. В Сингапур его завозят из Таиланда. Бывает также маленькое фиолетовое сахарное яблоко, его привозят из Малайзии.

Цена: 3.9 синг.$/кг – фиолетовое маленькое, и 5.9 синг.$/кг – крупное зелёное сахарное яблоко.

 

Папайя

В Сингапуре продаётся в основном только крупная папайя. Сверху она оранжево-зелёная, и чем оранжевее, тем спелее. Внутри она ярко-оранжевая со множеством круглых чёрных косточек.

Цена: 1.6 синг.$/кг или 3.2 синг.$/шт

 

 

Гуава

Гуава в Сингапуре зелёная недозрелая.. как и в Таиланде, Малайзии и Филиппинах. Бывает бескосточковая гуава. Это зелёный фрукт, размером с яблоко, внутри белая мякоть и мелкие, но противные косточки.

Цена: 2.9 синг.$/кг

 

Чику (саподилла)

Этот фрукт в Сингапур везут из Малайзии. Чику бежево-серого цвета, размером с крупное киви, внутри коричневая очень сладкая мякоть и вытянутые тёмные косточки. По вкусу напоминает хурму, ириску, конфету, мёд.

Цена: 2.9 синг.$/кг

 

Питахайя

Питахайя или драконий фрукт – это плод кактуса. В Сингапур его привозят из Таиланда, Вьетнама и Малайзии. Это фрукт розового цвета, с чешуйками на кожуре. Внутри белая мякоть с мелкими съедобными косточками как у киви.

Цена: 2.5-6 синг.$/кг синг.$/кг

 

Мандарины

В Сингапуре продают именно мандарины, а тайских и филиппинских танжеринов здесь нет.

Цена: 3 синг.доллара/кг

 

Помело

Помело в Сингапуре тайское и малайское. С белой и с розовой мякотью внутри.

Цена: 2.95 синг.$/шт

 

Карамбола

Это фрукт-звезда. При разрезе образуется самая настоящая звёздочка. Карамбола очень сочная, с кисленьким вкусом.

Цена: 3.8 синг.$/кг

 

Салак

Это фрукт со змеиной кожурой, вытянутой формы. Мякоть плотной консистенции, с кислинкой, внутри содержится достаточно крупная косточка. По вкусу напоминает что-то ягодно-персиковое.

Цена: 4.9-5.3 синг.$/кг

 

Молодые кокосы

Кокосы в Сингапур завозят из Малайзии и, по большей части, из Таиланда. Тайские кокосы здесь все обтёсанные, цельных нет, и почти все они с несвежим привкусом.. А вот малайские молодые кокосы можно найти в целом виде, в супермаркетах. Они всегда свежие и вкусные. А вообще, с кокосами в Сингапуре напряг.

Цена: 1.95-2.65 синг.$/шт (обтёсанные, тайские), 1.1 синг.$/шт (целые, малайские)

 

Помидоры

В Сингапуре продаётся много видов помидоров, и почти все они из Малайзии. Самые хорошие помидорки – в индийской лавке и помидоры-черри в супермарктах в мини упаковках.

Цена: 1.9 синг.$/кг

 

Маракуйя

Это плод лианы. Маленькие круглые или вытянутые плоды, розового или жёлтого цвета, внутри кисло-сладкая жидкость со съедобными косточками.

(подробнее)

 

А также в Сингапуре много импортных персиков (5 синг.$/штука), абрикосов (3.65 синг.$ за упаковку), черешни (30 синг.$/кг или 4.85 синг.$ за упаковку в 250г), клубники (5.25 синг.$ за упаковку в 454г), киви (4.85 синг.$ за упаковку), винограда (4.9 синг.$/кг), гранатов, хурмы, яблок, груш, цитрусовых.

Самые вкусные экзотические фрукты,которые всем следут попробовать . | Узнавайка

Глаз Дракона (питахайя, питайя, лун янь, dragon fruit, pitaya).

Это плоды кактуса. Глаз дракона – русский вариант названия этого фрукта. Международное название – Фрукт Дракона (Dragon Fruit) или Питахайя.

Довольно большие, продолговатые плоды (размером с ладонь) красного, розового или желтого цвета снаружи. Внутри мякоть белого или красного цвета, усеянная мелкими черными косточками. Мякоть очень нежная, сочная, слегка сладкая, с невыраженным вкусом. Удобно есть ложкой, вычерпывая мякоть из разрезанного пополам плода. Плоды с красной и белой мякотью — это разные сорта, а не разная степень зрелости. Питахайя с красной мякотью считается более сладкой.

Глаз дракона полезен при желудочных болях, сахарном диабете или ином эндокринном заболевании.

Сезоны сбора урожая – круглый год.

Карамбола (Старфрут, Камрак, Ма Фыак, Carambola, Star-fruit).

«Звезда тропиков» — в разрезе по форме представляем из себя звездочку.

Плод со съедобной кожурой, съедается целиком (внутри есть небольшие семечки). Главное достоинство – приятный запах и сочность. Вкус особо ничем не выделяется – слегка сладкий или кисло-сладкий, чем-то напоминает вкус яблока. Достаточно сочный фрукт и отлично утоляет жажду.

Продается круглый год.

Людям с выраженными сбоями в работе почек потреблять Карамболу не рекомендуется.

Маракуйя

Этот экзотический фрукт также называется Фрукт страсти, Пассифлора (Passiflora), Страстоцвет съедобный, Гранадилла. Родиной является южная Америка, но можно встретить в большинстве тропических стран, в том числе в странах юго-восточной Азии. Свое второе название «Фрукт страсти» получил потому, что ему приписывают свойства сильного афродизиака.

Плоды Маракуй имеют гладкую, немного вытянутую округлую форму, в диаметре достигают 8 сантиметров. Зрелые плоды имеют очень яркую сочную окраску и бывают желтого, фиолетового, розового или красного цветов. Плоды желтого цвета менее сладкие, чем другие. Мякоть бывает также различных цветов. Под несъедобной кожурой находится желеобразная кисло-сладкая мякоть с косточками. Особо вкусной ее не назовешь, гораздо вкуснее сделанные из нее соки, желе и т.п.

При употреблении удобнее всего плод разрезать пополам и съедать мякоть ложкой. Косточки в мякоти тоже съедобные, но они вызывают сонливость, поэтому лучше с ними не злоупотреблять. Сок Маракуй, кстати, тоже действует успокаивающе и вызывает сонливость. Самые зрелые и вкусные плоды те, кожура которых не идеально гладкая, а покрыта «морщинками» или небольшими «вмятинками» (это самые спелые плоды).

Сезон созревания с мая по август. Хранится в холодильнике Маракуйя может одну неделю.

Папайя (Papaya, Дынное дерево, Хлебное дерево)

Родиной Папайи является южная Америка, но сейчас она встречается практически во всех тропических странах. Плоды Папайи растут на деревьях, имеют цилиндрическую продолговатую форму до 20 сантиметров в длину.

Многие, кто пробовал Папайю, говорят, что это скорее овощ, чем фрукт. Но это потому, что они ели недозрелую Папайю. Незрелую Папайю действительно очень широко используют при приготовлении блюд, из нее делают салаты (обязательно попробуйте острый тайский салат из Папайи называемый Сом Там), с ней тушат мясо и просто поджаривают.

Но зрелая Папайя в сыром виде действительно очень вкусная и сладкая. По фактуре она напоминает плотную дыню, а по вкусу нечто среднее между тыквой и дыней. В продаже встречаются как целые плоды зеленого цвета (еще не зрелые, для готовки), так и желто-оранжевые (зрелые, готовые к употреблению в сыром виде). Покупать плод целиком не стоит, лучше покупать готовую к употреблению, очищенную и нарезанную дольками Папайю.

Встретить Папайю в тропических странах можно круглый год.

Инжир (фига, смоковница, смоква, винная ягода, смирнская ягода, Ficus carica)

Плоды Инжира могут быть круглой, грушевидной или приплюснутой формы с одним «глазком». В среднем, созревший плод весит около 80 г., диаметром до 8 см. Сверху покрыт тонкой гладкой кожурой от желтого-зеленого до темно-синего или фиолетового цвета. Под кожурой – слой белой корки. Внутри мякоть очень сладкая и сочная с мелкими семенами, желеобразной консистенции, напоминает по вкусу клубнику. По цвету — мякоть бывает от розового до ярко красного цвета. Незрелые плоды несъедобны и содержат млечный сок.

Растет в Средней Азии, на Кавказе, в Крыму, в странах Средиземноморья.

Выбирать спелый Инжир нужно с плотной кожицей, без пятен, слегка мягкий. Хранить его рекомендуется не более 3-х дней в холодильнике, т.к. он быстро портится и не транспортабелен. Кушать можно вместе с кожурой, порезав на дольки или пополам, выскребая мякоть ложкой. Чаще всего Инжир можно встретить на прилавках магазинов только в сушеном виде. Сушеные плоды перед употреблением предварительно замачивают в воде, воду после такой «отмочки» можно пить (туда переходят полезные вещества).

Инжир сушат, маринуют, варят варенье, джем. В сушеном виде он более питателен и калориен, чем в свежем.

Инжир содержит много калия, железа, витамины В, РР, С, каротин, минеральные вещества и органические кислоты.

Сезон созревания: с августа по ноябрь.

Мафаи или Бирманский виноград (Mafai, Baccaurea ramiflora, Baccaurea sapida)

Плоды Мафаи внешне похожи на плоды Лонгконга (Лонгана) как внешне так и внутри, и являются его разновдностью, но по вкусу это совершенно другой фрукт. Плоды Мафаи бывают от желтого до оранжевого цвета диаметром до 5 см. Кожура тонкая, мягкая, гладкая и хорошо отделяется от мякоти, чистится очень легко. Внутри от 2 до 4 долек, внешне напоминающих чесночные (как и в Лонгконге). Мякоть сочная, белая, кисло-сладкая с освежающим эффектом, но в отличие от Лонгконга намного кислее, иногда даже с горечью. Внутри каждой дольки косточка, которая от мякоти не отделяется, косточка – на вкус горькая. Из за этого фрукт кушать не очень удобно, поскольку почти вся мякоть остается «прилипшей» к косточке, и никак отделить ее не получается. Характерного аромата у этого фрукта нет. В целом нельзя сказать, что за этим фруктом стоится «охотиться», чтобы его непременно попробовать. Это один из самых дешевых экзотических фруктов, которые можно встретить на рынках стран Юго-Восточной Азии.

Встретить данный фрукт можно в Таиланде, Малайзии, Вьетнаме, Индии, Китае, Камбодже. Встречается очень редко. Храниться лучше всего в холодильнике. Без холодильника плоды могут храниться всего несколько дней.

Сезон созревания – с мая по август.

Лонгконг (Лонкон, Лангсат, Lonngkong, Langsat).

Плоды Лонгконга, так же как и Лонган, похожи на мелкую картошку, но немного больше по размеру и имеют желтоватый оттенок. Можно отличить он Лонгана, если отчистить плод от кожуры: очищенный, он по виду напоминает чеснок. Внутри долек могут встречаться мягкие косточки, горькие на вкус, но чаще всего спелые фрукты попадаются без косточек, и их можно есть целиком, только отчистив от кожуры.

Имеют сладкий, иногда немного с кислинкой, интересный вкус, не похожий ни на один другой фрукт. Иногда его сравнивают по вкусу с Личи, но на самом деле вкусы их не похожи. Это один из самых недоцененных туристами экзотических фруктов, и определенно стоит того, чтобы его попробовать.

Плоды богаты кальцием, фосфором, углеводами и витамином C. Сожженная кожица Лонгконга дает ароматный запах, который не только приятен, но и полезен, поскольку служит отличным репеллентом.

Свежий фрукт можно хранить в холодильнике не более 4-5 дней. Кожица спелого фрукта должна быть плотной, без трещин, иначе плод быстро испортится.

Сезон – с апреля по июнь.

Иногда продается также разновидность – Мафаи, которая внешне и внутри ничем не отличается, но имеет кислый и немного горьковатый вкус, от чего Лонгконг несправедливо недолюбливается туристами, которые часто просто путают его с невкусной разновидностью.

Буду очень рад, если вы поставите большой палец вверх этой публикации и подпишитесь на канал!

звездочек в Python: что это такое и как их использовать

Есть много мест, где вы увидите * и ** , используемые в Python. Эти два оператора иногда могут быть немного загадочными как для начинающих программистов, так и для людей, переходящих со многих других языков программирования, которые могут не иметь полностью эквивалентных операторов. Я хотел бы обсудить, что это за операторы и как они используются.

Возможности операторов * и ** выросли с годами, и я буду обсуждать все способы, которыми вы можете в настоящее время использовать эти операторы, и отмечу, какие из них работают только в современных версиях Python.Так что, если вы узнали * и ** еще во времена Python 2, я бы порекомендовал хотя бы бегло просмотреть эту статью, потому что Python 3 добавил много новых применений для этих операторов.

Если вы новичок в Python и еще не знакомы с аргументами ключевых слов (также известными как именованные аргументы), я бы порекомендовал сначала прочитать мою статью об аргументах ключевых слов в Python.

О чем мы не говорим

Когда я обсуждаю в этой статье * и ** , я имею в виду операторы префикса * и ** префикса , а не операторы инфиксного .

Итак, я не говорю об умножении и возведении в степень:

 1
2
3
4
 
  >>> 2 * 5
10
>>> 2 ** 5
32
  

Итак, о чем мы говорим?

Речь идет об операторах префикса * и ** , то есть операторах * и ** , которые используются перед переменной. Например:

 1
2
3
4
 
  >>> числа = [2, 1, 3, 4, 7]
>>> more_numbers = [* числа, 11, 18]
>>> print (* другие_числа, sep = ',')
2, 1, 3, 4, 7, 11, 18
  

В этом коде показаны два использования * , но не показано использование ** .

Сюда входят:

  1. Использование * и ** для передачи аргументов функции
  2. Использование * и ** для захвата аргументов, переданных в функцию
  3. Использование * для принятия аргументов, содержащих только ключевые слова
  4. Использование * для захвата элементов во время распаковки кортежа
  5. Использование * для распаковки итераций в список / кортеж
  6. Использование ** для распаковки словарей в другие словари

Даже если вы думаете, что знакомы со всеми этими способами использования * и ** , я рекомендую просмотреть каждый из приведенных ниже блоков кода, чтобы убедиться, что они все знакомы вам. Разработчики ядра Python продолжали добавлять новые возможности этим операторам в течение последних нескольких лет, и легко упустить из виду некоторые из новых применений * и ** .

Звездочки для распаковки в вызов функции

При вызове функции можно использовать оператор * для распаковки итерации в аргументы в вызове функции:

 1
2
3
4
5
 
  >>> fruit = ['лимон', 'груша', 'арбуз', 'помидор']
>>> печать (фрукты [0], фрукты [1], фрукты [2], фрукты [3])
лимон груша арбуз помидор
>>> print (* фрукты)
лимон груша арбуз помидор
  

Эта строка print (* fruit) передает все элементы из списка fruit в вызов функции print как отдельные аргументы, при этом нам даже не нужно знать, сколько аргументов находится в список.

Оператор * здесь не просто синтаксический сахар. Эта возможность отправки всех элементов в определенной итерации в качестве отдельных аргументов была бы невозможна без * , если только список не был фиксированной длины.

Вот еще один пример:

 1
2
3
4
5
 
  def transpose_list (список_список):
    возвращение [
        список (строка)
        для строки в zip (* list_of_lists)
    ]
  

Здесь мы принимаем список списков и возвращаем «транспонированный» список списков.

 1
2
 
  >>> transpose_list ([[1, 4, 7], [2, 5, 8], [3, 6, 9]])
[[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]]
  

Оператор ** делает нечто подобное, но с ключевыми аргументами. Оператор ** позволяет нам взять словарь пар ключ-значение и распаковать его в аргументы ключевого слова при вызове функции.

 1
2
3
4
 
  >>> date_info = {'год': "2020", 'месяц': "01", 'день': "01"}
>>> filename = "{год} - {месяц} - {день}.txt ".format (** date_info)
>>> имя файла
'2020-01-01.txt'
  

По моему опыту, использование ** для распаковки аргументов ключевого слова в вызов функции не особенно распространено. Я чаще всего это вижу, когда практикую наследование: вызовы super () часто включают как * , так и ** .

Как * , так и ** могут использоваться несколько раз в вызовах функций, начиная с Python 3.5.

Иногда бывает удобно использовать * несколько раз:

 1
2
3
4
 
  >>> fruit = ['лимон', 'груша', 'арбуз', 'помидор']
>>> числа = [2, 1, 3, 4, 7]
>>> print (* числа, * фрукты)
2 1 3 4 7 лимон груша арбуз помидор
  

Использование ** несколько раз выглядит одинаково:

 1
2
3
4
5
6
7
8
 
  >>> date_info = {'год': "2020", 'месяц': "01", 'день': "01"}
>>> track_info = {'artist': "Бетховен", 'title': 'Симфония № 5'}
>>> filename = "{год} - {месяц} - {день} - {исполнитель} - {название}.txt ".format (
... ** date_info,
... ** track_info,
...)
>>> имя файла
'2020-01-01-Бетховен-Симфония No 5.txt'
  

Однако следует соблюдать осторожность при многократном использовании ** . Функции в Python не могут иметь один и тот же аргумент ключевого слова, указанный несколько раз, поэтому ключи в каждом словаре, используемом с ** , должны быть разными, иначе возникнет исключение.

Звездочки для упаковки аргументов, данных функции

При определении функции оператор * может использоваться для захвата неограниченного числа позиционных аргументов, передаваемых функции.Эти аргументы записываются в кортеж.

 1
2
3
4
 
  из случайного импорта randint

def roll (* dice):
    вернуть сумму (randint (1, die) за кубик в кости)
  

Эта функция принимает любое количество аргументов:

 1
2
3
4
5
6
 
  >>> рулон (20)
18
>>> roll (6, 6)
9
>>> roll (6, 6, 6)
8
  

Функции Python print и zip принимают любое количество позиционных аргументов.Использование * для упаковки аргументов позволяет нам создать нашу собственную функцию, которая, как print и zip , принимает любое количество аргументов.

У оператора ** есть и другая сторона: мы можем использовать ** при определении функции для захвата любых аргументов ключевого слова, переданных функции, в словарь:

 1
2
3
4
5
6
 
  тег def (tag_name, ** атрибуты):
    attribute_list = [
        f '{имя} = "{значение}"'
        для имени значение в атрибутах.Предметы()
    ]
    return f "<{tag_name} {'' .join (attribute_list)}>"
  

Этот ** захватит любые аргументы ключевого слова, которые мы передаем этой функции, в словарь, который будет ссылаться на атрибутов аргументов.

 1
2
3
4
 
  >>> tag ('a', href = "http://treyhunner.com")
''
>>> tag ('img', высота = 20, ширина = 40, src = "face.jpg ")
''
  

Позиционные аргументы с аргументами только с ключевыми словами

Начиная с Python 3, у нас теперь есть специальный синтаксис для приема аргументов, содержащих только ключевые слова, для функций. Аргументы только для ключевых слов — это аргументы функции, которые можно указать только , с использованием синтаксиса ключевых слов, что означает, что они не могут быть указаны позиционно.

Чтобы принимать аргументы, содержащие только ключевые слова, мы можем поместить именованные аргументы после использования * при определении нашей функции:

 1
2
3
4
5
 
  def get_multiple (* ключи, словарь, по умолчанию = Нет):
    возвращение [
        толковый словарь.get (ключ, по умолчанию)
        для ключа в ключах
    ]
  

Вышеупомянутую функцию можно использовать следующим образом:

 1
2
3
 
  >>> плод = {'лимон': 'желтый', 'апельсин': 'апельсин', 'помидор': 'красный'}
>>> get_multiple ('лимон', 'помидор', 'тыква', словарь = фрукты, по умолчанию = 'неизвестно')
['желтый', 'красный', 'неизвестный']
  

Аргументы словарь и по умолчанию идут после * ключей , что означает, что в качестве аргументов ключевого слова можно указать только .Если мы попытаемся указать их позиционно, то получим ошибку:

.
 1
2
3
4
5
 
  >>> плод = {'лимон': 'желтый', 'апельсин': 'апельсин', 'помидор': 'красный'}
>>> get_multiple ('лимон', 'помидор', 'тыква', фрукты, 'неизвестно')
Отслеживание (последний вызов последний):
  Файл "", строка 1, в 
TypeError: get_multiple () отсутствует 1 обязательный аргумент, содержащий только ключевое слово: 'словарь'
  

Это поведение было введено в Python через PEP 3102.

Аргументы только для ключевых слов без позиционных аргументов

Эта функция аргументов только с ключевыми словами — это здорово, но что, если вы хотите требовать аргументы, содержащие только ключевые слова, без захвата неограниченного числа позиционных аргументов?

Python позволяет это с несколько странным синтаксисом * -on-its-own:

 1
2
3
4
5
6
 
  def with_previous (iterable, *, fillvalue = None):
    "" "Выведите каждый повторяемый элемент вместе с элементом перед ним."" "
    предыдущий = значение заполнения
    для элемента в итерируемом:
        доходность предыдущая, позиция
        предыдущий = элемент
  

Эта функция принимает итеративный аргумент , который может быть указан позиционно (как первый аргумент) или по его имени, и аргумент fillvalue , который является аргументом только с ключевым словом. Это означает, что мы можем позвонить по номеру with_previous следующим образом:

 1
2
 
  >>> список (with_previous ([2, 1, 3], fillvalue = 0))
[(0, 2), (2, 1), (1, 3)]
  

А не так:

 1
2
3
4
 
  >>> список (with_previous ([2, 1, 3], 0))
Отслеживание (последний вызов последний):
  Файл "", строка 1, в 
TypeError: with_previous () принимает 1 позиционный аргумент, но дано 2
  

Эта функция принимает два аргумента, и один из них, fillvalue , должен быть указан как аргумент ключевого слова .

Обычно я использую аргументы, содержащие только ключевые слова, при захвате любого количества позиционных аргументов, но иногда я использую это * , чтобы заставить аргумент указываться только по его имени.

Встроенная функция Python sorted фактически использует этот подход. Если вы посмотрите справочную информацию о sorted , вы увидите следующее:

 1
2
3
4
5
6
7
8
 
  >>> справка (отсортировано)
Справка по встроенным функциям отсортирована во встроенных модулях:

отсортировано (итерируемый, /, *, ключ = Нет, обратный = Ложь)
    Вернуть новый список, содержащий все элементы из итерируемого в возрастающем порядке.Пользовательские ключевые функции могут быть предоставлены для настройки порядка сортировки, а
    Флаг обратного может быть установлен для запроса результата в порядке убывания.
  

В задокументированных аргументах для sorted есть * -on-its-own, прямо в задокументированных аргументах.

Звездочки в кортежной распаковке

Python 3 также добавил новый способ использования оператора * , который лишь частично связан с функциями * -when-defining-a-function и * -when-call-a-function выше.

Оператор * теперь также может использоваться при распаковке кортежей:

 1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
 
  >>> fruit = ['лимон', 'груша', 'арбуз', 'помидор']
>>> первое, второе, * оставшееся = фрукты
>>> осталось
['арбуз', 'помидор']
>>> во-первых, * остальные = фрукты
>>> осталось
["груша", "арбуз", "помидор"]
>>> первый, * средний, последний = фрукты
>>> средний
["груша", "арбуз"]
  

Если вам интересно, «где я могу использовать это в моем собственном коде», взгляните на примеры в моей статье о распаковке кортежей в Python.В этой статье я покажу, как такое использование оператора * может иногда использоваться как альтернатива нарезке последовательности.

Обычно, когда я обучаю * , я замечаю, что вы можете использовать только одно выражение * в одном вызове множественного присваивания. Это технически неверно, потому что можно использовать два во вложенной распаковке (я говорю о вложенной распаковке в моей статье о распаковке кортежей):

 1
2
3
4
5
6
 
  >>> fruit = ['лимон', 'груша', 'арбуз', 'помидор']
>>> ((first_letter, * Осталось), * other_fruits) = фрукты
>>> осталось
['e', 'm', 'o', 'n']
>>> other_fruits
["груша", "арбуз", "помидор"]
  

Я никогда не видел хорошего применения для этого, и я не думаю, что рекомендовал бы использовать его, даже если вы его нашли, потому что это кажется немного загадочным.

PEP, добавивший это в Python 3.0, — PEP 3132, и он не очень длинный.

Звездочки в литералах списка

Python 3.5 представил тонну новых функций, связанных с * , через PEP 448. Одна из самых больших новых функций — возможность использовать * для выгрузки итерируемого объекта в новый список.

Допустим, у вас есть функция, которая принимает любую последовательность и возвращает список с последовательностью и обратной последовательностью, соединенными вместе:

 1
2
 
  def palindromify (последовательность):
    список возврата (последовательность) + список (обратный (последовательность))
  

Этой функции необходимо несколько раз преобразовать элементы в списки, чтобы объединить списки и вернуть результат.В Python 3.5 мы можем вместо этого ввести:

 1
2
 
  def palindromify (последовательность):
    return [* последовательность, * обратная (последовательность)]
  

Этот код удаляет некоторые ненужные вызовы списков, поэтому наш код более эффективен и удобочитаем.

Вот еще один пример:

 1
2
 
  def rotate_first_item (последовательность):
    return [* последовательность [1:], последовательность [0]]
  

Эта функция возвращает новый список, в котором первый элемент в данном списке (или другой последовательности) перемещается в конец нового списка.

Использование оператора * — отличный способ объединить итерации разных типов вместе. Оператор * работает для любой итерации, тогда как использование оператора + работает только с определенными последовательностями, которые должны быть одного типа.

Это не ограничивается только созданием списков. Мы также можем сбрасывать итерации в новые кортежи или наборы:

 1
2
3
4
5
6
 
  >>> fruit = ['лимон', 'груша', 'арбуз', 'помидор']
>>> (* фрукты [1:], фрукты [0])
(«груша», «арбуз», «помидор», «лимон»)
>>> uppercase_fruits = (ф.верхний () для f во фруктах)
>>> {* фрукты, * прописные_фрукты}
{'лимон', 'арбуз', 'ТОМАТ', 'ЛИМОН', 'ГРУША', 'АРБУЗ', 'помидор', 'груша'}
  

Обратите внимание, что последняя строка выше берет список и генератор и выгружает их в новый набор. До этого использования * не было простого способа сделать это в одной строке кода. Раньше существовал способ сделать это, но его было нелегко вспомнить или обнаружить:

 1
2
 
  >>> set ().союз (фрукты, прописные_фрукты)
{'лимон', 'арбуз', 'ТОМАТ', 'ЛИМОН', 'ГРУША', 'АРБУЗ', 'помидор', 'груша'}
  

Двойные звездочки в словарных литералах

PEP 448 также расширил возможности ** , позволив использовать этот оператор для выгрузки пар ключ / значение из одного словаря в новый словарь:

 1
2
3
4
5
 
  >>> date_info = {'год': "2020", 'месяц': "01", 'день': "01"}
>>> track_info = {'artist': "Бетховен", 'title': 'Симфония № 5'}
>>> all_info = {** date_info, ** track_info}
>>> all_info
{'год': '2020', 'месяц': '01', 'день': '01', 'исполнитель': 'Бетховен', 'название': 'Симфония № 5'}
  

Я написал еще одну статью о том, что это теперь идиоматический способ объединения словарей в Python.

Это может быть использовано не только для слияния двух словарей вместе.

Например, мы можем скопировать словарь, добавив в него новое значение:

 1
2
3
4
 
  >>> date_info = {'год': '2020', 'месяц': '01', 'день': '7'}
>>> event_info = {** date_info, 'group': "Python Meetup"}
>>> event_info
{'year': '2020', 'month': '01', 'day': '7', 'group': 'Python Meetup'}
  

Или копирование / объединение словарей с заменой определенных значений:

 1
2
3
4
 
  >>> event_info = {'year': '2020', 'month': '01', 'day': '7', 'group': 'Python Meetup'}
>>> new_info = {** event_info, 'day': "14"}
>>> new_info
{'year': '2020', 'month': '01', 'day': '14', 'group': 'Python Meetup'}
  

Звездочки Python значительны

Операторы

Python * и ** — это не просто синтаксический сахар.Некоторые из вещей, которые они позволяют вам делать, могут быть достигнуты другими способами, но альтернативы * и ** имеют тенденцию быть более громоздкими и более ресурсозатратными. А некоторые из предоставляемых ими функций просто невозможно реализовать без них: например, невозможно принять любое количество позиционных аргументов функции без * .

Прочитав обо всех функциях * и ** , вам может быть интересно, как называются эти нечетные операторы.К сожалению, у них нет лаконичных имен. Я слышал, что * называется оператором «упаковки» и «распаковки». Я также слышал, что это называется «splat» (из мира Ruby), и я слышал, что это называется просто «звезда».

Я обычно называю эти операторы «звездой», «двойной звездой» или «звездой». Это не отличает их от их инфиксных родственников (умножение и возведение в степень), но контекст обычно делает очевидным, говорим ли мы о префиксных или инфиксных операторах.

Если вы не понимаете * и ** или беспокоитесь о том, чтобы запомнить все их варианты использования, не беспокойтесь! Эти операторы имеют множество применений, и запоминание конкретного использования каждого из них не так важно, как понимание того, когда вы сможете связаться с этими операторами.Я предлагаю использовать эту статью как шпаргалку или создать свою собственную шпаргалку, которая поможет вам использовать * и ** в Python.

Практика ведет к совершенству

Вы не учитесь, вкладывая информацию в свою голову, вы учитесь, пытаясь извлечь информацию из своей головы. Итак, вы только что прочитали статью о чем-то новом, но вы еще не узнали .

Я настоятельно рекомендую вам написать код, который вы используете сегодня различными способами * и ** , а затем проверить себя на различных способах использования этих операторов завтра.

Я хотел бы отправить вам упражнение, чтобы попрактиковаться с * и ** прямо сейчас. Если вы зарегистрируетесь в Python Morsels, используя приведенную ниже форму, я пришлю вам упражнение , в котором используются * и ** , сразу после того, как вы зарегистрируетесь .

FlyBase: Номенклатура — FlyBase Wiki


Преамбула

В приведенных ниже правилах номенклатуры объясняется, как FlyBase присваивает канонические символы и имена своим генетическим объектам (генам, аллелям, транспозонам, вставкам, аберрациям и балансирам).Мы призываем сообщество и журналы придерживаться утвержденных FlyBase символов / имен для единообразия публикуемых наборов данных. Хотя эти правила охватывают большинство обстоятельств, могут быть исключительные случаи, которые здесь четко не описаны. Пожалуйста, свяжитесь с FlyBase, чтобы обсудить такие случаи или любой другой аспект номенклатуры.

Политика создания символов и названий генов, одобренных FlyBase

Обоснование уникальных утвержденных символов / названий

Для исследовательского сообщества имеет большое значение наличие единого официально санкционированного (утвержденного) символа и названия для каждого гена в FlyBase.Использование уникальных символов / имен вместе с соответствующими уникальными идентификаторами (например, номерами FBgn) сводит к минимуму двусмысленность при упоминании этих генов в научной литературе.

Присвоение утвержденных символов / названий

Неизбежно появление нескольких синонимов гена в литературе, как правило, в результате публикаций об одном и том же гене в нескольких лабораториях или осознания того, что гены, ранее считавшиеся независимыми, на самом деле являются частью одной и той же генетической единицы.В таких случаях FlyBase придерживается следующих правил для установления или изменения утвержденного символа / названия гена.

1.2.1. Хронологический приоритет. Утвержденные символы / названия генов обычно устанавливаются на самую раннюю дату публикации предлагаемого символа / названия в рецензируемой первичной исследовательской работе. (Никакая другая форма публикации не имеет отношения к хронологическому приоритету.)

1.2.2. Выбор верхнего или нижнего регистра начальной буквы. Символы / имена генов начинаются с строчной буквы, если ген назван ПЕРВЫМ по фенотипу рецессивного мутантного аллеля, и начинаются с заглавной буквы, если они ПЕРВЫЕ названы по фенотипу доминантного мутантного аллеля.Символы / названия генов также начинаются с заглавной буквы, если они ПЕРВЫЕ названы в честь аспекта молекулярной функции дикого типа или активности генного продукта, который включает гены, названные в честь ортолога или паралога.

1.2.3. Использование сообщества. Правила хронологического приоритета и использования заглавных букв могут быть отменены в пользу альтернативного символа / названия гена, которые явно одобрены исследовательским сообществом. Это может быть на основе каждого гена или для рационализации номенклатуры для всего семейства генов или другой функциональной группы.

1.2.4. Заполнители. Определенные классы общих символов / имен генов являются заполнителями (см. Разделы 2.3.1 и 2.4) и подлежат замене более значимыми символами / именами в соответствии с правилами 1.2.1, 1.2.2 и 1.2.5. Однако общие символы / названия, основанные на фенотипе, должны быть сохранены FlyBase, если они повторно используются в первой рецензируемой исследовательской статье для характеристики этого гена и / или явно одобрены научным сообществом.

1.2.5. Критерии действительности. Предпочитаемые авторами символы / имена будут использоваться в качестве символов / названий генов, одобренных FlyBase, когда это возможно. Однако необходимо соблюдать критерии достоверности, изложенные в разделе 2.2, и FlyBase при необходимости изменит предпочтительные символы / названия генов авторами.

Генные символы и названия

Символы и названия

Символ гена обычно является сокращением полного имени гена и, как таковой, обычно должен состоять из минимального количества символов.В символе и названии гена должны использоваться сопоставимые заглавные буквы и наборы символов.

Требования к символам и названиям генов дрозофилы, одобренных FlyBase

2.2.1. Уникальность. Каждый одобренный символ и название гена должны быть уникальными среди всех одобренных FlyBase символов и названий.

2.2.2. Актуальность. Название должно указывать на функцию гена, мутантный фенотип или другую важную характеристику.

2.2.3. Запрещенные и недопустимые символы. В строке генотипа есть несколько символов, которые имеют определенное значение. Использование этих символов в символе гена усложнило бы интерпретацию генотипов. Таким образом, утвержденные символы генов должны соответствовать следующим правилам:

2.2.3.1. Утвержденные символы не должны содержать следующие символы: /, \, {,}, <,>, [,],;, *.

2.2.3.2. Утвержденные символы не должны содержать пробелов. Там, где разделитель необходим, чтобы символы не теряли смысл при совместном использовании, следует использовать дефис «-».

2.2.3.3. Утвержденные символы не должны содержать букв из каких-либо наборов символов, кроме английского или греческого языков.

2.2.3.4. Двоеточие «:» должно использоваться только в утвержденных символах определенных классов генов, не кодирующих белки, генов, кодируемых в митохондриальном геноме, и генов синтетического слияния.

2.2.3.5. Круглые скобки «()» должны использоваться только в определенных классах утвержденных символов генов в качестве разделителей для обозначения хромосомы или аллеля, фенотип которых изменен данным геном.

2.2.4. Использование заглавных букв. Правила, регулирующие использование заглавных букв в начальной букве символов / названий генов, описаны в разделах 1.2.2 и 1.2.3. Последующие буквы обычно пишутся строчными буквами.

2.2.5. Верхние и нижние индексы. Символы и имена генов обычно не должны содержать надстрочных или подстрочных индексов. Единственное исключение — когда имя аллеля является неотъемлемой частью символа или имени гена, например, su (w a ) .

2.2.6. Ссылка на геномное местоположение. Ссылка на координаты геномной последовательности гена (например, «Chr2L: 4.35M» или «3R: 415067») в его символе или названии запрещена. Упоминание цитологического местоположения гена (например, «36E» или «88B7») или хромосомного местоположения (например, «2» или «chr2L») в его символе или названии не приветствуется.

2.2.7. Префиксы рода / вида. Гены всех видов, кроме D. melanogaster , автоматически получают уникальный префикс аббревиатуры вида, добавленный к их утвержденному FlyBase символу (см. Раздел 2.5.1). Любое другое / дополнительное указание происхождения гена (например, D, Dro или Dm) является избыточным и / или неоднозначным и не является частью символа / названия гена, одобренного FlyBase.

2.2.8. Символы и названия не должны быть оскорбительными.

Общие префиксы

2.3.1. Префиксы на основе фенотипа, EST или STS. Несколько общих префиксов символов / названий генов использовались для генов, имеющих общий мутантный фенотип или первоначально идентифицированных на основании EST или STS.Ниже приведен неполный список:

Класс Префикс, используемый в символе гена *
анонимный ген анон-
Проект генома дрозофилы Беркли ЛУЧШЕЕ:
Экдизон-индуцированный ген Eig
Экдизон-индуцированный белок EIP
EST-кластерный ген EST:
усилитель e (a) m, E (a) m
European Drosophila Genome Project Ген на основе STS ESTS:
женский стерильный фс (н) м, фс (н) м
летальный л (н) м
мужская стерильность мс (н) м, мс (н) м
мужская и женская стерильность мфс (н) м, мфс (н) м
материнская мат (n) м, мат (n) м
мейотический мутант мэй-
Минут М (н) м
митотический мутант мит (н) м, мит (н) м
чувствительный к мутагену mus
NIDDK EST Ген на основе проекта ГНЕЗДО:
сопротивление рст (н) м, рст (н) м
подавитель вс (а) м, вс (а) м
«опухоль» ту (н) м, вт (н) м

* n обозначает хромосому, m отличительный символ и a ген, фенотип которого модифицирован энхансером или супрессором

Символы / имена генов, использующие эти общие префиксы, являются заполнителями и подлежат замене более значимыми символами / именами в соответствии с правилами, изложенными в разделах 1.2.1 и 1.2.4.

2.3.2. Приставки на основе общей молекулярной функции. Гены, кодирующие продукты сходной молекулярной функции, могут иметь символы / названия с идентичными префиксами и уникальными суффиксами. Это следует поощрять, и FlyBase рационализирует номенклатуру для всего семейства генов или других функциональных групп, если это будет одобрено исследовательским сообществом. Исторически уникальный суффикс может относиться к цитологическому положению гена (например, Act5C , Act42A , Act57B и т. Д.).В последнее время уникальный суффикс может быть просто возрастающим числовым значением (например, Sdic1 , Sdic2 , Sdic3 и т. Д.) Или отражать некоторые другие отличительные признаки, такие как ортология с набором справочных данных (например, RpL3 , RpL4 , RpL5 и т. Д.). Также см. Раздел 2.6.

ID аннотаций

ID аннотаций генов, которые отличаются от символов генов, существуют для всех молекулярно определенных генных моделей у 12 секвенированных видов Drosophila.

2.4.1. Формат. ID аннотаций представлены обычным образом: двухбуквенный префикс вида, за которым следует четырех- или пятизначное целое число. По историческим причинам существует два двухбуквенных префикса для D. melanogaster : CG для генов, кодирующих белок, и CR для генов, не кодирующих белок. Для всех других видов существует единый двухбуквенный код, который будет использоваться для генных моделей, независимо от того, какой класс гена они идентифицируют.

Префикс видов
CG, CR Drosophila melanogaster
GA Drosophila pseudoobscura pseudoobscura
ГД Drosophila simulans
GE Drosophila yakuba
ГФ Drosophila ananassae
ГГ Drosophila erecta
GH Drosophila grimshawi
GI Drosophila mojavensis
ГДж Drosophila virilis
ГК Drosophila willistoni
GL Drosophila persimilis
ГМ Drosophila sechellia

2.4.2. Используйте как утвержденные генные символы. При отсутствии другой информации идентификатор аннотации используется в качестве заполнителя для символа гена (в то время как поле имени гена остается пустым) и подлежит замене более значимым символом / именем в соответствии с правилами, изложенными в разделах 1.2.1, 1.2.2 и 1.2.4.

Гены некодирующих РНК

2.5.1. гены рРНК. Гены, кодирующие рибосомные РНК, имеют символы формата nSrRNA: X, где n обозначает скорость оседания соответствующей рРНК в единицах Сведберга, а X — идентификатор аннотации (который используется для различения идентичных копий гена).Например, 18SrRNA: CR41548 . Родовой ген также существует для каждого типа рРНК, в котором опущен отличительный суффикс, например, 18SrRNA . Исторически сложилось так, что локус, содержащий гены, кодирующие 5.8SrRNA, 18SrRNA и 28SrRNA, называется bobbed (bb) .

2.5.2. гены тРНК. Гены, кодирующие РНК переноса, имеют символы формата «тРНК: Xxx-YYY-N-N», где Xxx — трехбуквенный аминокислотный код; YYY — антикодон; и N-N — это двухзначный идентифицирующий суффикс — первая цифра одинакова для всех генов тРНК данного антикодона, имеющих идентичную последовательность, а вторая цифра увеличивается для каждой копии этой последовательности в геноме.(Эта номенклатура основана на номенклатуре GtRNAdb.) Например, тРНК : Ser-AGA-2-4 .

2.5.3. гены мяРНК. Гены, кодирующие малые ядерные РНК, имеют символы формата «мяРНК: XX: ma», где XX — тип мяРНК; m — положение гена на цитогенетической карте; а (если используется) — это строчная буква для различения функционально похожих генов мяРНК, отображаемых в одном и том же месте, например, мяРНК: U6: 96Aa .

2.5.4. гены мяРНК. Гены, кодирующие небольшие ядрышковые РНК, имеют символы формата snoRNA: X.X обычно представляет собой тип катализируемой модификации и / или субстрат, например snoRNA: Me18S-A934 , которая кодирует snoRNA, которая управляет метилированием нуклеотида A934 18S рРНК; или snoRNA: Ψ28S-612 , которая кодирует snoRNA, которая управляет псевдоуридилированием нуклеотида 612 28S рРНК. Если субстрат неизвестен, то в символе используется «Или», чтобы указать, что он кодирует «орфанную» мяРНК. Суффикс используется там, где необходимо различать функционально похожие гены snoRNA, например.g., мяРНК: Me18S-G1358b .

2.5.5. гены scaRNA. Гены, кодирующие малые РНК, специфичные для тельца Кахаля, имеют символы формата «scaRNA: X», где X представляет тип катализируемой модификации и субстрат. Например. scaRNA: MeU4-A65 кодирует scaRNA, который управляет метилированием нуклеотида A65 snRNA U4, а scaRNA: ΨU6-40 кодирует scaRNA, который направляет псевдоуридилирование нуклеотида 40 snRNA U6.

2.5.6. гены миРНК. Гены, кодирующие микроРНК, имеют символы формата «mir-N», где N — это просто порядковый номер в соответствии с соглашениями, изложенными в Ambros et. al. 2003 например, мир-125 .

2.5.7. Гены SRP, RNaseP и RNaseMRP РНК. Гены, кодирующие РНК 7SL частицы распознавания сигнала, РНК рибонуклеазы P и РНК MRP рибонуклеазы имеют символы формата «7SLRNA», «RNaseP: RNA» и «RNaseMRP: RNA» соответственно. Уникальный суффикс добавляется там, где необходимо различать копии генов.Например, 7SLRNA: CR32864 , RNaseP: RNA и RNaseMRP: RNA .

2.5.8. гены sncRNA. Гены, кодирующие небольшие некодирующие РНК (т.е. менее 200 нуклеотидов в длину), которые не могут быть классифицированы иным образом, имеют символы формата sncRNA: N, где N — уникальный идентификатор. например, sncRNA: 838 .

2.5.9. гены днРНК. Гены, кодирующие длинные некодирующие РНК (т.е. более 200 нуклеотидов в длину), имеют символы формата lncRNA: N, где N — уникальный идентификатор.например, днРНК: CR45187 .

2.5.10. гены asRNA. Гены, кодирующие длинные некодирующие РНК, которые являются антисмысловыми по отношению к мРНК, имеют символы формата «asRNA: N», где N — уникальный идентификатор. например, asRNA: CR31144 .

2.5.11. гены sbRNA. Гены, кодирующие РНК «стебель-выпуклость» (см. FBrf0241492), имеют символы формата «sbRNA: N», где N — уникальный идентификатор.

2.5.12. гены hpRNA. Гены, кодирующие шпильковые РНК (см. FBrf0227265), имеют символы формата «hpRNA: N», где N — уникальный идентификатор.например, hpRNA: 1 .

2.5.13. гены sisRNA. Гены, представляющие РНК со стабильной интронной последовательностью (см. FBrf0230034 и FBrf0235195), имеют символы формата sisRNA: N, где N — уникальный идентификатор. например, sisRNA: 1 .

Псевдогены

Псевдогены имеют символы формата symbol_of_parental_gene-psX , где X (если используется) — это число, позволяющее различать множественные копии псевдогена конкретного родительского гена. Если была обнаружена только одна псевдогенная копия определенного гена, ей следует дать суффикс -ps1 .

Митохондриальные гены

Гены, кодируемые митохондриальным геномом, имеют символы с префиксом «mt:», например, mt: ND4 .

Утвержденные символы / названия генов для отличных от D. melanogaster

генов

FlyBase включает гены всех видов Drosophilidae, а также гены других видов, которые были интродуцированы в Drosophila.

2.8.1. Приставки аббревиатуры видов. Для видов, отличных от Drosophila melanogaster , символ гена, одобренного FlyBase, следует за аббревиатурой вида, указывающей вид происхождения.Префикс имеет форму «Nnnn \», где N — начальная буква рода, а nnn — уникальный код для данного вида этого рода, обычно это первые три буквы названия вида. (Например, Dsim — это сокращение вида для Drosophila simulans .) Полный список допустимых сокращений доступен на странице сокращений видов. По соглашению, префикс «Dmel» не используется для символов гена D. melanogaster в FlyBase (если это не важно в контексте).Имена генов не имеют префикса с информацией о виде.

2.8.2. Утвержденные символы / названия генов. Одобренные FlyBase символы / названия генов могут соответствовать значимому символу / названию ортологов D. melanogaster , выделенных соответствующим префиксом вида (как описано в 2.5.1). (Следует отметить, что определение ортологии может быть проблематичным при отсутствии информации о последовательности всего генома.) D. melanogaster символы / названия гена, которые определены как заполнители (см. Разделы 2.3.1 и 2.4) или содержат цитологическую информацию, специфичную для D. melanogaster , не следует использовать в качестве символов / названий ортологов у других видов.

Аллельные символы и имена

Надстрочные знаки.

Аллели определенного гена обозначаются одним и тем же именем и символом и различаются разными надстрочными индексами. В письменном тексте обозначение аллеля может быть отделено от обозначения гена дефисом, например, бело-абрикосовый .

Символы.

Символы аллеля должны быть короткими, предпочтительно не более трех символов, и не могут содержать пробелов, надстрочных или подстрочных индексов. По возможности надстрочные символы должны быть ограничены следующим набором:

a-z A-Z 0-9 — +:.

Символ + зарезервирован для аллеля дикого типа. По возможности следует использовать последовательные номера аллелей.

Греческие символы могут использоваться, но это не рекомендуется.

Символ \ зарезервирован во всех контекстах символов генов для определения вида.

Символ / зарезервирован в качестве разделителя гомологов в генотипах и не может использоваться в символах аллелей.

В тексте, в котором нельзя использовать надстрочные символы, например в файлах ASCII, текст с надстрочными индексами следует заключать между символами [и].

FlyBase делает исключения из правила краткости при регистрации конструкций мутагенеза in vitro , которые представлены аллелями. Если они не имеют других названий, FlyBase присваивает символы в соответствии с системой, включающей начало фамилии первого автора первой статьи, в которой изначально был указан аллель («I» в следующих примерах).К наиболее часто используемым классам относятся:

Символ Значение
cIa для ‘построить имя автора-фамилии’
Scer \ UAS.cIa для ‘S. cerevisiae UAS построить имя автора-фамилии ‘
тиа для ‘transgene a автора-фамилии’
миа для ‘minigene a автора-фамилии’
час.ПИ для ‘конструкции теплового шока автора-фамилии’
gene_symbol.PI для ‘слияния промотора гена Автор-фамилия’

Кроме того, потребовались исключения для некоторых больших серий аллелей и наборов мутаций. Тем не менее, следует поощрять краткость символов аллелей.

3.2.1. Недопустимо использовать в качестве символа аллеля с надстрочным индексом элементы генотипа, в котором аллель возник, поскольку такое обозначение подразумевает нечто большее, чем тривиальную связь между аллелем и элементом.Исключением из этого правила являются аллели, которые являются ревертантами ранее существовавшего аллеля.

3.2.2. Хотя исторически цифра 1 была подразумеваемым надстрочным индексом для символов без надстрочного текста, такая практика создавала значительную двусмысленность и в настоящее время не приветствуется. Как и для всех других аллелей, цифра 1 должна быть явно обозначена (например, sc 1 , а не sc ).

3.2.3. Для рецессивного аллеля гена, названного доминантным, или доминантного аллеля гена, названного рецессивным, могут использоваться надстрочные индексы r и D соответственно; е.г., Hn r , Hn r2 и ci D .

3.2.4. Для аллеля дикого типа может использоваться надстрочный знак плюса; например, b + или B + . Один только символ плюс означает нормальный (дикого типа) аллель или аллели в любом контексте, например y 1 / +.

Может возникнуть необходимость различать более одного аллеля «дикого типа». В таких случаях различным аллелям дикого типа следует присвоить отличительный номер, который будет следовать за символом + в надстрочном индексе, e.г., ry +3 .

3.2.5. Отсутствие конкретного локуса можно неформально отметить с помощью символа минус в верхнем индексе; например, bb . Это неприемлемо в качестве обозначения конкретного аллеля .

3.2.6. Ревертанты или частичные ревертанты мутантных аллелей обозначаются надстрочным индексом rv, за которым следует отличительный номер; они помещаются после обозначения аллеля, e.г., D 4rv32 , 32 ревертант D 4 . Ревертанты доминантных мутаций, которые являются дефектами, рассматриваются не как аллели, а как дефекты и, соответственно, не имеют верхнего индекса, а перечислены с отличительным номером, например, Df (2L) Sco rv4 .

3.2.7. Аллели, указывающие на отсутствие конкретного фермента или другого белка, обозначаются надстрочным индексом n (ноль), за которым следует отличительный номер или буква, e.g., Adh n1 , или, если отсутствие функции невозможно, на l (летальный), за которым следует отличительный номер, например, Nrg l2 .

3.2.8. Аллель, который известен как мутантный, но специфическая идентичность которого неизвестна, помечен звездочкой в ​​качестве обозначения аллеля, например, w * .

Транспозоны и трансгенные конструкции

Транспозоны или трансгенные конструкции, интегрированные в геном дрозофилы, если они вызывают мутантный фенотип, являются как аллелями, так и аберрациями (подобными другим классам аберраций, которые связаны с мутантными фенотипами).Если такие вставки не вызывают мутантного фенотипа, они называются исключительно в соответствии с правилами аберрации. Если вставки транспозона / трансгена вызывают мутантный фенотип путем нарушения эндогенного гена, им дают названия как аллель мутировавшего эндогенного гена, так и аберрация. Название аллеля следует соглашениям, изложенным в разделе 2. Ниже приведены правила наименования природных транспозонов и трансгенных конструкций и их встраивания в геном.

Общие встречающиеся в природе транспозоны обозначаются как концов {} , где концов обозначает символ данного транспозона, например, P для P-элемента . Doc {} , copia {} и P {} являются примерами. Определенный естественный вариант семейства транспозонов может быть назван путем включения символа этого имени в скобки. Конкретная вставка данного транспозона описывается включением дополнительного уникального символа после скобок.

Вставки естественных транспозонов, аннотированные как признаки последовательности генома, также имеют синонимы формы TEnnnnn, например, copia {} 910 имеет синоним TE20021.

Символы для сконструированных транспозонов или трансгенных конструкций всегда должны включать символ конструкции, который определяет конкретную конструкцию.Генотип полной трансгенной конструкции состоит из источника концов транспозона, включенных генов, символа конструкции и идентификатора вставки в форме концов {гены = символ конструкции} . После определения концы {символ-конструкции} (или, менее формально, только символ конструкции ) можно использовать в большинстве случаев для обозначения конкретной трансгенной конструкции. Символ для -специфической вставки данной трансгенной конструкции имеет форму end {construct-symbol} идентификатор вставки .Более подробная информация представлена ​​в следующих разделах.

Некоторые примеры:

P {w + MC ovo D1-18 = ovoD1-18}

полный генотип конструкции трансгена P-элемента P {ovoD1-18}

P {ovoD1-18} 13X6

жизнеспособная вставка конструкции P {ovoD1-18}

P {Scer \ GAL4 wB> / sup> w + mW.hs Ecol \ ampR Ecol \ ori = GawB}

полный генотип трансгенной конструкции P {GawB}

P {GawB} h 1J3

вставка конструкции P {GawB}, которая разрушает ген h

H {w + mC Ecol \ ori Tn \ kanR Ecol \ lacZ HZ50a = Lw2}

полный генотип конструкции трансгена hobo H {Lw2}

H {Lw2} dpp 151H

вставка трансгенной конструкции H {Lw2}, которая разрушает ген dpp

Эта номенклатура формально аналогична номенклатуре, используемой для аберраций, где префикс конца {символ} аналогичен префиксу Df (n), Dp (п; м) и т. д., префиксы аберраций, а суффикс идентификатора аналогичен суффиксу ген-аллель аберраций со связанными аллелями или суффиксу буквенно-цифровой строки для других аберраций. Следуют особые правила сборки компонентов генотипа трансгенной конструкции.

Транспозон заканчивается.

Пары концевых повторов, которые вместе образуют транспозон, обозначены противоположными скобками, {}. Источник концов транспозонов указывается за скобками, на левом конце строки символом, производным от названия семейства транспозонов:

Концы транспозона Семейство транспозонов
п. = П-элемент
H = H-элемент (хобо)
I = I-элемент
M = морской элемент
Ми = Минос-элемент

4.1.1. Изолированные концевые повторы обозначаются символом семейства, за которым следует 3 ‘или 5’, например, P5 ‘представляет собой изолированный 5’-конец транспозона P {} .

4.1.2. Множественные наборы совпадающих концов транспозонов обозначаются вложением концов {} символов, например, P {I {neo [RT] W [+]}} . Конструкция трансгена P , содержащая ry + t7.2 и изолированный концевой повтор hobo с 5′-конца элемента hobo , будет описана как P {ry + t7.2 H5 ‘} .

Формально эту систему можно распространить на любую вставку мобильной ДНК, например, на элементы copia , gypsy и FB . Таким образом, мутация ct MR2 , вызванная вставкой элемента gypsy, называется gypsy {} ct MR2 . Когда мобильный элемент вставляется в мутантный ген, уже несущий мобильный элемент, именуется новая вставка. Например, вставка жокея в ct MR2 генерирует ct MRpD , это называется jockey {} ct MRpD .Название описывает новую вставку, которая вызвала новый фенотип. Полное описание генотипа, включая все наборы концов мобильных элементов, предоставляется только в том случае, если аллель-предшественник также полностью описан.

FlyBase использует эту номенклатуру не только из-за ее строгости, но также потому, что может потребоваться ее более общее использование, если такие элементы будут спроектированы.

Включенные гены.

В полном описании трансгенной конструкции в скобках перечислены все функциональные гены, включая гены, не относящиеся к дрозофиле, такие как гены устойчивости к антибиотикам, бактериальные и фаговые источники репликации, а также мишень рекомбинации FLP1 ( FRT ), разделенные пробелами.Порядок этих элементов слева направо отражает их порядок от 5 ‘до 3’ (относительно концов транспозона) внутри конструкции. Если порядок гена неизвестен, он помещается в один конец списка с запятой или перед ней.

4.2.1. Гены Drosophila melanogaster. Допустимые символы гена используются для наименования генов D. melanogaster . Аллели дикого типа интактных генов обозначаются верхним индексом «+ t», за которым следует идентификатор, например, ry + t7.2 или Adh + t3.2 . Удобный идентификатор (используемый в этих примерах) — это размер геномного фрагмента, несущего ген дикого типа. Генам, передаваемым через трансгенные конструкции, которые не передают функцию дикого типа, даются уникальные обозначения аллелей без предшествующего ‘+ t’, например, ftz B или y D225 . Замена промотора или других контрольных последовательностей может быть указана в обозначении аллеля: dpp hs.PP , например, для гена dpp , контролируемого промотором теплового шока.

4.2.2. Виды происхождения. Указан вид происхождения для генов, отличных от melanogaster Drosophila, присутствующих в трансгенных конструкциях. Код вида, состоящий из первой буквы рода (заглавной) и трехбуквенного кода, обычно первые три буквы вида (нижний регистр) добавляются к символу гена с разделительной обратной косой чертой, например, Dvir \ Dfd + t7.6 для деформированного гена дикого типа из Drosophila virilis (см.2.7.).

Для генов от видов, отличных от Drosophila, после четырехбуквенного символа используются допустимые генные символы, как указано выше, указывающие на вид происхождения, например, Hsap для человека, Gdom для курицы, Hsim , для Herpes simplex, Ecol для E. coli и т. Д. Для вирусов название или аббревиатура, например, Abelson , Adeno5 , Cmeg , или символическое имя, например, T4 , M13 , греческий символ лямбда, иногда используется вместо четырехбуквенного символа, производного от рода и вида.Во всех случаях эти символы отделяются от символа гена обратной косой чертой \. Файл с этими сокращениями доступен на FlyBase.

FlyBase считает, что мобильные элементы, митохондриальная ДНК и другие подобные объекты являются видами (потому что каждый может содержать несколько разных генов). По этой причине, например, P-элемент Transposase имеет в конструкциях символ P \ T.

4.2.3. Гены слияния. Гены слияния определяются (FlyBase) как слияние областей, кодирующих белок различных генов, созданных с помощью мутагенеза in vitro .Они названы с использованием символов генов их составных частей, разделенных двойным двоеточием, например, Antp :: Scr или Act88F :: Scer \ act1 .

Порядок символов генов, указанных в гене слияния, будет алфавитным. Сложность этих конструкций такова, что каждая из них должна быть названа в соответствии с ее молекулярным составом, например, в направлении от 5 ‘к 3’, количество названных генов слияния быстро станет непрактичным.

Исключение из правила «алфавитного порядка» будет сделано для случаев, когда слияние происходит между D.melanogaster и ген не melanogaster . В таких случаях первым будет указан символ гена melanogaster , например, tra2 :: Hsap \ SFRS2 .

По историческим причинам некоторые слияния промоторов с участием репортерных генов, такие как Ecol \ lacZ , хотя технически слияния белков, просто рассматриваются как аллели Ecol \ lacZ . Символ дополнительных генов, участвующих в слиянии, указывается как часть надстрочного индекса, например, Ecol \ lacZ P \ T.А92 . В этих особых случаях в названии гена не делается различия между слияниями промоторов и слияниями белков.

4.2.4. Модифицированные гены. Модифицированные гены, кДНК и in vitro. мутагенизированные последовательности рассматриваются как аллели и будут курироваться FlyBase как таковые. Поэтому их следует называть в соответствии с теми же соглашениями, что и классические аллели. Следующие символы аллелей были отнесены FlyBase к обычно используемым модифицированным генам D.melanogaster :


w + MC

Ген mini-white, сконструированный Пирроттой (1988) путем делеции фрагмента Hin dIII-Xba I из длинного 5′-интрона гена w + . Переносятся плазмидами Каспера и их производными.

Вт + мВт.ч

Ген mini-white, созданный Клеменцем и др. . (1987). Переносится семейством плазмид W6, W8 и их производных.


Гены, модифицированные добавлением тега, позволяющего идентифицировать, маркировать или очищать продукт, представляют собой особый класс модифицированных генов. Теги используются для маркировки транскрипта, например, с помощью фрагмента ДНК M13, позволяющего идентифицировать транскрипт с помощью гибридизации in situ . Теги также используются для маркировки белка в целях очистки (например, (His) 6 ), для целей идентификации (метки эпитопа) или для нацеливания на клеточный компартмент (метки nls).FlyBase рассматривает как теги конструкции, разработанные для этих целей, и курирует эти модифицированные гены как аллели помеченного гена. Помеченные гены имеют символы в формате T: y , где T обозначает тег, а y — это символ вида \ гена тега, например, T: Hsap \ Myc , T: Ivir \ HA1 , T: Hsap \ p53 , T: Zzzz \ His6 (префикс Zzzz «вид» используется, когда тег является искусственным).

Полный список символов помеченных генов и их определения доступен на FlyBase через QuickSearch.Измените параметр «Виды» с «Dmel» по умолчанию на «Все виды». Убедитесь, что для параметра «Поиск» выбрано значение «Идентификатор / символ / имя», а для параметра «Гены» выбрано значение «Класс данных». Введите «T: *» (не используйте кавычки) в поле «Введите текст» и отправьте запрос.

Построить символ.

Каждой конструкции должен быть присвоен символ, который в сочетании с описанием концевых повторов однозначно описывает трансгенную конструкцию, например, P {lacW} , H {PDelta2-3} .Символы должны быть уникальными, но должны быть как можно короче.

4.3.1. Полный генотип. В полном генотипе трансгенной конструкции символ конструкции — это последняя запись в фигурных скобках, отделенная от последнего символа гена знаком равенства, например, P {lacZ P \ TW w + mC ampR ori = lacW} — это полный генотип P {lacW} .

4.3.2. Краткая форма и частичные генотипы. После определения трансгенная конструкция может обозначаться либо символом трансгена, например, e.g., P {lacW} (или, менее формально, lacW ), или символ плюс идентификатор вставки (см. ниже) в большинстве контекстов. Дополнительные компоненты могут быть добавлены по мере необходимости для ясности. Например, в исходные генотипы предпочтительно включать видимые маркеры, как в P {w + mC = lacW} th j5C8 или P {w + t11.7 ry + t7.2 = wA} 3-1 , чтобы избежать неправильного понимания ожидаемых фенотипов мух.

Идентификатор вставки.

Крайняя правая позиция символа трансгена за пределами самой внешней скобки зарезервирована для строки, которая идентифицирует конкретную вставку в геном определенной конструкции. Есть четыре случая, которые следует учитывать при именовании вставок.

4.4.1. Вставка попадает в известный ген. Когда мутантный фенотип, связанный со вставкой трансгенной конструкции, назначается известному гену, индуцированный вставкой аллель должен быть назван в соответствии с обычными правилами. Поскольку такие вставки вызывают новые аллели, описание гена аллеля используется в качестве идентификатора связанной вставки (так же, как и с другими аллелями, идентифицированными как аберрации).Например, вставка P {lacW} , обозначенная как l (2) k05007 , а затем показанная как аллель CycE , становится P {lacW} CycE k05007 . Индуцированные вставкой аллели в исходных генотипах должны включать аберрационное название конструкции, то есть P {lacW} CycE k05007 . В большинстве других случаев префикс инсерционной аберрации можно опустить и на мутацию указать обычным образом, в данном случае CycE k05007 .

4.4.2. Вставка определяет новый ген. Часто вставки вызывают фенотип, который не может быть связан ни с одним известным геном. В этом случае вставка определяет первый аллель нового гена, который называется по обычным правилам, например, P {lacW} Trf 1 .

4.4.3. Картированная вставка без фенотипа. Если вставка не имеет фенотипа, но сопоставлена ​​с политенными хромосомами, то предпочтительно использовать подразделение политенной хромосомы, с которым она сопоставляется, в качестве идентификатора, т.е.г., P {bw + L} 60B . Если подобная конструкция уже имеет это имя, то новое будет P {bw + L} 60B-2 или подобное.

Если вставка не сопоставлена, нет другого выхода, кроме как присвоить вставке произвольный номер или код, например, P {A92} A45 . Этот символ должен быть уникальным и максимально простым с использованием только символов из набора:

а-я А-Я 0-9 —

символов конструкции FLPase.

Существует как минимум девять специфических вариантов белка S.cerevisiae FLP1 (‘FLPase’) рекомбиназа ( Scer \ FLP1 ), используемая в трансгенах в FlyBase (также см. Pfeiffer, 2014):

FLPase вариант AA изменение по сравнению с FLPG5 Первичная ссылка
FLPG5 Nern et al. , 2011 г.
FLPD5 G5D Nern et al. , 2011 г.
FLPm4 G5D, K82Y, V226A Hadjieconomou et al., 2011 г.
FLPm5 G5D, R281Y Hadjieconomou et al. , 2011 г.
FLPm6 G5D, A36T, T50A, K82Y, G109N, E150G, R281V Hadjieconomou et al. , 2011 г.
FLPm7 G5D, A36T, T50A, K82Y, G109N, T176A, R281V Hadjieconomou et al. , 2011 г.
FLPo P2S, G5D, L33S, Y108N, S294P Hong et al., 2009 Potter et al. , 2010 г.
FLPL G5D, F70L Pan et al. , 2012 г.
FLPL2 F70L Nern et al. , 2015

4.5.1. Общий формат. символов конструкции, содержащей FLPase, имеют формат: element_ends {Promoter-FLPVARIANT.identifier} .

4.5.2. Индикация варианта ФЛП. Если конкретный вариант FLPase известен / указан, это обозначается с помощью символов в таблице выше, e.грамм. P {HS-FLPG5} ; где он неизвестен / не указан, используется общий символ «FLP», например, P {Ubx-FLP} .

4.5.3. Дополнительный идентификатор. «Идентификатор» (например, тег или указание происхождения) может быть добавлен после символа FLPVARIANT и точки, особенно в случаях, когда необходимо различать в остальном похожие / идентичные конструктивные символы. Например. P {UAS-FLP.Exel} , P {ey-FLP.B} .

4.5.4. Исключения. Символы конструкции P {hsFLP} и P {70FLP} были сохранены из-за исторического и популярного использования в литературе.

Цитогенетические описания

Страница Карты содержит множество иллюстраций и электронных микрофотографий политенных хромосом дрозофилы, а также загружаемую электронную таблицу, которая включает в себя таблицу соответствия местоположений цитогенетических и генетических последовательностей, а также списки геномных координат, цитологическое положение (политенная полоса) и генетическая карта положение для всех аннотированных D.гены melanogaster. См. Также браузер Chromosome Maps.

Обозначения диапазонов.

Для местоположения отдельного объекта (точка прерывания аберрации, положение гена, сайт вставки транспозона и т. Д.) Диапазон задается как «(d1) (S1) (b1) — (d2) (S2) (b2)» , куда:

Номер диапазона
Символ Обозначение
г = нумерованных делений (от 1 до 102)
ю. = буквенное деление (от A до F)
б = (от 1 до n, в зависимости от конкретного подразделения)

Информацию о диапазонах, точность которых неизвестна, см. В параграфе 5.5.

Если диапазон охватывает два разных пронумерованных деления (, т.е. , d1 не равно d2), то будут использоваться полные обозначения как для левого, так и для правого конца диапазона, например, 32A3-33A2.

Если диапазон находится в пределах одного пронумерованного деления (т. Е. D1 = d2), но в пределах разных подразделов (, т. Е. , S1 не равно S2), то обозначение пронумерованного сегмента не повторяется справа от дефиса, например , 32А3-Д4.

Если диапазон находится в пределах одного и того же деления с одной нумерацией и одного и того же буквенного деления ( i.е. , d1S1 = d2S2), то ни разделение, ни обозначение подразделения не будут повторяться, например, 32A3-5.

Если местоположение известно одному диапазону, то местоположение будет указано как (d1) (S1) (b1) без дефиса и повторения местоположения диапазона, например, 32A3.

Если местоположение известно одиночному дуплету, то местоположение будет указано как (d1) (S1) (b1) — (b1 + 1), где (b1) и (b1 + 1) представляют две следующие друг за другом полосы дублет, например, 32A1-2.

Если только один конец диапазона местоположения находится в пределах дублета, местоположение будет просто относиться к номеру диапазона, максимизирующему диапазон, e.g., будет использоваться 32C1-D5, а не 32C1,2-D5 и 32B4-C2, а не 32B4-C1,2.

Иногда бывает необходимо представить межполосные каналы в данных, которые курирует FlyBase. Межполосные полосы имеют тот же символ, что и непосредственно предшествующие полосы, с суффиксом +. Таким образом, межполосный диапазон между полосами 3A4 и 3A5 Мостов представлен как 3A4 +.

Теломеры.

Теломеры обозначаются nAt, где n — номер хромосомы, A — плечо хромосомы, а t — теломер:

Символ Значение
1Лт = теломер левой руки X
1Rt = теломер правой руки X
YLt = теломер левой руки Y
г.р. = теломер короткого плеча Y
2 л. = теломер левой руки 2
2Rt = теломер правой руки 2
3 л. = теломер левой руки 3
3Rt = теломер правой руки 3
4 л. = теломер левой руки 4
4Rt = теломер правой руки 4
Если теломер неизвестного происхождения, используйте:
? Т = неопределенных теломер

Центромеры и центрический гетерохроматин.

Центромеры обозначаются как ncen, где n указывает хромосому, то есть , 1cen, Ycen, 2cen, 3cen и 4cen.

5.3.1. Центрические гетерохроматические блоки будут обозначены как hn, где n — порядковый номер.

Архитектура композитной хромосомы.

Обозначения хромосом, включая диапазоны политенных полос, гетерохроматические блоки и центромеры:

YLt h2 — h27 Ycen h28 — h35 YSt

1Lt 1A1 — 20F4 h36 — h42 1cen h43 — h44 1Rt

2Lt 21A1 — 40F7 h45 — h47 h48L 2cen h48R h49 — h56 41A1 — 60F5 2Rt

3Lt 61A1 — 80F9 h57 — h52 h53L 3cen h53R h54 — h58 81F1 — 100F5 3Rt

4Lt h59 — h61 4cen 101F1 — 102F8 4Rt


Обратите внимание, что центромеры хромосом 2 и 3 лежат внутри гетерохроматических полос h48 и h53 соответственно.Некоторые гетерохроматические полосы (h35, h52) в некоторых запасах делятся на две (h35A, h35B, h52A, h52B).

Точность цитологического описания.

При обозначении цитологической позиции степень точности определения должна отражаться в специфике утверждения.

Некоторые примеры должны прояснить эти различия. Обратите внимание, что описываемое здесь политенное подразделение 77B имеет 9 полос.

Случай 1 — Высокая степень неопределенности относительно местоположения подразделения:

Если наблюдатель думает, что местоположение точки останова при перегруппировке может быть в 77B, но также возможно в 77A или 77C, то положение должно быть указано как 77A-C.

Случай 2 — Низкий уровень неопределенности относительно местоположения подразделения:

Если лучшая оценка наблюдателя состоит в том, что истинное положение точки останова, скорее всего, находится в 77B, тогда наблюдатель должен сообщить положение как 77B.

Случай 3 — Нет сомнений в местонахождении подразделения:

Если наблюдатель абсолютно уверен, что местоположение находится в пределах 77B, то местоположение должно быть указано как 77B1-9.

Хромосомные аберрации

Хромосомные аберрации имеют имена, состоящие из префикса, указывающего класс аберрации, указание хромосомы или вовлеченных хромосом (или их плеч) в круглые скобки и специального обозначения, которое идентифицирует конкретную перестройку.

Общие принципы наименования аберраций.

6.1.1. Аберрации, не названные в честь гена: суффикс (, т.е. , компонент имени, следующий за скобками) должен включать только буквы и цифры. Не должно быть никаких надстрочных или подстрочных индексов, за исключением частных случаев синтетических инверсий с надстрочными индексами L и R (см. 6.4.4). Они не должны содержать пробелов. Символы (и) должны использоваться только для обозначения хромосомы или плеча хромосомы.

6.1.2. Аберрации, названные в честь гена, но не связанные с аллелем: здесь ассоциация с геном несет косвенную информацию о точках прерывания аберрации. Суффикс должен состоять из символа гена, за которым следует дефис, если это необходимо для ясности, после которого следует любое буквенно-цифровое значение по выбору исследователя. Верхних индексов быть не должно.

6.1.3. Если ген, символ которого появляется в аберрации, меняет свое имя, например, по причинам недавно открытого аллелизма, то это изменение имени распространяется на рассматриваемую аберрацию (ы).Старое имя станет синонимом.

6.1.4. Аберрации, названные в честь определенного ассоциированного аллеля: здесь суффикс должен быть точно таким же, как обозначение аллеля, , то есть — символ гена, за которым следует верхний индекс аллеля. Если обозначение аллеля (ген или часть аллеля) изменится, это изменение будет распространяться на аберрацию.

Транслокации.

6.2.1. Транслокации имеют символ T (n1; n2 …) m , где n1 , n2 … указывают номера хромосом, участвующих в транслокации.

Когда хромосомы перечислены в скобках символа транслокации, они перечислены в следующем порядке: 1 , Y , 2 , 3 , 4 . Номера разных хромосом разделяются точкой с запятой без пробелов.

6.2.2. Отделимые компоненты транслокаций.

Предыдущие соглашения для наименования таких анеуплоидных сегрегантов было трудно использовать и не содержали достаточной информации в производном названии, чтобы позволить автоматическое распознавание взаимосвязи между анеуплоидным сегрегантом и эуплоидным предшественником.

FlyBase будет использовать следующие соглашения для различных классов эуплоидных хромосомных аберраций и их анеуплоидных производных.

6.2.2.1. Транслокация сегрегантов. Транслокации, обычно называемые T (n1; n2) m , состоят из двух или более транслоцированных хромосом, каждая из которых потенциально может существовать как анеуплоидный сегрегант.Такие сегреганты будут названы с использованием теломер перестроенных хромосом в качестве ориентиров для определенных сегрегантов. Транслокации с двумя разрывами часто называют реципрокными транслокациями, если два сегмента хромосомы просто поменялись местами.

Общая форма названия сегреганта будет Ts (n1Pt; n2Qt) m . Ts означает ‘Translocation segregant’, n1Pt и n2Qt для обозначения знаковых теломер (например, 2Lt, 3Rt), а m — тот же суффикс, что и транслокация предшественника, из которой произошел сегрегант.

Пример 1: реципрокная транслокация с двумя разрывами. Нет двусмысленности в расположении любой точки останова относительно центромеры.

T (2; 3) rg35 (= T (2; 3) 27E-F; 62C2-D1)
Таким образом, два анеуплоидных сегреганта названы:

93 Ц (2Lt; 3Rt) rg35 (= 2Lt-27E | 62D1-3Rt)
Ts (2Rt; 3Lt) rg35 (= 2Rt-27F | 62C2-3Lt)

Пример 2: Реципрокная транслокация с тремя разрывами.Нет двусмысленности в расположении любой точки останова относительно центромеры.

T (1; 2; 3) OR9 (= T (1; 2; 3) 19-20; 49F; 81F)
Три анеуплоидных сегреганта соответственно названы:
Ts (1Lt; 3Lt) OR9 (= 1Lt-19 | 81F-3Lt)
Ц (1Рт; 2Рт) ОР9 (= 1Рт-20 | 49Ф-2Рт)
Ts (2Lt; 3Rt) OR9 (= 2Lt-49F | 81F-3Rt)

6.2.2.2. Сложные сегреганты и рекомбинанты. Для многих сложных транслокаций или инверсий с четырьмя или более точками разрыва потенциально могут возникать множественные анеуплоидные сегреганты или рекомбинанты. Невозможно изобрести схему наименования для этих сложных случаев, которая автоматически выявила бы конкретный набор анеуплоидных хромосом. В таких случаях получившимся анеуплоидам будут присвоены следующие соответствующие имена:

Первой дупликации или делеции присваивается уникальный суффикс родительской эуплоидной перегруппировки.Необходимо указать новый порядок полученной хромосомы.

Последующим дупликациям или удалениям присваиваются другие уникальные суффиксы. Также необходимо сообщить об их новых заказах.

Кольца.

Кольцевые хромосомы имеют символ R (n) m, где n указывает номер хромосомы, а m — конкретное обозначение.

Инверсии.

6.4.1. У инверсий есть символ In (nA) m , где n указывает номер задействованной хромосомы, A — задействованную руку или руки и m — конкретное обозначение.

В случае множественных разрывов внутрихромосомных перестроек различие между инверсиями и транспозициями часто становится неоднозначным. Внутрихромосомная перестройка, которая может быть разделена на дублированный и дефектный продукт путем обмена с хромосомой с нормальной последовательностью, обозначается как транспозиция, даже если она может нести инвертированный сегмент; в противном случае это обозначается как инверсия.

6.4.2. Если неизвестно, является ли инверсия парацентрической (без центромеры) или перицентрической (включая центромеру), тогда индикатор хромосомного плеча (-ей) опускается, i.е. , дюйм (н) м .

6.4.3. По соглашению, In (1) означает In (1L) .

6.4.4. Рекомбинантные продукты между двумя инверсиями. Рекомбинация между подобными инверсиями может давать жизнеспособные рекомбинантные инверсии с левым концом одного и правым концом другого. Верхние индексы L и R используются для обозначения источников двух концов; Например; In (2L) Cy L t R .

Транспозиции.

Среди межхромосомных перестроек термин транспозиция зарезервирован для того класса, в котором теломеры вовлеченных хромосом связаны (то есть образуют два конца одной молекулы ДНК), как в случае дикого типа. Перестройки, которые изменяют спаривание теломер, классифицируются как транслокации.

В случае множественных разрывов внутрихромосомных перестроек различие между инверсиями и транспозициями часто становится неоднозначным.Внутрихромосомная перестройка, которая может быть разделена на дублированный и дефектный продукт путем обмена с хромосомой с нормальной последовательностью, обозначается как транспозиция, даже если она может нести инвертированный сегмент; в противном случае это обозначается как инверсия.

6.5.1. Транспозиции имеют символ Tp (n1; n2) m , где n1 — «донорская» хромосома, n2 — «реципиентная» хромосома и m — конкретное обозначение. Для внутрихромосомных транспозиций n1 = n2 .

6.5.2. Разделимые компоненты транспозиций.

6.5.2.1. Межхромосомные транспозиции. Сегреганты межхромосомных транспозиций будут по-прежнему называться как в прошлом. Для транспозиции с именем Tp (n1; n2) m хромосомный сегрегант, содержащий дублированный материал, будет называться Dp (n1; n2) m , а хромосома, содержащая удаленный материал, будет названа Df (n1A ) m , где A относится к хромосомному плечу делеции.

Пример: Tp (3; 1) kar 5l (= Tp (3; 1) 87C7-D1; 88E2-3; 20)

Два анеуплоидных сегреганта:
Dp (3; 1) kar 5l (= 1Lt-20 | 87D1-88E2 | 20-1Rt)
Df (3R) kar 5l (= 3Lt-87C7 | 88E3-3Rt)

6.5.2.2. Внутрихромосомные транспозиции. Сегреганты здесь образуются путем рекомбинации со структурно нормальной хромосомой, а не путем сегрегации хромосом.Для транспозиций, в которых транспонированный сегмент находится в неинвертированной ориентации относительно стандартной карты, могут быть две потенциальные дупликации и две потенциальные делеционные производные (один набор является результатом событий рекомбинации в области между дефектным и дупликационным компонентами транспозиции, и один набор в результате событий рекомбинации в транспонированном сегменте). Для транспозиций типа Tp (n1; n1) m сообщаемый сегрегант дупликации будет называться Dp (n1; n1) m , и новый порядок должен быть сообщен, чтобы устранить любую двусмысленность.Точно так же указанный рекомбинант с делецией обозначается как Df (n1A) m , где A обозначает плечо хромосомы, несущее делецию. В редких случаях, когда также сообщается об альтернативном рекомбинанте с дупликацией или делецией (созданном путем рекомбинации в транспонированном сегменте), ему будет присвоен суффикс, отличный от транспозиции предшественника, и будет сообщен новый порядок.

Пример: Tp (3; 3) Dl, sup> II13 (= Tp (3; 3) 88F5-9; 91A3-8; 92A2)

Тогда первичными рекомбинантами анеуплоидов будут:
Dp (3; 3) Dl II13 (= 3Lt-92A2 | 88F9-91A3 | 92A2-3Rt)
Df (3R) Dl II13 (= 3Lt-88F5 | 91A8-3Rt)

Если впоследствии будет получен другой рекомбинант с делецией или дупликацией, ему будет присвоен новый суффикс, возможно, совершенно не связанный с прародитель, e.грамм.:

Df (3R) xxx (= 3Lt-91A3 | 92A2-3Rt)
Dp (3; 3) xxx (= 3Lt-88F5 | 91A8-92A2 | 88F5-3Rt)

Недостатки (делеции).

Дефекты (делеции) обозначены символом Df (nA) m , где n — номер удаленной хромосомы, A — плечо хромосомы и m — конкретный указатель.

Внутригенные делеции рассматриваются не как дефекты, а как аллели; по крайней мере два соседних локуса должны быть удалены или разрушены, прежде чем поражение будет считаться делецией.

Дубликаты.

Дупликации имеют символ Dp (n1; n2) m , где n1 — «донорская» хромосома, n2 — реципиент и m — конкретный указатель; n1 может равняться n2 .

Дупликации могут быть: тандемными (в прямом или обратном порядке), вставными или бесплатными. Прямые и перевернутые тандемные дубликаты по символам не различаются. Следует избегать двусмысленности путем явного описания нового порядка (см. Раздел 7.1 Новый заказ).

6.7.1. Когда дублированные последовательности переносятся как свободный центральный элемент, после точки с запятой в круглых скобках следует буква f (свободная), заменяя n2 ; например, Dp (1; f) 101 .

6.7.2. Повторяется высший порядок. Повторы более высокого порядка также обозначаются символом Dp , с количеством повторов, указанным в скобках хромосомного обозначения, то есть , Dp (1; 1) = дупликация, Dp (1; 1; 1) = трипликация , и так далее.

Y производные.

В прошлом многие производные Y-хромосомы (например, Y-хромосомы с маркировкой) назывались довольно особым образом, как m1Ym2 , где m1 — это маркер (или маркеры), переносимый на YL, а m2 — маркер (или маркеры). ) осуществляется Ю.С. Такие хромосомы следует называть дупликациями по обычным правилам. Таким образом, y + Y равно Dp (1; Y) y + , а Y mal + равно Dp (1; Y) mal + .

Автосинаптические элементы.

 Перицентрическая инверсия может быть преобразована в два реципрокных аутосинаптических элемента путем рекомбинации между инвертированным сегментом и нормальным гомологом. Для перицентрика типа  In (nLR) m  два аутосинаптических продукта - это  LS (n) m  и  DS (n) m , где  LS  относится к продукту, несущему два левых (L = levo) теломеры и  DS  к теломерам, несущим две правые (D = правые) теломеры. Хромосомные элементы, структура которых очень похожа на аутосинаптические, могут быть восстановлены другими способами; по соглашению они также называются автосинаптическими элементами, если при их восстановлении использовались автосинаптические элементы.

6.9.1. На складе автосинаптические элементы должны перевозиться сбалансированными парами; их символы затем разделяются двойной косой чертой, таким образом, LS (n) m1 // DS (n) m2 . В особом случае, когда два члена такой сбалансированной пары являются реципрокными рекомбинантными продуктами (например, LS (n) m1 // DS (n) m1 ), такой генотип можно назвать AS (n) m1 .

Составные хромосомы.

Составные хромосомы можно разделить на два класса: гомосоединения, состоящие из двух копий одного и того же хромосомного плеча, прикрепленного к общей центромере, и гетеросоединения, в которых два плеча от разных хромосом связаны через центромеру одного из них.Они обозначены символом C , за которым в скобках следует обозначение задействованного плеча или плеч хромосомы.

В исходных генотипах взаимосвязь сцепления маркеров на составных хромосомах обозначена двоеточием, например, C (4) RM-P2 , ci 1 ey R : gvl 1 Св н .

6.10.1. Гомосоединения. Гомосоставные хромосомы классифицируются в соответствии с относительной ориентацией их плеч ( i.е. , тандемный, перевернутый или кольцевой) и положение их центромер (, т. Е. , акроцентрический или метацентрический): обратные акроцентрики ( C (n) RA ), обратные метацентрики ( C (n) RM ), обращенные кольца ( C (n) RR ), тандемные акроцентрики ( C (n) TA ), тандемные метацентрики ( C (n) TM ) и тандемные кольца ( C (n) TR ), где n — номер хромосомы или хромосомного плеча. В каждом случае за символом следует определенное обозначение, разделенное дефисом.

6.10.1.1. Когда составные части плеч отличаются в последовательности чем-то, кроме инверсии всего плеча, тандемная или обратная классификация становится неоднозначной. Кроме того, когда составляющие ветви отделяются друг от друга одним перерывом, термины акроцентрический и метацентрический являются описательными; однако, когда элементы двух плеч становятся перемежающимися (например, при перегруппировке рук), эти термины теряют смысл. Следовательно, более сложные соединения обозначаются произвольными символами.

Гетеросоединения.

Гетеросоставные хромосомы имеют символ C , за которым следует хромосома или плечи, указанные в скобках, например, C (1; Y) , C (2L; 3R) . Хромосомное происхождение центромеры в таких соединениях часто неоднозначно. Обычно необходимо более подробно описать структуру любого данного гетеросоединения в его новом порядке. Различие между некоторыми гетеросоставными хромосомами и транслокациями целого плеча может быть спорным.

Свободные хромосомные плечи.

Термин «свободный» используется по отношению к левому и правому плечам основных аутосом, а также к длинным и коротким плечам Y-хромосомы, когда плечо существует как отдельный элемент хромосомы. Обозначение свободного плеча: F (nA) m , где n = Y, 2 или 3, A = L, R или S и m — это символ (обратите внимание, что L означает Осталось для X-хромосомы и аутосом, но Long для Y-хромосомы).На практике все свободные плечи несут некоторый хромосомный материал из другого плеча или элемента хромосомы.

Сложные перестановки.

Иногда автор должен сообщить об аберрации, цитология которой либо неоднозначна, либо не может (при существующих знаниях) быть описана в рамках одного из обычных классов аберраций. Эти аберрации должны быть названы в соответствии с форматом Ab (N1; N2; ..), идентификатором или, когда они связаны с названным аллелем, Ab (N) geneallele . Ab обозначает аберрацию, N обозначает хромосому (-ы) или хромосомное плечо (-и), которые, как известно, вовлечены.Если один или несколько из них не могут быть идентифицированы, тогда a? используется символ. Если один разрыв является гетерохроматическим, но дальнейшая идентификация невозможна, используется h. Примеры: [http: /flybase.org/reports/FBab0023380.html Ab (3R) faf BX9 ] и Ab (3L; h) ME178 .

Префикс Ab доступен только в крайнем случае и не должен использоваться без уважительной причины. Если появится дополнительная информация, позволяющая дать более формальное описание сложной аберрации, тогда символ Ab следует заменить и отнести к синонимии.

Комбинации перестановок.

Элементарные категории хромосомных аберраций не исключают друг друга, и некоторые аберрации объединяют несколько из них. В таких случаях используемый символ должен быть наиболее подходящим для ожидаемого значения аберрации, например, Df для недостаточной транслокации, которая была сгенерирована при скрининге на дефекты. При отсутствии предпочтений используется символ, занимающий наивысшее место в следующем рейтинге: T > межхромосомный Tp > R > In > внутрихромосомный Tp > Dp > Df .Это особенно верно, когда компоненты неразделимы.

FlyBase использует следующие словесные определения для классов аберраций с тремя перерывами:

Недостаточная транслокация

Транслокация, при которой один из четырех сломанных концов теряет сегмент перед повторным соединением, например, T (1; 3) ct 268-21 .

Инверсия-транслокация

Первые два разрыва находятся в одной хромосоме, и область между ними воссоединяется в перевернутом порядке с другой стороной первого разрыва, так что обе стороны одного разрыва присутствуют на одной хромосоме.Оставшиеся свободные концы соединяются в результате транслокации с концами, полученными в результате третьего разрыва, например, T (1; 2) C324 .

Двустороннее дублирование

(большая) область между первыми двумя перечисленными разрывами теряется, и два фланкирующих сегмента (один из них центральный) присоединяются в результате перемещения к свободным концам в результате третьего разрыва, например, Dp (1; 2 ) К1 .

Циклическая транслокация

Три разрыва в трех разных хромосомах.Центрический сегмент, полученный в результате первого перечисленного разрыва, присоединяется к ацентрическому сегменту, полученному в результате второго, а не третьего, например, T (1; 2; 3) OR14 .

Двудольная инверсия

Три разрыва в одной хромосоме; оба центральных сегмента перевернуты ( т.е. , они не транспонированы), например, In (3LR) BTD7 .

Неинвертированная инсерционная дупликация

Копия сегмента между первыми двумя перечисленными разрывами вставляется в третий разрыв; вставка имеет цитологически ту же ориентацию, что и ее фланкирующие сегменты, т.е.г., Dp (1; 1) hdp-b2 .

Неинвертированная инсерционная транспозиция

Сегмент между первыми двумя перечисленными разрывами удаляется и вставляется в третий разрыв; вставка имеет цитологически ту же ориентацию, что и ее фланкирующие сегменты, например, Tp (1; 1) B 263-48 .

Инвертированная инсерционная дупликация

Копия сегмента между первыми двумя перечисленными разрывами вставляется в третий разрыв; вставка имеет цитологически инвертированную ориентацию по отношению к ее фланкирующим сегментам, т.е.г., Dp (1; 1) y bl .

Перевернутая инсерционная транспозиция

Сегмент между первыми двумя перечисленными разрывами удаляется и вставляется в третий разрыв; вставка имеет цитологически инвертированную ориентацию по отношению к ее фланкирующим сегментам, например, In (2R) C72 ‘ ‘.

Неориентированная инсерционная дупликация

Копия сегмента между первыми двумя перечисленными разрывами вставляется в третий разрыв; ориентация вставки относительно ее фланкирующих сегментов не записывается, например.г., Dp (1; 1) hdp-b4 .

Неориентированная инсерционная транспозиция

Сегмент между первыми двумя перечисленными разрывами удаляется и вставляется в третий разрыв; ориентация вставки относительно ее фланкирующих сегментов не записывается, например, Tp (1; 2) v + 75d .

6.14.1. Сложная перестройка может быть генетически разделена на более простые составляющие аберрации, которые обычно достаточно обозначены отличительным символом исходной аберрации.Однако, когда оригинал назван в честь фенотипа, связанного с одной из компонентных аберраций, обозначение другого компонента символом мутанта неуместно.

6.14.2. Перестройке, наложенной на другую перегруппировку, можно дать имя, которое чаще всего относится ко всему комплексу, поскольку вновь индуцированная аберрация, вероятно, неотделима от исходной; например, In (2LR) SM1 — это большая перицентрическая инверсия, наложенная на In (2L) Cy In (2R) Cy .

Балансиры

Балансировщики можно описать одним из трех способов: полным генотипом, коротким генотипом или одним символом. Для целей FlyBase для каждого варианта балансира необходим один символ. Если символ не указан для нового варианта балансира, FlyBase присвоит его.

Символы балансира должны быть краткими, не содержать пробелов и содержать символы из следующего набора:

a-z A-Z 0-9: — () {}

Отмеченные варианты классических балансировщиков должны быть названы, начиная с символа родительского варианта, за которым следует дефис, за которым следует краткая отличительная строка, e.г., TM3-DZ .

В тех случаях, когда в литературе сообщается о новых вариантах балансира, FlyBase использует символ авторов для варианта, если таковой имеется. Запятые, используемые авторами в публикациях, могут быть преобразованы FlyBase в дефисы для целей использования строки, подобной генотипу, которая почти квалифицируется как символ. Аналогичным образом, когда авторы используют [] для обозначения пределов вставки элемента, они преобразуются в {} с помощью FlyBase, чтобы поддерживать согласованность с другими разделами базы данных.Не рекомендуется использовать недопустимые символы генов и символы конструкции / вставки полных мобильных элементов в символах балансира.

В качестве альтернативы краткому символу балансира о балансировщиках можно сообщать с использованием коротких генотипов балансира, которые объединяют символ классического балансира с новыми символами аллеля, аберрации или вставки трансгена для определения уникального варианта балансира, например, TM3 , ry RK SB 1 (= TM3-vKa ).

Балансировщики, конечно, также могут быть зарегистрированы с использованием полного генотипа балансира, который перечисляет все аберрации, аллели и символы вставки, которые составляют уникальный вариант балансира.

Любой вариант, описанный в литературе или переданный в фондовый центр, но не имеющий символа авторами, получает символ ‘parental_variant-vIa’ и имя ‘parent_variant-option a of Initial (первой фамилии автора)’ FlyBase, например, TM3-vKa для TM3-вариант a Каресса .

Цитологическое описание аберраций

Для всех хромосомных аберраций, кроме простейших двух разрывов, необходимо подробное описание нового порядка хромосом (см. Параграф 4.5).

В описаниях аберраций цитологические контрольные точки аберрации перечислены после символа, различные элементы хромосомной информации разделяются точкой с запятой без пробелов. Цитологические описания новых заказов всегда пишутся римским шрифтом.

Новый заказ.

Должны быть приняты следующие соглашения для определения последовательностей аберраций. Последовательность каждой хромосомы, участвующей в аберрации, указывается от одного конца до другого в соответствии с терминологией полос хромосом слюнных желез. Точки разрыва и воссоединения обозначены вертикальными полосами, а сегменты между этими точками обозначены самой крайней полосой, которая, как известно, присутствует на каждом конце, и разделена тире. Таким образом, новый порядок

Tp (2; 3) P (= Tp (2; 3) 58E3-F2; 60D12-E2; 96B5-C1)

представляется как
2Lt-58E3 | 60E2-2Rt; 3Lt-96B5 | 60D12-58F2 | 96C1-3Rt.

Неопределенности.

Если бы порядок вставленного сегмента 60D12-58F2 не был известен, этот сегмент был бы заключен в круглые скобки; т.е. 3Lt-96B5 | (58F2-60D14) | 96C1-3Rt.

Иерархия неоднозначностей представлена ​​круглыми скобками в скобках.

Сложные перестановки.

Разрывы повторно соединяются циклически, вызывая хромосомные аберрации (например, A с B и B с A), и несколько разрывов могут воссоединяться в одном или нескольких циклах.Таким образом, четыре разрыва могут взаимодействовать с образованием одной перегруппировки с четырьмя разрывами или двух перегруппировок с двумя разрывами. Сложная перегруппировка, состоящая из двух или более простых циклических перегруппировок, указана в описательном символе; например

T (1; 2) OR72 (= T (1; 2) 19E; 29F + In (2LR) 24F; 54B) или T (1; 2) C314 (= T (1; 2) 5D; 40-41 + T (1; 2) 9D; 51D + T (1; 2) 20; 56F)

Новые символы требуются, если любой из этих компонентов (или любая новая комбинация этих компонентов) должны были быть получены отдельно.

Порядок описания.

Информация о новом порядке записывается следующим образом: каждый хромосомный элемент начинается на свободном конце с более низким значением, и элементы перечислены в порядке возрастания, Y попадая между 20 и 21.

Кольца.

Кольца отличаются от палочковидных хромосом вертикальными полосами в начале и конце элемента; кружок разорван для линейного обозначения в точке излома с наименьшим числовым значением; е.г., | 1A4-20 1cen 20F-20A1 | для R (1) 2.

Новые заявки на

Y производных.

Состав фрагмента Y можно определить, перечислив его генетические элементы в порядке, указанном в скобках, с любыми неоднозначностями в порядке, например, KL (bw + —ba + ) Ycen bb + КС . Когда имеется иерархия неоднозначностей по порядку, используется иерархия скобок, как в ((ci + —spa + ) KL) Ycen bb + KS .

Наименование генотипов

Сепараторы генные.

При обозначении генотипов с несколькими мутантными генами символы аллелей генов на одной и той же хромосоме разделяются пробелами (например, y 1 w 1 f 1 B 1 ) .

Разделители гомологов.

Символы аллелей генов на гомологичных хромосомах разделены косой чертой (например, y 1 w 1 f 1 / B 1 ).Хромосомы X и Y считаются гомологами для этой цели, и различные генотипы мужчин и женщин обычно не указываются явно. Например, Dp (1; Ybb-) B S / y 1 car 1 описывает популяцию, в которой самки гомозиготны по хромосоме y 1 car 1 X , а самцы гемизиготны по хромосоме y 1 car 1 и хромосоме B S с меткой Y .При желании можно полностью описать несколько генотипов в запасе, используя амперсанд (&) для разделения генотипов, например, y 1 car 1 & Dp (1; Ybb-) B S / y 1 вагон 1 .

Принято перечислять символы аллелей только один раз для генотипа, гомозиготного по всем мутациям на конкретной хромосоме, то есть y 1 w 1 f 1 подразумевает y 1 w 1 f 1 / y 1 w 1 f 1 .Если, однако, любая из этих мутаций должна быть гетерозиготной, то будут даны мутантные генотипы каждой хромосомы, то есть y 1 w 1 f 1 / y 1 f 1 .

Принято писать генотипы с материнскими хромосомами, предшествующими отцовским. Например, при скрещивании cn 1 / cn 1 самок с cn + / cn + генотип потомства будет записан cn 1 / cn + ; от обратного креста будет написано cn + / cn 1 .

Разделители негомологов.

Символы аллелей генов на негомологичных хромосомах разделяются точкой с запятой и пробелами (например, bw 1 ; e s ; ey 1 ).

Описание хромосом.

8.4.1. При описании хромосомы часто желательно включение нескольких типов информации; например, расположение и содержание мутантных аллелей. Такие категории разделяются запятой, за которой следует пробел; например, In (1) FM7 , y 31d w a v Of B 1 , что обозначает хромосому X , несущую инверсию FM7 аллели yellow-31d , white-abricot и vermillion-of-Offermann , а также доминантный аллель Bar-1 . Аллели перечислены в порядке стандартной генетической карты независимо от их порядка на рассматриваемой хромосоме.

8.4.2. Описание генного содержимого аутосинаптических элементов требует определенных правил. Отображение мутаций, удаленных от точки останова, указывается после запятой, следующей за именем самого элемента; мутации, отображаемые проксимальнее точки разрыва (, т.е. в гетеросинаптической области и обязательно гемизиготные), указываются после второй запятой; Например, LS (2) m , b 1 , cn 1 будет гомозиготным по b 1 , но гемизиготным по cn 1 .Если статус конкретной мутации неизвестен, ее символ заключен в ().

8.4.3. Мутантные аллели различных хромосомных компонентов транслокаций или межхромосомных транспозиций разделены двоеточием. Перемещенные хромосомы отделены от своих гомологов косой чертой. Например: T (2; 3) CyO-TM2 , Cy 1 l (2) DTS513 1 : Ubx 130 / S 1 .

В отличие от прошлой практики, символ + не должен использоваться для обозначения наличия более одной разделяемой аберрации на одной и той же хромосоме, т.е. , In (2L) Cy In (2R) Cy используется , а не In (2L + 2R) Cy или In (2L) Cy + In (2R) Cy .

Крест описания.

Существует соглашение, что при описании генетических скрещиваний женский генотип пишется слева от символа , умноженного на (x), а мужской генотип — справа.

Неопределенность.

Неопределенность конкретных аллелей, генов и аберраций все обозначены в генотипах звездочкой, например, w * для мутантного аллеля w , когда конкретный аллель неизвестен, l (2) * для летальный аллель на второй хромосоме, когда ген неизвестен, и C (1) * для хромосомы соединения X , когда природа прикрепления неизвестна.

Никнеймы.

В относительно небольшом числе случаев FlyBase поддерживает альтернативный символ для компонента генотипа — псевдоним.Псевдонимы поддерживаются, когда упрощенный символ уже используется рабочими Drosophila и понимается более широко, чем строгий действительный символ. Например, Dp (2; 2) Cam11 является допустимым псевдонимом для In (2LR) TE35B-226 L TE35B-4 R и w 67c23 является допустимым псевдонимом для Df ( 1) w67c23 . Внедрение псевдонимов в FlyBase все еще продолжается, и различие между псевдонимами и синонимами может не быть очевидным в отчетах FlyBase.

Цитотип

Может оказаться необходимым указать цитотип запаса по отношению к одной или нескольким системам гибридного дисгенеза. Мы предлагаем сделать это, добавив указание цитотипа в конец описания акции в виде однобуквенного кода, заключенного в <>. Этот символ должен быть разделен запятой перед последним компонентом генотипа, например, y 1 w 1 f 1 , < P > будет указывать на запас P-цитотипа с этими тремя маркерами.Если необходимо обозначить более одного цитотипа, их следует разделить точкой с запятой, например, < P; I >.

Отображение названий и символов генов, аллелей и аберраций в тексте

Курсив

Названия и символы генов, аллелей, аберраций и транспозонов / трансгенных конструкций выделены курсивом в печатном тексте.

Не курсив.

Если для обозначения фенотипа используется полное название гена или символ гена, а не генотип, то это имя или символ печатаются римским шрифтом (не курсивом); я.е., белый указывает на генотип, а белый — на фенотип.

Верхние и нижние индексы.

В тексте ASCII символы [и] используются для заключения надстрочных знаков, а [[и]] используются для заключения подстрочных индексов.

Цитогенетические термины.

Цитогенетические обозначения не выделяются курсивом, за исключением тех случаев, когда они являются частью символа аберрации.

Зарезервированные символы.

Следующие символы зарезервированы для специального использования в именах и символах генов, аллелей и аберраций или в генотипах:

Символ Использование
\ зарезервировано для использования в символах генов других видов, кроме D.меланогастр
/ зарезервировано для использования в качестве разделителя гомологов в исходных генотипах.
{} зарезервировано для использования в символах транспозонов и трансгенных конструкций.
<> зарезервировано для использования в названиях трансгенных конструкций и для обозначения цитотипов в запасах.
[] зарезервировано для обозначения надстрочных индексов в тексте ASCII
[[]] зарезервировано для обозначения индексов в тексте ASCII
() зарезервировано для использования в названиях и символах составных генов (например,g., l (1)) и для обозначения аберраций, а также для указания неоднозначных генотипов.
; зарезервирован как разделитель номеров хромосом (хромосомных плеч) в именах и символах аберраций, а также для разделения маркеров или аберраций на негомологичных хромосомах в исходных генотипах
: зарезервировано для использования в символах определенных классов, т. Е. Трансгенных конструкций, генов, кодирующих особые РНК (тРНК, мяРНК), генов слияния и митохондриальных генов, и, в исходных генотипах, для обозначения ассоциации между маркерами на реципрокных компонентах транслокаций, или плечи составных хромосом.

Отображение продуктов генов в тексте

Белки.

Названия и символы протеиновых продуктов , а не должны быть выделены курсивом в печатном тексте. По возможности, белки, названные в честь гена, следует дополнительно различать, используя заглавную букву символа или названия гена. Например, белковый продукт (продукты) гена hh ( hedgehog ) можно правильно обозначить как Hh или Hedgehog; белковый продукт (продукты) гена RpL38 ( рибосомный белок L38 ) может быть правильно обозначен как RpL38 или рибосомный белок L38; и белковые продукты гена AGO1 ( Argonaute-1 ) могут быть правильно обозначены как AGO1 или Argonaute-1.

Не существует фиксированных правил для обозначения белков, не названных по имени гена.

РНК.

Не существует соглашения для символического обозначения родовых РНК-продуктов генов в тексте.

Запись обновлений.

Существенные изменения, внесенные в этот документ с момента его презентации на встрече с дрозофилами в Атланте в апреле 1995 г., указаны ниже. (Эти изменения уже включены в приведенные выше руководящие принципы и отмечены здесь просто для исторической записи.)

Версия 2.01, 25 апреля 1995 г .: Правила присвоения имен гибридным генам (параграф 3.2.3) были изменены.

Версия 2.02, 13 мая 1995 г .: Добавлен новый параграф (7.7) о наименовании неоднозначных генотипов.

Версия 2.06, 22 ноября 1995 г .: В примеры названий транспозонов внесены исправления, чтобы они соответствовали текущей практике FlyBase. Список «почетных генов» обновлен.

Версия 3.0, 18 марта 1996 г .: символ сложных аберраций изменен с комплекс на Ab .Размещение символов <>, указывающих ориентацию FRT, было изменено в соответствии с текущим использованием. Ободочная кишка вводится как разделитель маркеров на реципрокных компонентах транслокаций и плеч составных хромосом, чтобы прояснить отношения и ожидаемое поведение этих элементов в запасах. Список «почетных генов» обновлен. Добавлено оглавление. В документ внесены небольшие изменения.

Версия 3.01, 29 марта 1996 г .: Правила присвоения имен генам, идентифицированным проектами секвенирования, были изменены, и были добавлены новые сайты-зеркала FlyBase.

Версия 3.02, 7 августа 1996 г., исправляет объяснение <и>, используемых для обозначения ориентации FRT. Список «почетных генов» был удален.

Версия 3.03 от 21 августа 1996 г. разъясняет, что представляет собой символ транспозона.

Версия 4.0, 19 февраля 1997 г., включает обозначение конструкций мутагенеза in vitro ( Раздел 2.2. ) и балансиры ( п. 5.14. ).

Версия 4.1, 3 июня 1997 г., включает модификацию правил для наименования вставок множественных транспозонов (, раздел 3.1.2. ), разъяснение правил для представления белков в тексте (, раздел 11.1. ) и предложение для наименование генов, кодирующих рибосомные белки ( Приложение A. ).

Версия 4.2, 8 марта 1998 г., включает измененные правила наименования генов, идентифицированных только проектами геномного секвенирования ( Раздел 1.1.3 ).

Версия 4.3, 21 мая 1998 г., включает незначительные изменения во введении и формате документа.

Версия 4.4, 9 февраля 1999 г., включает изменение в Раздел 5.13 . поддержка идентификации неизвестной точки останова как гетерохроматической.

Версия 5.0, 6 июля 1999 г., все ссылки на «почетные гены» были удалены (эта категория больше не используется FlyBase) и добавлено описание псевдонимов ( Раздел 7.7. ).

Версия 5.01, 23 августа 1999 г., внесены незначительные исправления.

Версия 6.0, 23 ноября 1999 г., обновляет раздел 9.1. . , чтобы включить новую политику FlyBase в отношении использования последовательностей для определения приоритета имен и символов генов. Было добавлено много ссылок и внесены различные исправления.

Версия 6.1, 27 декабря 1999 г., обновляет раздел 1.1.3 . , чтобы включить гены, идентифицированные Celera.

Версия 6.2, 5 апреля 2000 г., обновляет раздел 1 .1.3. с производными префиксов анонимных генных символов.

Версия 6.3, 12 мая 2000 г., обновляет Раздел 2.2. , чтобы уточнить действующие правила для символов аллелей.

Версия 7, 28 августа 2000 г., обновляет Раздел 11.2. , что исключает соглашение (которое никогда не принималось дрозофилами), согласно которому продукты генов РНК обозначаются в тексте символом гена, набранным заглавными буквами курсивом.

Версия 7.1, 18 апреля 2001 г., обновляет раздел 1 .1.3. , чтобы указать авторам на необходимость предоставления символа гена CG при переименовании гена с именем CG.

Версия 7.2, 24 апреля 2001 г., обновление , раздел 1.1.3. , чтобы уточнить текущее присвоение имен CG.

Версия 8.0, 1 августа 2001 г., обновления разделов 1.1. для уточнения правила «один ген: один действительный символ», 1.1.1. , чтобы прояснить случай некоторых символов генов, и 5.15. , чтобы разъяснить различные способы описания балансировщиков.

Версия 8.1, 28 августа 2001 г., обновляет раздел 5.13 . изменить ‘h?’ до ‘h’ как символа неопределенных гетерохроматических точек излома в сложных символах аберрации.

Версия 8.2, 25 октября 2001 г., обновляет Раздел 3 , чтобы включить префиксы чужеродных генов в примеры генотипов.

Версия 8.3, 26 ноября 2001 г., Раздел 7 переработан, чтобы уточнить, что генотипы определяют аллели генов.

Версия 8.4, 22 марта 2002 г., обновляет цитологию в примерах в Разделах 5.5.2.2. и 6.2.

Версия 9, 16 августа 2004 г., обновляет номенклатуру аннотаций последовательностей в разделе 1.1.3 . и подчеркивается в 1.7.2. и 10.5. запрет на использование символа / в гене и других символов. 11. немного изменен, чтобы уточнить, что эти параметры применимы к родовым белкам и транскриптам из данного гена.

Версия 10, 16 ноября 2006 г., обновляет информацию о белках митохондриальных рибосом в Приложении

Версия 10.1, 23 августа 2007 г., уточнение заголовка столбца таблицы общих префиксов Раздел 1.3

Версия 10.2, 6 февраля 2008 г., создан раздел 1.1.4 и изменен раздел 1.1.3 , чтобы указать префиксы аннотаций, используемые для генов, идентифицированных в проектах геномного секвенирования дрозофилы Разделы 1.1.3 и 1.1.4

Версия 11, 17 октября 2008 г. Были обновлены рекомендации по символам и названиям генов. Преамбула заменила «Введение», и были созданы разделы «Политика по созданию утвержденных FlyBase символов и названий генов. и . Генные символы и имена », а разделы «Названия и символы генов» и «Допустимые символы и синонимы», и Приложение А «Наименование генов, кодирующих рибосомные белки» были удалены.Разделы Имена аллелей и символы с по Cytotype были соответственно перенумерованы.

Функция СЧЁТЕСЛИ

Используйте СЧЁТЕСЛИ, одну из статистических функций, для подсчета количества ячеек, соответствующих критерию; например, чтобы подсчитать, сколько раз конкретный город появляется в списке клиентов.

В простейшей форме СЧЁТЕСЛИ означает:

.

Например:

  • = СЧЁТЕСЛИ (A2: A5, «Лондон»)

  • = СЧЁТЕСЛИ (A2: A5; A4)

Синтаксис

СЧЁТЕСЛИ (диапазон, критерий)

Имя аргумента

Описание

диапазон (обязательно)

Группа ячеек, которую нужно подсчитать. Диапазон может содержать числа, массивы, именованный диапазон или ссылки, содержащие числа. Пустые и текстовые значения игнорируются.

Узнайте, как выбирать диапазоны на листе.

критериев (обязательно)

Число, выражение, ссылка на ячейку или текстовая строка, определяющая, какие ячейки будут подсчитаны.

Например, вы можете использовать число типа 32, сравнение типа «> 32», ячейку типа B4 или слово вроде «яблоки».

СЧЁТЕСЛИ использует только один критерий. Используйте СЧЁТЕСЛИМН, если хотите использовать несколько критериев.

Примеры

Чтобы использовать эти примеры в Excel, скопируйте данные из приведенной ниже таблицы и вставьте их в ячейку A1 нового рабочего листа.

Данные

Данные

яблок

32

апельсина

54

персики

75

яблок

86

Формула

Описание

= СЧЁТЕСЛИ (A2: A5; «яблоки»)

Подсчитывает количество ячеек с яблоками в ячейках с A2 по A5.Результат 2.

= СЧЁТЕСЛИ (A2: A5; A4)

Подсчитывает количество ячеек с персиками (значение в A4) в ячейках с A2 по A5. Результат 1.

= СЧЁТЕСЛИ (A2: A5; A2) + СЧЁТЕСЛИ (A2: A5, A3)

Подсчитывает количество яблок (значение в A2) и апельсинов (значение в A3) в ячейках с A2 по A5.Результат: 3. В этой формуле дважды используется СЧЁТЕСЛИ, чтобы указать несколько критериев, по одному критерию на выражение. Вы также можете использовать функцию СЧЁТЕСЛИМН.

= СЧЁТЕСЛИ (B2: B5; «> 55»)

Подсчитывает количество ячеек со значением больше 55 в ячейках с B2 по B5. Результат 2.

= СЧЁТЕСЛИ (B2: B5; «<>» & B4)

Подсчитывает количество ячеек со значением, отличным от 75, в ячейках с B2 по B5.Амперсанд (&) объединяет оператор сравнения, если он не равен (<>), и значение в B4, чтобы читать = СЧЁТЕСЛИ (B2: B5, «<> 75»). Результат 3.

= СЧЁТЕСЛИ (B2: B5, «> = 32») — СЧЁТЕСЛИ (B2: B5, «> 85»)

Подсчитывает количество ячеек со значением больше (>) или равным (=) 32 и меньше (<) или равным (=) 85 в ячейках с B2 по B5.Результат 3.

= СЧЁТЕСЛИ (A2: A5; «*»)

Подсчитывает количество ячеек, содержащих любой текст, в ячейках с A2 по A5. Звездочка (*) используется как подстановочный знак для соответствия любому символу. Результат — 4.

= СЧЁТЕСЛИ (A2: A5, «????? es»)

Подсчитывает количество ячеек, которые содержат ровно 7 символов и оканчиваются буквами «es» в ячейках с A2 по A5.Вопросительный знак (?) Используется как подстановочный знак для соответствия отдельным символам. Результат 2.

Общие проблемы

Проблема

Что пошло не так

Для длинных строк возвращено неверное значение.

Функция СЧЁТЕСЛИ возвращает неверные результаты, если вы используете ее для сопоставления строк длиной более 255 символов.

Для сопоставления строк длиной более 255 символов используйте функцию СЦЕПИТЬ или оператор конкатенации &. Например, = СЧЁТЕСЛИ (A2: A5, «длинная строка» & «другая длинная строка»).

Нет значения, возвращенного, когда вы ожидаете значение.

Обязательно заключите аргумент критериев в кавычки.

Формула СЧЁТЕСЛИ получает # ЗНАЧ! ошибка при обращении к другому листу.

Эта ошибка возникает, когда формула, содержащая функцию, относится к ячейкам или диапазону в закрытой книге, и ячейки вычисляются.Чтобы эта функция работала, другая книга должна быть открыта.

Лучшие практики

Сделайте это

Почему

Имейте в виду, что СЧЁТЕСЛИ игнорирует верхний и нижний регистр в текстовых строках.

Критерии не чувствительны к регистру. Другими словами, строка «яблоки» и строка «ЯБЛОКИ» будут соответствовать одним и тем же ячейкам.

Используйте подстановочные знаки.

Подстановочные знаки — вопросительный знак (?) И звездочка (*) — можно использовать в критериях .Вопросительный знак соответствует любому одиночному символу. Звездочка соответствует любой последовательности символов. Если вы хотите найти настоящий вопросительный знак или звездочку, введите тильду (~) перед символом.

Например, = СЧЁТЕСЛИ (A2: A5, «яблоко?») Будет подсчитывать все экземпляры слова «яблоко» с последней буквой, которая может отличаться.

Убедитесь, что ваши данные не содержат ошибочных символов.

При подсчете текстовых значений убедитесь, что данные не содержат начальных и конечных пробелов, непоследовательного использования прямых и фигурных кавычек или непечатаемых символов. В этих случаях СЧЁТЕСЛИ может вернуть неожиданное значение.

Попробуйте использовать функцию CLEAN или функцию TRIM.

Для удобства используйте именованные диапазоны

СЧЁТЕСЛИ поддерживает именованные диапазоны в формуле (например, = СЧЁТЕСЛИ ( плод , «> = 32») — СЧЁТЕСЛИ ( плод , «> 85»).Именованный диапазон может находиться на текущем листе, другом листе той же книги или из другой книги. Для ссылки из другой книги эта вторая книга также должна быть открыта.

Примечание: Функция СЧЁТЕСЛИ не будет подсчитывать ячейки на основе фона ячеек или цвета шрифта. Однако Excel поддерживает определяемые пользователем функции (UDF) с помощью операций Microsoft Visual Basic для приложений (VBA) с ячейками на основе цвета фона или шрифта.Вот пример того, как вы можете подсчитать количество ячеек с определенным цветом ячеек с помощью VBA.

Нужна дополнительная помощь?

Вы всегда можете спросить эксперта в сообществе специалистов по Excel или получить поддержку в сообществе Answers.

См. Также

Чтобы подсчитать непустые ячейки, используйте функцию СЧЁТ

Чтобы подсчитать ячейки по нескольким критериям, используйте функцию СЧЁТЕСЛИМН.

Посмотрите видео о том, как использовать функцию СЧЁТЕСЛИМН

Функция СУММЕСЛИ добавляет только значения, соответствующие одному критерию.

Функция СУММЕСЛИМН добавляет только те значения, которые соответствуют нескольким критериям.

Функция IFS (Microsoft 365, Excel 2016 и более поздние версии)

Используйте функцию ОБРЕЗАТЬ, чтобы удалить начальные и конечные пробелы из ячеек

Используйте функцию CLEAN, чтобы удалить непечатаемые символы из ячеек.

Обзор формул в Excel

Как избежать неправильных формул

Обнаруживать ошибки в формулах

Статистические функции

Функции Excel (по алфавиту)

Функции Excel (по категориям)

Использование СУММЕСЛИ, СЧЁТЕСЛИ и связанных функций для быстрого анализа данных (бесплатная предварительная версия)

Команда

Grep в Linux (с примерами)

В этом руководстве вы узнаете, как использовать очень важную команду grep в Linux.Мы собираемся обсудить, почему эта команда важна для освоения и как вы можете использовать ее в повседневных задачах из командной строки.

Давайте сразу перейдем к некоторым объяснениям и примерам.

Почему мы используем grep?

Grep — это инструмент командной строки, который пользователи Linux используют для поиска строк текста. Вы можете использовать его для поиска в файле определенного слова или комбинации слов, или вы можете направить вывод других команд Linux в grep, чтобы grep мог показать вам только тот результат, который вам нужен.

Давайте рассмотрим несколько действительно распространенных примеров. Скажем, вам нужно проверить содержимое каталога, чтобы узнать, существует ли в нем определенный файл. Это то, для чего вы бы использовали команду «ls».

Но, чтобы ускорить весь процесс проверки содержимого каталога, вы можете передать вывод команды ls по конвейеру команде grep. Давайте поищем в нашем домашнем каталоге папку с названием Documents.

А теперь давайте попробуем проверить каталог еще раз, но на этот раз с помощью команды grep, чтобы проверить папку «Документы».

 $ ls | grep Документы 

Как вы можете видеть на скриншоте выше, использование команды grep сэкономило нам время за счет быстрой изоляции искомого слова от остальной ненужной информации, выводимой командой ls.

Если папка «Документы» не существует, grep не вернет никаких результатов. Итак, если grep ничего не возвращает, это означает, что он не может найти слово, которое вы ищете.

Найдите строку

Если вам нужно искать строку текста, а не просто одно слово, вам нужно будет заключить строку в кавычки.Например, что, если нам нужно было искать каталог «Мои документы», а не односложный каталог «Документы»?

 $ ls | grep 'Мои документы' 

Grep принимает как одинарные, так и двойные кавычки, поэтому заключите текст в любую из них.

Хотя вы можете использовать grep для поиска по конвейеру вывода из других инструментов командной строки, вы также можете использовать его для поиска документов напрямую. Вот пример, в котором мы ищем строку в текстовом документе.

 $ grep 'Class 1' Учащиеся.txt 

Найти несколько строк

Вы также можете использовать grep для поиска нескольких слов или строк. Вы можете указать несколько шаблонов с помощью переключателя -e. Давайте попробуем найти в текстовом документе две разные строки:

 $ grep -e 'Класс 1' -e Todd Students.txt 

Обратите внимание, что нам нужно было только заключить в кавычки строки, содержащие пробелы.

Разница между grep, egrep fgrep, pgrep, zgrep

Различные переключатели grep исторически включались в разные двоичные файлы.В современных системах Linux вы найдете эти переключатели доступными в базовой команде grep, но обычно дистрибутивы поддерживают и другие команды.

Из справочной страницы для grep:

egrep эквивалентно grep -E

Этот переключатель интерпретирует шаблон как расширенное регулярное выражение. С этим можно делать массу разных вещей, но вот пример того, как выглядит использование регулярного выражения с grep.

Давайте найдем в текстовом документе строки, содержащие две последовательные буквы «p»:

 $ egrep p \ {2} фрукты.txt 

или

 $ grep -E p \ {2} fruit.txt 

fgrep эквивалентен grep -F

Этот переключатель интерпретирует шаблон как список фиксированных строк и пытается сопоставить любую из них. Это полезно, когда вам нужно искать символы регулярного выражения. Это означает, что вам не нужно экранировать специальные символы, как при использовании обычной команды grep.

pgrep — это команда для поиска имени запущенного процесса в вашей системе и возврата его соответствующих идентификаторов процессов.Например, вы можете использовать его, чтобы найти идентификатор процесса демона SSH:

 $ pgrep sshd 

По функциям это аналогично передаче вывода команды «ps» по конвейеру в grep.

Вы можете использовать эту информацию, чтобы остановить запущенный процесс или устранить проблемы со службами, работающими в вашей системе.

Вы можете использовать zgrep для поиска в сжатых файлах шаблона. Это позволяет вам искать файлы внутри сжатого архива без необходимости сначала распаковывать этот архив, что в основном экономит вам один или два дополнительных шага.

 $ zgrep яблоко fruit.txt.gz 

zgrep также работает с tar-файлами, но, похоже, лишь сообщает вам, удалось ли ему найти совпадение.

Мы упоминаем об этом, потому что файлы, сжатые с помощью gzip, очень часто являются архивами tar.

Разница между find и grep

Для тех, кто только начинает работать с командной строкой Linux, важно помнить, что find и grep — это две команды с двумя очень разными функциями, даже если мы используем обе, чтобы «найти» то, что пользователь указывает.

Удобно использовать grep для поиска файла, когда вы используете его для поиска по выходным данным команды ls, как мы показали в первых примерах руководства.

Однако, если вам нужно рекурсивно искать имя файла — или часть имени файла, если вы используете подстановочный знак (звездочку), — вы намного впереди, чтобы использовать команду «найти».

 $ найти / путь / к / поиск-имя имя-файла 

Выходные данные выше показывают, что команда find смогла успешно найти файл, который мы искали.

Искать рекурсивно

Вы можете использовать ключ -r с grep для рекурсивного поиска по всем файлам в каталоге и его подкаталогах по заданному шаблону.

 $ grep -r шаблон / каталог / в / поиск 

Если вы не укажете каталог, grep будет просто искать в вашем текущем рабочем каталоге. На скриншоте ниже grep обнаружил два файла, соответствующих нашему шаблону, и возвращает их имена файлов и каталог, в котором они находятся.

Catch space or tab

Как мы упоминали ранее в нашем объяснении того, как искать строку , вы можете заключить текст в кавычки, если он содержит пробелы.Тот же метод будет работать для вкладок, но мы скоро объясним, как добавить вкладку в команду grep.

Поместите пробел или несколько пробелов в кавычки, чтобы grep выполнял поиск этого символа.

 $ grep "" sample.txt 

Есть несколько различных способов поиска вкладки с помощью grep, но большинство из них являются экспериментальными или могут быть несовместимыми в разных дистрибутивах.

Самый простой способ — просто найти сам символ табуляции, который можно создать, нажав ctrl + v на клавиатуре, а затем клавишу табуляции.

Обычно нажатие табуляции в окне терминала сообщает терминалу, что вы хотите выполнить автозаполнение команды, но предварительное нажатие комбинации ctrl + v приведет к тому, что символ табуляции будет записан, как вы обычно ожидаете в Текстовый редактор.

 $ grep "" sample.txt 

Эта маленькая уловка особенно полезна при поиске файлов конфигурации в Linux, поскольку вкладки часто используются для отделения команд от их значений.

Использование регулярных выражений

Функциональность Grep дополнительно расширена за счет использования регулярных выражений, что обеспечивает большую гибкость при поиске.Некоторые из них существуют, и мы рассмотрим некоторые из наиболее распространенных в приведенных ниже примерах:

[] квадратные скобки используются для сопоставления любого набора символов.

 $ grep "Class [123]" Students.txt 

Эта команда вернет любые строки, в которых написано «Class 1», «Class2» или «Class 3».

[-] скобки с дефисом могут использоваться для указания диапазона символов, числовых или алфавитных.

 $ grep "Класс [1-3]" Студенты.1-2] "Students.txt 

Знак доллара используется для поиска шаблона, который встречается только в конце строки.

 $ grep "1 $" Students.txt 

. точка используется для соответствия любому одному символу, поэтому это подстановочный знак, но только для одного символа.

 $ grep "A… .a" Students.txt 

Grep файлы gz без разархивирования

Как мы показали ранее, вы можете использовать команду zgrep для поиска по сжатым файлам без необходимости их предварительной разархивирования.

 $ zgrep word-to-search /path/to/file.gz 

Вы также можете использовать команду zcat, чтобы отобразить содержимое файла gz, а затем передать этот вывод в grep, чтобы изолировать строки, содержащие вашу строку поиска.

 $ zcat file.gz | поиск слова grep 

Grep адреса электронной почты из zip-файла

Мы можем использовать необычное регулярное выражение для извлечения всех адресов электронной почты из zip-файла.

 $ grep -o '[[: alnum:] + \. \ _ \ -] * @ [[: alnum:] + \.\ _ \ -] * 'emails.txt 

Флаг -o будет извлекать адрес электронной почты только , а не показывать всю строку, содержащую адрес электронной почты. Это приводит к более чистому результату.

Как и в большинстве случаев в Linux, это можно сделать несколькими способами. Вы также можете использовать egrep и другой набор выражений. Но приведенный выше пример отлично работает и представляет собой довольно простой способ извлечь адреса электронной почты и игнорировать все остальное.

Grep IP-адреса

Grep для IP-адресов может быть немного сложным, потому что мы не можем просто указать grep искать четыре числа, разделенных точками — ну, мы могли бы , , но эта команда может вернуть неверный IP адреса тоже.

Следующая команда найдет и выделит только действительных IPv4-адресов:

 $ grep -E -o "(25 [0-5] | 2 [0-4] [0-9] | [01]? [0-9] [0-9]?) \. (25 [0 -5] | 2 [0-4] [0-9] | [01]? [0-9] [0-9]?) \. (25 [0-5] | 2 [0-4] [0 -9] | [01]? [0-9] [0-9]?) \. (25 [0-5] | 2 [0-4] [0-9] | [01]? [0-9] ] [0-9]?) "/Var/log/auth.log 

Мы использовали это на нашем сервере Ubuntu, чтобы увидеть, откуда были сделаны последние попытки SSH.

Чтобы избежать повторения информации и предотвратить ее переполнение экрана, вы можете передать свои команды grep по конвейеру «uniq» и «more», как мы это сделали на скриншоте выше.

Grep или условие

Есть несколько различных способов использования условия или с grep, но мы покажем вам тот, который требует наименьшего количества нажатий клавиш и который легче всего запомнить:

 $ grep -E 'строка1 | строка2' имя_файла 

или, технически с использованием egrep — это еще меньше нажатий клавиш:

 $ egrep 'строка1 | строка2' имя файла 

Игнорировать регистр символов

По умолчанию grep чувствителен к регистру, что означает, что вы должны быть точными в использовании заглавных букв в строке поиска.Вы можете избежать этого, указав grep игнорировать регистр с помощью переключателя -i.

 $ grep -i строка имя_файла 

Поиск с учетом регистра

Что, если мы хотим найти строку, в которой первая строка может быть в верхнем или нижнем регистре, а остальная часть строки должна быть в нижнем регистре? Игнорирование регистра с переключателем -i в этом случае не сработает, поэтому простой способ сделать это — использовать квадратные скобки.

 $ grep [Ss] tring имя_файла 

Эта команда указывает grep учитывать регистр, за исключением первой буквы.

Grep точное совпадение

В наших примерах выше всякий раз, когда мы ищем в нашем документе строку «яблоко», grep также возвращает «ананас» как часть вывода. Чтобы избежать этого и искать строго «яблоко», вы можете использовать эту команду:

 $ grep "\ <яблоко \>" fruit.txt 

Вы также можете использовать переключатель -w, который сообщает grep, что строка должна соответствовать всей строке. Очевидно, это сработает только в тех случаях, когда вы не ожидаете, что остальная часть строки вообще будет содержать какой-либо текст.

Исключить шаблон

Чтобы увидеть содержимое файла, но исключить шаблоны из вывода, вы можете использовать переключатель -v.

 $ grep -v строка-исключить имя файла 

Как видно на снимке экрана, исключенная нами строка больше не отображается, когда мы запускаем ту же команду с параметром -v.

Grep и замена

Команда grep, переданная в sed, может использоваться для замены всех экземпляров строки в файле. Эта команда заменит «строку1» на «строку2» во всех файлах, относящихся к текущему рабочему каталогу:

 $ grep -rl 'строка1'./ | xargs sed -i 's / строка1 / строка2 / g' 

Grep с номером строки

Чтобы показать номер строки, содержащей вашу строку, используйте переключатель -n:

 $ grep -n строка имя_файла 

Показать строки до и после

Если вам нужно немного больше контекста для вывода grep, вы можете показать одну строку до и после указанной строки поиска с помощью переключателя -c:

 $ grep -c 1 строка имя файла 

Укажите количество строк, которые вы хотите показать — в этом примере мы сделали только 1 строку.

Сортировать результат

Передайте вывод greps команде sort, чтобы отсортировать результаты в некотором порядке. По умолчанию — в алфавитном порядке.

 $ grep строка имя файла | сорт 

Надеюсь, это руководство окажется для вас полезным. Продолжают возвращаться.

Мохтар является основателем LikeGeeks.com. Он работает системным администратором Linux с 2010 года. Он отвечает за обслуживание, защиту и устранение неполадок серверов Linux для множества клиентов по всему миру.Он любит писать сценарии оболочки и Python для автоматизации своей работы.

Словарь: concord: мой любимый фрукт … | Статья

Я задал некоторым носителям английского языка следующие вопросы, но получил разные ответы. Меня действительно смущает правильный ответ. Вы бы сказали: «Мой любимый фрукт — яблоки». или «Мой любимый фрукт — яблоко». или «Мои любимые фрукты — яблоки». ? И когда я меняю «яблоко» на «арбуз» или «ананас», кажется, что мы можем сказать только: «Мой любимый фрукт — арбуз.«Если мы скажем:« Мой любимый фрукт — арбузы », это будет неправильно. Верно? Другой подобный вопрос: люди скажут:« Моя любимая еда — лапша », а не« Моя любимая еда — лапша ». Тогда как насчет других блюд? Вы бы сказали: «Моя любимая еда — гамбургеры»?
Есть ли какое-то правило, которое можно применить к предложениям, которые я упомянул выше? Не могли бы вы помочь с моими вопросами?

Рой Го

Привет Рой,

Ваш интересный вопрос касается того, что технически называется согласием или, в более общем смысле, соглашением.То есть согласие подлежащего и глагола. Итак, возьмем ваш пример (но пока избегаем фрукт ): Мое любимое животное — слон . Здесь есть согласие между подлежащим (единственное, счетное) и глаголом. У нас также есть согласие между единичным субъектом и дополнением ( слон, ). С таким же успехом можно сказать: Мои любимые животные — слоны . Снова правила согласия.

В редких случаях, когда подлежащее встречается в единственном числе, а дополнение — во множественном, глагол согласуется с подлежащим, а не с дополнением.Итак: Мое любимое блюдо — запеченная фасоль . Не * Мое любимое блюдо — запеченные бобы . (Звездочка — это устройство, традиционно используемое для обозначения грамматически неприемлемого примера). Это, кстати, объясняет Моя любимая еда — лапша , причем о лапше почти всегда думают во множественном числе.

Однако есть еще одна проблема, и это то, как мы используем существительные, чтобы говорить в общем, то есть о классах вещей. Когда мы говорим Мои любимые животные — слоны , мы говорим о слонах как о классе, а не о каких-либо конкретных и идентифицируемых слонах (в этом случае мы бы сказали Мои любимые животные — слоны — e.грамм. те, что в зоопарке). В общем случае существует три варианта исчисляемых существительных:

Слон — млекопитающее.

Слон — млекопитающее.

Слоны — млекопитающие.

У бесчисленных существительных есть только один вариант — «нулевой артикль»:

Углерод — это элемент.

Пока все хорошо. Но ваш пример с фруктом несколько усложняет ситуацию, поскольку фрукт имеет две формы множественного числа: более распространенный фрукт, как в Дерево красивое, но его плоды ядовиты плод , так как в манго и ананасы — это тропические фрукты . (Тот факт, что фрукт также может быть бесчисленным, как в Fruit is good for you , не должен нас здесь беспокоить, поскольку в контексте моего любимого фрукта мы говорим об одном фрукте среди многих, и, следовательно, это счетно).

Принимая все это во внимание, теперь нам нужно объяснить, почему следующие варианты кажутся приемлемыми (и, действительно, приемлемыми, когда вы опробуете их на носителях языка):

1.Мой любимый фрукт — яблоки

2. Мой любимый фрукт — яблоки.

Менее вероятны, но грамматические:

3. Мой любимый фрукт — яблоко.

4. Мои любимые фрукты — яблоки.


Пример 1 легко объяснить, поскольку здесь фрукт имеет форму множественного числа, и, следовательно, пример следует схеме: Мои любимые животные — слоны.

Пример 2 Я могу объяснить только как единичное число плод (аналог Мое любимое животное… ), но множественное число яблок — это родовая форма — чуть менее напыщенный способ сказать 3. Мой любимый фрукт — яблоко . Тем не менее, отвечая на вопрос о примере 2, носители языка чувствуют себя немного некомфортно, считая это каким-то отклонением от нормы, но это лучшее из плохой работы. Пример 4 может быть попыткой быть сверхкорректным в отношении согласованности, но это действительно вероятно только в случаях вроде Мои любимые фрукты — яблоки и груши .

Если пример 2 приемлем (а я думаю, что это так), возникает вопрос: почему мы не можем сказать Мое любимое животное — слоны? Причина, я думаю, в том, что нередко думать о яблоках, в общем, в количестве более одного, но не о слонах.Фактически, чем меньше вы получите, тем больше вероятность, что вы воспользуетесь множественным числом:

.

3) Мой любимый фрукт — вишня.
Сравните: Мой любимый фрукт — вишня

4) Мой любимый овощ — горох.
Сравните: Мой любимый овощ — горох. Мои любимые овощи — горох

Я думаю, это также относится к вашим ящикам с арбузом и ананаса. Мой любимый фрукт — арбузы. вызывает в воображении образ, когда вы съедаете несколько штук за один присест. Бесчисленный, нулевой арбуз, общий арбуз решает проблему согласия и вызывает в воображении приемлемый образ заправки арбуза, не обязательно съедая его целиком. Но для яблока это не работает: * Мой любимый фрукт — яблоко . Неисчислимое яблоко и счетное яблоко — очень разные предметы, в отличие от бесчисленного арбуза и счетного арбуза .

Итак, как правило, я бы сказал, что, говоря в общем, чем меньше элемент, тем больше вероятность, что мы будем использовать его во множественном числе. ( Я люблю вишню ). Для более крупных предметов используйте, если возможно, бесчисленное количество бланков. ( Я люблю арбуз ). Если нет, пусть правит согласие. ( Мои любимые животные — шерстистые мамонты ).

Этилен-зависимые и -независимые механизмы поверхностной устойчивости к ожогам у плодов яблони «Granny Smith»

  • 1.

    Knight, M.Р. и Найт, Х. Восприятие низких температур, приводящее к экспрессии генов и устойчивости к холоду у высших растений. Новый фитолог 195 , 737–751 (2012).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 2.

    Zermiani, M. et al. . Этилен отрицательно регулирует обилие транскриптов генов, кодирующих реостат ROP-GAP, и влияет на гомеостаз апопластных активных форм кислорода в эпикарпах холодных плодов яблони. Журнал экспериментальной ботаники 66 , 7255–7270 (2015).

    Артикул PubMed PubMed Central CAS Google ученый

  • 3.

    Уоткинс, К. Б., Брамладж, У. Дж. И Крего, Б. А. Поверхностный ожог яблок «Грэнни Смит» выражается как типичная травма, вызывающая переохлаждение. Журнал Американского общества садоводческих наук 120 , 88–94 (1995).

    Google ученый

  • 4.

    Lurie, S. & Watkins, C.B. Поверхностный ожог, его этиология и меры борьбы. Послеуборочная биология и технология 65 , 44–60 (2012).

    Артикул CAS Google ученый

  • 5.

    Аполло Аркиза, Дж. М. Р., Хэй, А. Г., Нок, Дж. Ф. и Уоткинс, С. Б. Взаимодействие 1-метилциклопропена с дифениламином на деградацию дифениламина, концентрации альфа-фарнезена и конъюгированного триенола, а также активность полифенолоксидазы и пероксидазы плодов яблока. Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии 53 , 7565–70 (2005).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 6.

    Рупасингх, Х. П. В., Палият, Г. и Мурр, Д. П. Сесквитерпен-α-фарнезен-синтаза: частичная очистка, характеристика и активность в отношении развития поверхностного ожога у яблок. Журнал Американского общества садоводческих наук 125 , 111–119 (2000).

    CAS Google ученый

  • 7.

    Busatto, N. et al. . Профили транскрипции целевых метаболитов и генов во время развития поверхностного ожога яблони (Malus x domestica Borkh). Биология растений BMC 14 , 193 (2014).

    Артикул PubMed PubMed Central CAS Google ученый

  • 8.

    Руделл, Д. Р., Маттеис, Дж.П. и Хертог, М. Л. А. Т. М. Метаболические изменения предшествуют симптомам поверхностного ожога яблони. Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии 57 , 8459–8466 (2009).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 9.

    Фарнети, Б. и др. . Ненаправленное метаболомическое исследование летучих соединений, участвующих в развитии поверхностного ожога яблони, с помощью PTR-ToF-MS. Метаболомика 11 , 341–349 (2014).

    Артикул CAS Google ученый

  • 10.

    Бусатто, Н. и др. . Устойчивость к поверхностному ожогу плодов яблони, опосредованная ингибированием этилена, связана с разнообразными метаболическими процессами. Заводской журнал 93 , 270–285 (2018).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 11.

    Ду, Л., Сонг, Дж., Кэмпбелл Палмер, Л., Fillmore, S. & Zhang, Z. Q. Количественные протеомные изменения в развитии расстройства поверхностного ожога и его реакции на лечение дифениламином и 1-MCP в плодах яблока. Послеуборочная биология и технология 123 , 33–50 (2017).

    Артикул CAS Google ученый

  • 12.

    Даккорд, Н. и др. . Качественная сборка de novo генома яблока и динамика метилома ранних плодов. Nature Genetics 49 , 1099–1106 (2017).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 13.

    Tassoni, A., Watkins, CB & Davies, PJ. Ингибирование реакции этилена 1-MCP в томатах предполагает, что полиамины не участвуют в задержке созревания, но могут замедлять скорость созревания или перезревания. . Журнал экспериментальной ботаники 57 , 3313–3325 (2006).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 14.

    Schrick, K. et al. . Мутации в UDP-глюкозе: стеролглюкозилтрансферазе у Arabidopsis вызывают фенотип прозрачного семенника и дефект суберизации семян. Физиология растений 151 , 78–87 (2009).

    Артикул PubMed PubMed Central CAS Google ученый

  • 15.

    Misra, R.C., Kamthan, M., Kumar, S. & Ghosh, S. Тауматин-подобный белок Ocimum basilicum придает устойчивость к грибковому патогену и абиотическому стрессу у трансгенного Arabidopsis. Научные отчеты 6 , 1–14 (2016).

    Артикул CAS Google ученый

  • 16.

    Мей, Х. и др. . Двойные механизмы регуляции и накопления гамма-аминомасляной кислоты в листьях чая ( Camellia sinensis ), подверженных множественным стрессам. Научные отчеты 6 , 1–11 (2016).

    Артикул CAS Google ученый

  • 17.

    Гронес, П. и др. . Ауксин-связывающий карман ABP1 имеет решающее значение для его клеточной роли и роли в развитии. Журнал экспериментальной ботаники 66 , 5055–5065 (2017).

    Артикул CAS Google ученый

  • 18.

    Слокум, Р. Д. Гены, ферменты и регуляция биосинтеза аргинина в растениях. Физиология и биохимия растений 43 , 729–745 (2005).

    Артикул PubMed CAS PubMed Central Google ученый

  • 19.

    Носаржевски М. и Арчболд Д. Д. Тканеспецифическая экспрессия сорбитолдегидрогеназы в плодах яблони на раннем этапе развития. Экспериментальный журнал 58 , 1863–1872 (2017).

    Google ученый

  • 20.

    Wegrzyn, T., Macrae, E. A. и Redgwell, R.J., яблочная β-галактозидаза. Физиология растений 106 , 521–528 (1994).

    Артикул PubMed PubMed Central Google ученый

  • 21.

    Tanou, G. и др. . Изучение прайминговых реакций, связанных с акклиматизацией плодов персика к переохлаждению. Научные отчеты 7 , 1–14 (2017).

    ADS Статья CAS Google ученый

  • 22.

    Tsai, W., Reineke, L.C., Jain, A., Jung, S.Y. & Lloyd, R.E. Гистоновая аргининдеметилаза JMJD6 связана со сборкой стрессовых гранул посредством деметилирования нуклеирующего белка G3BP1 стрессовых гранул. Журнал биологической химии 292 , 18886–18896 (2017).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 23.

    Аврамиду, Э. В., Ганопулос, И. В., Дулис, А. Г., Цафтарис, А. С., Араванопулос, Ф. А. Помимо популяционной генетики: естественная эпигенетическая изменчивость дикой вишни (Prunus avium). Tree Genetics & Genomes 55 , 904–906 (2015).

    Google ученый

  • 24.

    Цантили, Э. и др. . Метаболизм этилена и α-фарнезена в зеленой и красной кожуре трех сортов яблони в ответ на лечение 1-метилциклопропеном (1-MCP). Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии 55 , 5267–5276 (2007).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 25.

    Яо, Ю. Х., Донг, К. Л., Чжай, Х., Ю, К. Х. и Хао, Ю. Дж. Функции гена яблочной цитозольной малатдегидрогеназы в росте и устойчивости к холоду и солевому стрессу. Физиология и биохимия растений 49 , 257–264 (2011).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 26.

    Тробахер, К. П. и др. . Кальмодулин-зависимая и кальмодулиннезависимая глутаматдекарбоксилазы в плодах яблони. Биология растений BMC 13 , 144 (2013).

    Артикул PubMed PubMed Central CAS Google ученый

  • 27.

    Янг, Х. и др. . Влияние этилена и 1-MCP на экспрессию генов, участвующих в биосинтезе этилена и восприятии во время созревания плодов яблони. Послеуборочная биология и технология 78 , 55–66 (2013).

    Артикул CAS Google ученый

  • 28.

    Ранвала, А. П., Суэмацу, С. и Масуда, Х. Роль бета-галактозидаз в модификации компонентов клеточной стенки во время созревания плодов дыни. Физиология растений 100 , 1318–1325 (1992).

    Артикул PubMed PubMed Central CAS Google ученый

  • 29.

    Wang, Q. и др. . Субкомплекс γ-карбоангидразы митохондриального комплекса I важен для развития и важен для фотоморфогенеза Arabidopsis. Физиология растений 160 , 1373–1383 (2012).

    Артикул PubMed PubMed Central CAS Google ученый

  • 30.

    Caillau, M. & Quick, W. P. Новые взгляды на трансальдолазу растений. Заводской журнал 43 , 1–16 (2005).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 31.

    Griffith, M. et al. . Thellungiella: родственное арабидопсису модельное растение, адаптированное к холоду. Растения, клетки и окружающая среда 30 , 529–538 (2007).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 32.

    Abbal, P. et al. . Молекулярная характеристика и анализ экспрессии семейства Rab GTPase в Vitis vinifera выявляют специфическую экспрессию белка VvRabA. Экспериментальный журнал 59 , 2403–2416 (2008).

    CAS Google ученый

  • 33.

    Woollard, A. D. & Moore, I. Функции Rab GTPases в растительном мембранном движении. Текущее мнение по биологии растений 11 , 610–619 (2008).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 34.

    Резерфорд, С. и Мур, И.Семейство Arabidopsis Rab GTPase: еще одна загадочная вариация. Текущее мнение по биологии растений 5 , 518–528 (2002).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 35.

    Инициатива по геному арабидопсиса. Анализ последовательности генома цветкового растения Arabidopsis thaliana . Nature 408 , 796–815 (2000).

  • 36.

    Echevarría-zomeño, S., Yángüez, E. & Fernández-bautista, N. Регулирование инициации трансляции при биотических и абиотических стрессах. Международный журнал молекулярных наук 14 , 4670–4683 (2013).

    Артикул PubMed PubMed Central CAS Google ученый

  • 37.

    Ziogas, V. et al. . Роль гидросульфида натрия и нитропруссида натрия в качестве затравочных молекул при акклиматизации растений цитрусовых к засухе. Молекулярная биология растений 89 , 433–450 (2015).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 38.

    Ван, X., Cai, X., Xu, C., Wang, Q. & Dai, S. Механизмы реагирования на засуху в листьях растений, выявленные протеомикой. Международный журнал молекулярных наук 17 , 1706 (2016).

    Артикул PubMed Central CAS Google ученый

  • 39.

    Раванель С., Гакиер Б., Джоб Д. и Дус Р. Особенности биосинтеза и метаболизма метионина в растениях. Proceedings of the National Academy of Sciences of United States of America 95 , 7805–7812 (1998).

    ADS Статья CAS Google ученый

  • 40.

    Сайто К. Регулирование транспорта сульфатов и синтеза серосодержащих аминокислот. Текущее мнение по биологии растений 3 , 188–195 (2000).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 41.

    Галили, Г., Амир, Р., Хефген, Р. и Гессе, Х. Повышение уровня незаменимых аминокислот и метаболитов серы в растениях. Биологическая химия 386 , 817–831 (2005).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 42.

    Curien, G., Job, D., Douce, R. & Dumas, R.Аллостерическая активация треонинсинтазы Arabidopsis S-аденозилметионином. Биохимия 37 , 13212–13221 (1998).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 43.

    Албан, К., Джоб, Д. и Дус, Р. Метаболизм биотина в растениях. Ежегодный обзор физиологии растений и молекулярной биологии растений 51 , 17–47 (2000).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 44.

    Oge, L. и др. . Ремонт белка L-изоаспартилметилтрансфераза1 участвует как в долголетии семян, так и в силе прорастания Arabidopsis . Растительная клетка 20 , 3022–3037 (2008).

  • 45.

    Фаринати, С., Расори, А., Варотто, С. и Бонги, С. Rosaceae, развитие плодов, созревание и послеуборочные периоды: эпигенетическая ретроспектива. Frontiers in Plant Science 8 , 1–14 (2017).

    Артикул Google ученый

  • 46.

    Гэппер, Н. Е., Руделл, Д. Р., Джованнони, Дж. Дж. И Уоткинс, С. Б. Разработка биомаркеров для внешнего CO. 2 Прогнозирование повреждений яблок путем исследования изменений как транскриптома, так и метилирования ДНК. Анналы ботаники 5 , 1–9 (2017).

    Google ученый

  • 47.

    Campos, A.C.E. и др. . Окислительный стресс модулирует метилирование ДНК во время блокады закрепления меланоцитов, связанной со злокачественной трансформацией. Неоплазия 9 ​​, 1111–1121 (2007).

    Артикул PubMed PubMed Central CAS Google ученый

  • 48.

    Groth, M. et al. . MTHFD1 контролирует метилирование ДНК в Arabidopsis . Природа . Связь 7 , 11640–11653 (2016).

    CAS Google ученый

  • 49.

    Ван де Поэль, Б. и др. . Использование S-аденозил-L-метионина во время климактерического созревания томатов в отношении биосинтеза этилена и полиаминов и способности к трансметилированию. Physiologia Plantarum 148 , 176–188 (2013).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 50.

    Feng, X., An, Y., Zheng, J., Sun, M. & Wang, L. Анализ протеомики и SSH окраски плодов, стимулированной ALA, и доказательства участия MADS-BoxGene , MdMADS1. Frontiers in Plant Science 7 , 1–19 (2016).

    CAS Google ученый

  • 51.

    Gutensohn, M. et al. . Цитозольный биосинтез монотерпена поддерживается пластидным субстратом геранилдифосфата в плодах трансгенных томатов. Заводской журнал 75 , 351–363 (2013).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 52.

    Zou, J. и др. . Транскриптомный анализ изменения метаболизма летучих ароматических веществ в плодах томата ( Solanum lycopersicum ) при различных температурах хранения и обработке 1-MCP. Послеуборочная биология и технология 135 , 57–67 (2018).

    Артикул CAS Google ученый

  • 53.

    Филлипс, М. А. и Крото, Р. Б. Средства защиты хвойных пород на основе смол. Тенденции в растениеводстве 4 , 184–190 (1999).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 54.

    Ли, Дж., Руделл, Д. Р. и Уоткинс, С. Б. Метаболические изменения в обработанном 1-метилциклопропеном (1-МСР) яблоке «Empire» при различных температурах хранения. Acta Horticulturae 1048 , 113–120 (2014).

    Артикул Google ученый

  • 55.

    Джоши, В., Джунг, Дж. Г., Фей, З. и Джандер, Г.Взаимозависимость метаболизма треонина, метионина и изолейцина в растениях: накопление и регуляция транскрипции в условиях абиотического стресса. Аминокислоты 39 , 933–947 (2010).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 56.

    Годдард, Н. Дж. и др. . Молекулярный анализ и пространственный характер экспрессии низкотемпературного специфического гена ячменя, blt101. Молекулярная биология растений 4 , 871–879 (1993).

    Артикул Google ученый

  • 57.

    Матич, А. Дж., Бэнкс, Н. Х. и Роуэн, Д. Д. Модификация уровней α -фарнезена в яблоках «Granny Smith», хранящихся в прохладном месте, с помощью вентиляции. Послеуборочная биология и технология 14 , 159–170 (1998).

    Артикул CAS Google ученый

  • 58.

    Moggia, C., Moya-Leon, M., Pereira, M., Юрий, Дж. И Лобос, Г. Влияние DPA и 1-MCP на химические соединения, связанные с поверхностным ожогом яблок Granny Smith. Испанский журнал сельскохозяйственных исследований 8 , 178–187 (2010).

    Артикул Google ученый

  • 59.

    Латимер, С. Б. и др. . Накопление жирных кислот путем ингибирования акрилатом β-окисления у алканокисляющих Pseudomonas. Biochimica et Biophysica Acta 84 , 192–195 (1964).

    PubMed Google ученый

  • 60.

    Лара, И., Белдж, Б. и Гоулао, Л. Ф. Сосредоточены на биосинтезе и составе кутикулы плодов. Журнал сельского хозяйства и пищевой химии 63 , 4005–4019 (2015).

    Артикул CAS Google ученый

  • 61.

    Бейн, Дж. И Мерсер, Ф. В. Субмикроскопическая цитология поверхностного ожога, физиологического заболевания яблок. Австралийский журнал биологических наук 16 , 442–449 (1963).

    Артикул Google ученый

  • 62.

    Rautengarten, C., Birdseye, D., Pattathil, S., Mcfarlane, H.E. & Saez-aguayo, S. Сложный путь доставки UDP-арабинозы в Гольджи растений. Труды Национальной академии наук 114 , 42611–4266 (2017).

    Артикул CAS Google ученый

  • 63.

    Tenhaken, R. Ремоделирование клеточной стенки в условиях абиотического стресса. Frontiers in Plant Science 5 , 1–9 (2015).

    Артикул Google ученый

  • 64.

    Ан, Дж. и др. . Истощение UDP-D-апиоза / UDP-D-ксилозосинтаз приводит к дефициту рамногалактуронана-II, утолщению клеточной стенки и гибели клеток у высших растений. Журнал биологической химии 281 , 13708–13716 (2006).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 65.

    Gapper, N. E. et al. . Отсроченная реакция на холодовой стресс характеризуется последовательными метаболическими сдвигами, кульминацией которых является некроз кожуры плодов яблони. BMC Plant Biology 17 , 1–18 (2017).

    Артикул Google ученый

  • 66.

    Карагианнис, Э. и др. . Сравнительный физиологический и протеомный анализ выявил четкую регуляцию качественных характеристик кожи персика в зависимости от высоты. Frontiers in Plant Science 7 , 1–14 (2016).

    Артикул Google ученый

  • 67.

    Xanthopoulou, A. et al. . Сравнительный транскриптомный анализ de novo генов, вовлеченных в морфологию плодов тыквенных сортов с экстремальной разницей в размерах и развитием маркеров EST-SSR. Ген 622 , 50–66 (2017).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 68.

    Ким, Х. К. и Верпорте, Р. Подготовка проб для метаболомики растений. Фитохимический анализ 21 , 4–13 (2010).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 69.

    О’Горман, А., Барри-Райан, К. и Фриас, Дж. М. Оценка и идентификация маркеров повреждения грибов ( Agaricus bisporus ) после сбора урожая с использованием метода профилирования метаболизма ГХ / МС. Метаболомика 8 , 120–132 (2012).

    Артикул CAS Google ученый

  • 70.

    Михайлидис, М. и др. . Метаболомический и физико-химический подходы раскрывают динамическую регуляцию кальция в физиологии плодов черешни. Физиология и биохимия растений 116 , 68–79 (2017).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 71.

    Карагианнис, Э. и др. .Послеуборочные реакции плодов черешни и тканей стеблей, выявленные с помощью метаболомного профилирования. Физиология и биохимия растений 127 , 478–484 (2018).

    Артикул PubMed CAS Google ученый

  • 72.

    Ainalidou, A. et al. . Комплексный анализ метаболитов и белков позволяет выявить аспекты тканеспецифической функции синтетического цитокинина в процессе развития и созревания киви. Протеомический журнал 143 , 318–333 (2015).

    Артикул CAS Google ученый

  • 73.

    Bevan, M. et al. . Анализ 1,9 МБ непрерывной последовательности хромосомы 4 Arabidopsis thaliana . Nature 391 , 485–488 (1998).

    ADS Статья PubMed CAS Google ученый

  • Использование переменных в плане набора Asterisk

    Использование переменных в плане набора Asterisk

    Опубликовано: 22 января 2021 г., Область исследования
     
      Предопределенные переменные канала
      Есть некоторые переменные канала, установленные Asterisk, на которые вы можете ссылаться в определениях вашего диалплана.Переменные, определенные звездочкой, в отличие от переменных, определяемых пользователем, чувствительны к регистру.
    
    $ {ACCOUNTCODE}: код учетной записи, если он указан - см. Биллинг Asterisk.
    $ {ANSWEREDTIME}: время, когда на вызов был дан ответ.
    $ {BLINDTRANSFER}: активный канал SIP, на котором был набран номер. Это вернет канал SIP, который набрал номер при выполнении слепой передачи - см. BLINDTRANSFER
    $ {CALLERID}: текущий идентификатор вызывающего абонента (имя и номер).
    $ {CALLERIDNAME}: текущее имя вызывающего абонента.
    $ {CALLERIDNUM}: текущий номер идентификатора вызывающего абонента (обратите внимание, что это не обязательно числовое значение, как указывает имя, и оно может содержать пробел.Команды, действующие на эту переменную (например, «GotoIf»), должны знать об этом).
    $ {CALLINGPRES}: PRI переменная представления идентификатора вызова для входящих вызовов (см. Callpres)
    $ {CHANNEL}: название текущего канала
    $ {CONTEXT}: имя текущего контекста.
    $ {DATETIME}: текущая дата и время в формате: ДДММГГГГ-ЧЧ: ММ: СС
    $ {DIALEDPEERNAME}: имя вызываемой стороны. На данный момент не работает, см. DIALEDPEERNAME
    $ {DIALEDPEERNUMBER}: номер вызываемого абонента. На данный момент не работает, см. DIALEDPEERNUMBER
    $ {DIALEDTIME}: время набора номера.$ {DIALSTATUS}: статус вызова. См. DIALSTATUS
    $ {DNID}: идентификатор набранного номера. Применяются ограничения, см. DNID
    $ {EPOCH}: текущая эпоха в стиле UNIX (количество секунд с 1 января 1970 г.)
    $ {EXTEN}: текущее расширение.
    $ {HANGUPCAUSE}: последний код возврата зависания на канале Zap, подключенном к интерфейсу PRI.
    $ {INVALID_EXTEN}: расширение, запрашиваемое при перенаправлении на расширение i (недопустимое)
    $ {LANGUAGE}: текущая языковая настройка. См. Многоязычный интерфейс Asterisk
    $ {MEETMESECS}: количество секунд, в течение которых пользователь участвовал в конференции MeetMe.
    $ {PRIORITY}: текущий приоритет
    $ {RDNIS}: текущий DNIS перенаправления, идентификатор вызывающего абонента, который перенаправил вызов.Действуют ограничения, см. RDNIS.
    $ {SIPDOMAIN}: домен назначения SIP для входящего вызова (при необходимости)
    $ {SIP_CODEC}: используется для установки кодека SIP для вызова (очевидно, не работает в версии 1.0.1, нормально в версиях 1.0.3 и 1.0.4, не уверен в 1.0.2)
    $ {SIPCALLID}: идентификатор вызова диалогового окна SIP: заголовок
    $ {SIPUSERAGENT}: заголовок пользовательского агента SIP.
    $ {TIMESTAMP}: текущая дата и время в формате: ГГГГММДД-ЧЧММСС
    $ {TXTCIDNAME}: результат приложения TXTCIDName (см. Ниже)
    $ {UNIQUEID}: уникальный идентификатор текущего звонка.
    $ {TOUCH_MONITOR}: используется для "записи в одно касание" (см. Features.conf и флаги набора wW). Если установлено с обеих сторон вызова, тогда эта переменная содержит app_args для app_monitor, в противном случае используется значение по умолчанию WAV || m
    
    Зависящие от приложения переменные
     Некоторые приложения принимают дополнительный ввод или предоставляют вывод с использованием переменных канала.
     ChanIsAvail возвращает $ {AVAILCHAN}: первый доступный канал.
     Dial принимает входные данные от $ {VXML_URL}: Отправить XML-URL на Cisco 7960
     Набор принимает входные данные из $ {ALERT_INFO}: установка частоты звонка для телефонов Cisco.
     Набор возвращает $ {CAUSECODE}: Если набор не удался, это сообщение об ошибке
     Набор возвращает $ {DIALSTATUS}: текстовый код, возвращающий статус последней попытки набора.EnumLookup возвращает $ {ENUM}: результат поиска.
     MeetMe принимает входные данные от {MEETME_AGI_BACKGROUND}: сценарий AGI для запуска
     MeetMe возвращает $ {MEETMESECS}: количество секунд, в течение которых пользователь находился в конференции.
     Hangup читает переменную $ {PRI_CAUSE} для установки кодов возврата PRI.
     TXTLookup возвращает $ {TXTCIDNAME}: результат поиска DNS.
     AgentCallbackLogin возвращает $ {AGENTBYCALLERID _ $ {CALLERID}}: идентификатор агента, успешно выполнившего вход в систему.
     Макро-специфические переменные
     В контексте макроса доступны дополнительные переменные канала.$ {ARG1}: первый аргумент, переданный макросу.
     $ {ARG2}: второй аргумент, переданный макросу (и т. Д.)
     $ {MACRO_CONTEXT}: контекст расширения, запустившего этот макрос.
     $ {MACRO_EXTEN}: расширение, запустившее этот макрос.
     $ {MACRO_OFFSET}: устанавливается макросом, чтобы влиять на приоритет, при котором выполнение будет продолжено после выхода из макроса.
     $ {MACRO_PRIORITY}: приоритет в расширении, где был запущен этот макрос.
     Переменные среды
     Вы можете получить доступ к переменным среды unix, используя синтаксис:
     $ {ENV (foo)}
     $ {ENV (ASTERISK_PROMPT)}: текущее приглашение интерфейса командной строки Asterisk.$ {ENV (RECORDED_FILE)}: имя последнего файла, сохраненного командой Record (доступно в CVS> 2004-03-21)
     Функции обработки строк
     Длина строки
     $ {LEN (foo)}
     возвращает длину строки foo. Например,
     exten => 100,1, SetVar (Fruit = груша)
        exten => 100,2, NoOp ($ {LEN (Fruit)})
        exten => 100,3, NoOp ($ {LEN ($ {Fruit})})
     Первый NoOp покажет значение 5 (длина строки «плод»). Второй NoOp покажет значение 4 (длина строки «груша»).Это отличный способ проверить наличие NULL или пустой строки.
     Подстроки
        $ {foo: offset: length}
     возвращает подстроку строки foo, начиная со смещения смещения и возвращая символы следующей длины.
     Если смещение отрицательное, оно берется слева от правого конца строки.
     Если длина не указана или имеет отрицательное значение, возвращается вся остальная часть строки, начинающаяся со смещения.
    
    Подстроки $ {foo: offset: length} возвращает подстроку строки foo, начиная со смещения смещения и возвращая символы следующей длины.Если смещение отрицательное, оно берется слева от правого конца строки. Если длина не указана или имеет отрицательное значение, возвращается вся остальная часть строки, начинающаяся со смещения.
      Примеры:
      $ {123456789: 1} - возвращает строку 23456789
       $ {123456789: -4} - возвращает строку 6789
       $ {123456789: 0: 3} - возвращает строку 123
       $ {123456789: 2: 3} - возвращает строку 345
       $ {123456789: -4: 3} - возвращает строку 678
      Примеры использования:
      exten => _NXX., 1, SetVar (areacode = $ {EXTEN: 0: 3}) - получить первые 3 цифры $ {EXTEN}
     exten => _516XXXXXXX, 1, набрать ($ {EXTEN: 3}) - получить все, кроме первых трех цифр $ {EXTEN}
     exten => 100,1, SetVar (whichVowel = 4)
     exten => 100,2, SetVar (foo = AEIOU: $ {whichVowel}: 1) - устанавливает $ {foo} на единственную букву 'U'
      Конкатенация строк
      Чтобы объединить две строки, просто запишите их вместе:
     $ {foo} $ {bar}
     555 $ {theNumber}
     $ {longDistancePrefix} 555 $ {theNumber}
    
      Математика с переменными
      Для вычисления переменных e.
    	    

    alexxlab

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован.