Отзывы | ТурБазар — интернет-аукцион туров в России

Тур. объект

Выберите объектАвантель Клаб Истра, отельГК Леонида Тягачёва, ЦАОСнегирёк, экотельDmitrov Golf Resort, гольф-отельЯхонты Ногинск, Cronwell Park40-й меридиан Яхт-клуб, отельВалеско Отель & СПА, дом отдыхаВоздвиженское, парк-отель4 Сезона, парк-отельРусский двор, база отдыхаArtiLand, загородный клубВеличъ Кантри Клаб, отельRigaLand Hotel Moscow Царская деревня, гостиницаForesta Festival Park, отельИмпериал, парк-отель & SPA40-й меридиан Арбат, отельИваново Озеро, премиум отельБоярская усадьба, дом отдыхаУлетный город, арт-отель Замок снов, эксклюзивный отельМалибу, курортный комплексОрловский, гостиничный комплексГолицын Клуб, загор. комплексАлександрЪ, загородный клубАбрамцево, парк-отельДракино, кислородный курортАтлас, парк-отельОгниково, парк-отельЗвенигородский, эко-курортMoscow Country Club, отель Усадьба Малеевка, отельСпортотель 1, гостиницаКия, гостиницаАнива, парк-отельРаухова мельница, база отдыхаДолгий лог, база отдыхаФристайл 1, гостиницаАлсей, загородный отельДивный, спорт-отельВерсаль, отель-домЕргаки, база отдыхаОзеро Парное, база отдыхаЗагляденье, база отдыхаДолина ИВолга, парк-отельЛивадия, гостиницаБелый Соболь, парк-отельКристалл, гостиницаЖемчужина Эко, база отдыхаМельница, отельДружба, дом отдыхаVillatic, отель событий Country house, дом за городомТИРС, отельТверь Парк Отель 3*, заг. комплексСветлый терем, гостевой домУ Потапыча, база отдыхаЙети Хаус, отельТуризм & Сервис, сплав по МанеСДЛ, парк-отельСаянская Благодать, санаторийАдмирал, яхт-клубБузим, загородный клубМанский Бриз, база отдыхаГорячий ключ, семейный клубОснабрюк, отельFordeWind, яхт-клубЛесное, отель-заповедникКсения, мини-отельЗеленый дом, загородный клубНарва, база отдыхаКЛБ, база отдыхаПечоры-Парк, гостиницаДубровино, база отдыхаSK Royal Yaroslavl, отельНовый Ковчег, эко-отельУтро в деревне, конефермаКрона, санаторийПечки-Лавочки, база отдыхаАлтайРай, база отдыхаУ Озера, база отдыхаЛесНица, база отдыхаАстория, клуб охотников и рыбаковДеревня Берендеевка, этно-отельСвоя усадьба, база отдыхаЛетучая рыба, рыболовная базаПокровка, рыболовная базаБольшие камни, база отдыхаКургала, этно-деревняАру-Кёль, усадьбаЭдем, тур. комплексПривал странников, база отдыхаБольшой Плёс, комплекс отдыхаКлючевой элемент, отельОзеро Зеркальное, база отдыха Ветер Байкала, база отдыхаБайкалТрек, база отдыхаБайкал Дар, база отдыхаУюга, парк-отельСнежный барс, туркомплексTRAVEL, сплав по реке МанаРодник, пансионатБоровоеЗубово, база отдыхаОрбита, загородный комплекс Избушка, база отдыхаДубрава, гостиный домШишки, загородный клубЗеленый бор, база отдыхаУральский двор, гост. комплексПереславль, отельБумеранг, гостевой домСеребрянский Камень, база отдыха Эко-парк Зюраткуль, база отдыхаРубин, яхт-клубCasablanca 3*, отельКулига-парк, загородный комплексВиконда, гостиницаНефтяник, гостиницаУралочка, база отдыхаКупеческий, бизнес-отельБерезка, тур. комплексМорозово, отель-курортПечки-Лавочки, комплексГорная Оя, тур. комплексКоролевская гавань, гостевой домГорхон, гостевой домЦветочное море, экодеревняЭв’рошель, гостевой домФинская дача, туркомплексЛотос в Окунево, гостевой дворОтдых в Должанской, част. секторАбаго, отельЭкотель, тур. деревенькаЧара, база отдыхаСолнечный ветер, база отдыхаАстраханская, база отдыхаАэроград, отельЯрославна, комплексГора Соболиная, курортЭТНОМИР, парк-музейVintage, отельОленья речка, база отдыхаЕжезеро, гостевая деревняWardenclyffe Volgo-Balt, арт-отельСевастополь, гостиницаСтрелец, мини-отельАнна-Виктория, мини-отельГранд Отель Шуя, отельГандурино, рыбацкий домСтарый замок, база отдыхаДеревня Комаровка, апарт-отельКлуб Отель Корона 4*, бутик-отельНой, гостевой домПремьер, отельБайкальский ветер, база отдыхаНовый Свет, гост. комплексРинг Премьер Отель, гостиницаМатрёшка, гостевой домПрайм, мини-отельЯрославское подворье, отельЛебедь, усадьбаХутор Кедровый, база отдыхаЗолотая рыбка, турбазаАрарат, гостиничный комплексИмперия туризма, тур. комплексТур по Золотому кольцу, Фелиция-турСарминская, база отдыхаАйру, центр отдыхаРомашково, усадьбаПопов луг, комплексМандерхан плюс, турбазаКоторосль, гостиницаЛесная поляна, загородный клубЦарская Охота, загородная базаЛасточка, санаторийДва бегемота, база отдыхаЛиствянка Шале, гостиницаСвятогор, гостевой домЗатерянный Мир, этно-комплекс13 кордон, база отдыхаПолитотдел, база отдыхаВеслево, парк отдыхаТройка, гостиничный комплексБерендеевка, парк-отельVilla Bogema, загородный клубЛебяжье, база отдыхаАквариум, парк-отельСиняя Осока, гост. комплексУспенская, гостиницаБояринцево, база отдыхаДивный край, ралли-марафонПрибайкальская, гостиница Золотой Ара, гостиницаЯсная, усадьбаБогдарня, агротуркомплексИгарский, гостевой домМалина, гостевой домАрго, база отдыхаСеверная Надежда, центр отдыхаДевятый вал, гостевой домСосновый бор, гост. комплексЛюблю-Но…, отельАэлита (Холодок), туркомплексТутайский прибой, тур.комплекс Московский тракт, гостиница Ишимский, санаторийТурист, гостиницаЛевБерДон, база отдыхаНа Ватоме, база отдыхаАвиатор, гостиницаГранд Байкал, отельЛесной кордон, база отдыхаГостевой двор, дом отдыхаСеливановъ, отель-ресторанАмарис, гостиницаR.C. Озерная, резиденцияГора Белая, гостиницаВеЛес, эко-отельТихая долина, туркомплексЛесогорская усадьба, база отдыхаПсковская Швейцария, Эко-деревняАрагон, гостиница Царство Снегурочки, база отдыхаПоляна, туристическая деревняФокино-Приволжье, база отдыхаВолжский прибой, парк-отельКрестовая Падь, отельУсть-Луга, гостиницаЭнергетик, загородный комплексМечта, парк-отельПоместье озера Сиркоярви, б/оРадуга, база отдыхаСказка, база отдыхаАлтын-Кёль, база отдыхаБайкальские сезоныХозяин, база отдыхаИволга, турбазаКумуткан, база отдыхаСойкино, база отдыхаШиболово-Горки, коттеджный комплексНалитово, база отдыхаХалле, апартаментыБерезка, база отдыхаШкипер, гостевой домДафна, отельМонБлан, гост. комплексАдреналин, база отдыхаЛавола, яхт-клубАзур, гостевой домАлая роза, SPA-комплексБеличье, турбазаРусская Кузя, усадьбаДивеевская слобода, ГКБелорецк, гостиницаЗолотые Барханы, база отдыхаЛюбимовская, база отдыхаPiter House, отельНебесное озеро, база отдыхаГуд Лайф, турбазаГоризонт Патио, гост.комплексСиний Утес, санаторийОнега, база отдыхаБригантина, база отдыхаAldego Village, отельГолубино, лесной отельГостиный дом, отельЭдельвейс, гост. комплексАсыл Ъяр, база отдыхаТрикотажница, база отдыхаЕвразия, гостиницаЗеленая долина, база отдыхаЗамок на оз.Увильды, база отдыхаТау-Таш, комплексПыхта, база отдыхаБелая Медведица, база отдыхаСССР, загородный клубДеулино, эко-отельТайга, горный приютДарданеллы, база отдыхаАймак, база отдыхаЧерные камни, база отдыхаРадуга, санаторийCronwell Park «Яхонты Таруса»Красный камень, база отдыхаАквапарк Кум-Куль, база отдыхаБеретская поляна, база отдыхаЯсенок, санаторийВиП, гостиницаПужалова гора, ГКРайгород, турбаза Ветлуга, база отдыхаРанчо, отельРаздолье, туркомплексСосновый бор, база отдыхаОзёрный рай, база отдыхаКедровка-SPA, база отдыхаEco Village, база отдыхаКорабль, апарт-отельСадко, база отдыхаЗаповедные Устья, база отдыхаТанып, санаторийМир маяков, база отдыхаВолынь, загородный отельЗеркальный карп, база отдыхаДальний кордон, рыбацкий клубРаменки, туркомплексПриозерье, база отдыхаОстров, эко-клубСеребряный ключ, СРКФорелька, база отдыхаПодсолнух, база отдыхаСтёпаново, база отдыхаЗвезда, парк отдыхаТихие зори, база отдыхаБережки-Холл, SPA-отельКоршуны, агроусадьбаКрутики, загородный комплексПиренга, база отдыхаОлонка, гостевой комплексАвиатор, база отдыхаРомантик, загородный клубФорест парк, спортивный комплексДельта-Трофи, база отдыхаСосновый бор, база отдыхаСиндбад, гостевой домБанное, горнолыжный турБарские забавы, база отдыхаЛунево, санаторийВоробьи, пансионатБузулукский Бор, санаторийМана, база отдыхаМикли-Ольгино, хуторЗолотой оазис, гост. комплексСосновый бор, база отдыхаКрай леса, апартаментыПодворье, гостевой домИ Хостел, хостелГостевой двор, пансионатУсадьба ВедроваДружба-2 в Дубках, усадьбаФортуна, гостиницаСедьмое небо, туркомплексГремячево, база отдыхаЛесная, база отдыхаКолибри, гостевой дом4 сезона, гостевой домАкварель, комплекс отдыхаSled Hotel, гостиницаРожство,эко-усадьбаГАММА, курортный комплексСпутник, мини-отельДворик, гостевой домЗолотое кольцо, отельБрусника, коттедж-клубГеленджикская бухта, пансионатКалацкое, база отдыхаЕвразия, отельГрин Парк, гостевой комплексСосновая гора, загородный отельБерендей, ландшафтный паркПески, загородный клубДербовеж, парк-отельИзбушка с банькой, гостевой домГардарика, отель-клубВеликодворье, гост. комплексСуйсарь, загородный комплексWoods Lake ResortСветлана, база отдыхаЛето, база отдыхаЭпос, гостиницаСпасское, парк-отель Веселый Жираф, хостелЦентара, база отдыхаМонерон, санаторий Лосевская, база отдыхаТихая заводь, база отдыхаРусь, база отдыхаМарциальные воды, санаторийЧерное море, гостиницаСеребро Онеги, загородный комплексФонГрад, SPA-отельКупеческий дворик, гостиницаЛюбава, база отдыхаЛагуна, база отдыхаЛесотель, гост. комплексГора Веселая, тур.комплексШамбала К, турбаза Химик, санаторийРусич, туристическая базаКедровая заимка, база отдыхаАлтайский замок, санаторийАдару, пансионатЗеленый остров, тур. комплексАлтай, гостиницаАргут, турбазаАлтай Star, база отдыхаФеникс, гостиничный комплексРусский отдых, база отдыхаАстра, база отдыхаСиняя птица, база отдыхаРевин хутор, база отдыхаЮный каспиец, база отдыхаДом Рыбака, база отдыхаДве реки, гостиничный комплексСосновый бор, база отдыхаЗаря, гостиницаКупеческая усадьба, гост. комплексУсадьба Репино, дачный клуб Рублевка, база отдыхаGallery Park Volgograd, отельКомёла, Резиденция (база отдыха)Лайтури, туристическая базаВысоковское, экзопаркОстров, база отдыхаВилла Фортеция, отельРусское подворье, турбазаРадуга, центрНатали, мини-отель на БайкалеНабаймар, отель-турбазаДанко, база отдыхаВоробьевы горы, центр отдыхаВетер странствий, база отдыхаАзатей, гостиный дворМыс Котельниковский, база отдыхаЛюмьер, арт-отельАморе, гостевой домСафари Паркъ, база отдыхаGreen Park Kaluga HotelСолнечная на Оке, база отдыхаАласари, база отдыхаРускеала, база отдыхаЛамберг, загородный клубДлинный берег, база отдыхаСеверное сияние, база отдыхаУрозеро, турбазаКудама, туркомпелкс Heliopark Eco&Spa Medical Karelia (Дворцы, санаторий)Кемпинг Сандал, база отдыхаБегемот, база отдыхаЖуравель, база отдыхаСендега, база отдыхаShelestoff 3*, отельКрутояр, база отдыхаСанаторий имени Ивана СусанинаЩелыково, санаторийСеребряный плес, spa-курортОзеро Удачи, база отдыха Курочка Ряба, база отдыха Три капитана, дом отдыхаСосна, база отдыхаМаяк-гостиница, теплоходФрунзенец, база отдыхаМечта, пансионатТобол, база отдыха Green Village, загородный комплексАмпиала, усадьбаКобона, база отдыхаЛамбушка, турбазаМандроги, тур. комплексНева Дельта, ОтельAZIMUT Олимпик Москва, отельЮность, пансионатСолонцово, СОКРыбацкое подворье ВладимировкаКаширские роднички, санаторийДружба, пансионатВербилки, ПансионатФлораПарк, база отдыхаРанчо, агроусадьбаСоветская, гостиницаПарголово, комплекс отдыхаКрасный курган, база отдыхаПарус, отельСеребро, загородный отель Nord Castle, бутик-отельМаяк, яхт-клубСинеморье, пансионатУсадьба в БольшекулачьеСеребряный бор, загор. комплексЗотино, база отдыхаБлагодать, загородный отельХуторок Озерный, база отдыхаDream Bay, База отдыхаМаяк, жилой комплексАфродита, база отдыхаУ Покровки, гостевой домПушкиногорье, база отдыхаЧеремушки, база отдыхаМалиновка, турбазаТри пескаря, тур. комплексМаяк, гостиничный комплексГорки, актив-отельУргун, тур.комплексАбзаково-Weekend, гостиницаАльпин Шале, отельLido Hotel 3*, отельРубин-тур, база отдыхаЮматово, санаторийСалика, база отдыхаЗвениговская, база отдыхаКарельская, база отдыхаЯлга, оздоровительный комплексСмольный, База отдыхаРечная сказка, база отдыхаНа Черкасском тракте, загор. клубМалинка, центр отдыхаОкская Жемчужина, комплекс Дубки у Валентины, база отдыхаЦиолковский, заг. комплекс Ясная поляна, база отдыхаДубрава, парк-отельКрылатый, мини-отельAVS ОтельЛафер, Отель-усадьбаЭко Усадьба Витрино, база отдыхаДворянское гнездо, гост. комплексДержава, гостиница Торопаца, база отдыхаЗаручевье, пансионатСветлица, загородный отельСелигерское Заплавье, база отдыхаСказка Русь, загородный комплексПроховское подворье, база отдыхаМежутоки, база отдыхаСелигерская пасека, дом отдыхаСелигер для Вас, база отдыхаКраинка, санаторийРаздолье, загородный центрБерезовая роща, санаторийАван, загородный клубВертикаль, Трехгорье, гостиницаRoyal Palace, гост. комплексДома Углича, гостевой комплексОрхидея, отельПодозёрка, гостиница-усадьбаЛионъ, гостиницаСосновый бор, санаторийВладимирский хуторок, б/оУ горы Кошка, гостевой домНева, отельАжур Приисковый, резиденцияМедвежонок, гостевой домОзеро Врево, комплексКурьи, санаторийБайкальский маяк, гостевой домГладенькая, спорт-отельБарракуда, отельКолыбель, база отдыха SnowDali, развлекательный комплексУсадьба, эко-клубСиний утес, база отдыхаСитинка, база отдыхаПик Черского, гост. комплексОзерная, база отдыхаТербунское Лукоморье, базаAloha, сёрф-базаМастер, база отдыхаИзумруд, отельЛукоморье, база отдыхаБылина, пансионатКалинино, база отдыхаЭнэктур, гостиницаСкала Монах, тур. комплексРогожкино, загородный отельСветофор, база отдыхаУ горы Волчиха, загородный клубРусский остров, база отдыхаКасарги, загородный комплексГорный приют Иремель, турбазаРайдер, отельБерендеев лес, загородный клубБоярская станица, центр отдыхаРусь, база отдыхаОльга, отельСнежинка, гостиницаЦарский двор, гостиницаОсташевская, гостиницаЧудной двор, база отдыхаЛесное озеро, база отдыха«Маральник «Никольское», база отдыхаНа Сиреневой, гостевой домБерег солнца, центр отдыхаГолубая волна, база отдыхаЯхтКлуб, гостевой домСолнечный остров, база отдыхаЮный геолог, база отдыхаДружба Ямал, центр отдыхаТихая полянка, мини-отельОзеро Светлое, база отдыхаАршанский бор, гостевой домШахтер, пансионатНахалёнок, гостевой домБлагодать, гостевой домТеплый стан, база отдыхаАтлантида, отельРусалочка, База отдыхаАнапа-Океан, санаторийМонарх, отель Luna, пляж-отельАммонит, гостевой домЛань, туркомплексДельфин, отельНадежда, санаторийБерезки, эко-санаторийХалюта, эко-турбазаРУСЬ, отельНочной квартал, гостиницаЮлена, гостевой комплексОять, база отдыхаЮЛЕНА, гостевой комплексУсадьба Васильевых, гостевой домЛесная поляна, гостевой домНефтяник, загородный клубЦарская охота, клуб-отельВоскресенскаяРомашка, гостевой домОлимп, отельСлавия, гостиницаСосновый бор, база отдыхаНептун, база отдыхаСидими, база отдыхаЛивадия, гост. комплексБерендей, база отдыхаРоссиянка, база отдыхаОлимпийская высота, гостевой домДомик у причала, отельДом Охотника, гостевой домКоммуналка, арт-хостелХуторок ОзёрныйБелая река, отельСлавяновский исток, отельТри медведя, загородный отельDeja Vu, база отдыхаАлтайская сказка, отельГорная сказка, турбазаДинамо, база отдыхаОзерки, парк-отельОлимп, база отдыхаКаракольские озера, турбазаОМ-тур, база отдыхаСанрайс, гостиницаДомик Ильича, база отдыхаГрэгори Клаб, база отдыхаКамелот, апарт-отельМорской, гостевой домСолнечная поляна, усадьбаЗатерянный рай, база отдыхаЕвропа в Шапках, База отдыхаПартия, развлекат. комплексНовый Эдем, пансионатОкатур, дачный комплексLeontopodium, гостевой домДом охотника и рыбака, гост. домВеселая белка, гостевой домЗеленый Мыс, база отдыхаЗолотая подкова, тур. комплексОнегин, гостиничный комплексМечта, пансионатМихайловское, спа-отельГорница, гостевой домСанаторий им. Н.М. ПржевальскогоЛукоморье, база отдыхаЛесной, гостевой дворикПетра, гостевой домАлия, гостиницаБарская усадьба, гостиницаАквамарин, отель&СПААнашенский бор, база отдыхаМария, гостиницаGreen Gold Park, загор. комплексЕмеля, гостиницаPapaуa Park Hotel, отельСемигорье, усадьбаАрли, отельБерезовый мостик, эко-комплексGolden Hills, гост. комплексАнапа Лазурная, отельКонтинент, отельЗвездный, отельПраздник Ивана КупалаОдеон, отельОлимпик, гостиничный комплексАйская долина, база отдыхаЛорис, гостевой домКруглое озеро, усадьбаОзерки, парк-отель Виктория, гостиничный комплексВилла Алла, гостиничный комплексСканТур, туроператорMariSol, гостиничный комплексСпорт Инн, отельСплав по Мане с НарвыШихан, курортный отельКемер, отельРусь, отельРезиденция иОфахРауту, ресторан отель Валентин, гостевой домЖираф, гостиница (гостиница закрылась)Леон, гостевой домСудак, хостелДивное, комплексАктив Урал, сплав по реке ЧусоваяОдиссея, турбазаGrand-Shato, отельБелый марал, туркомплексЗолотая подкова, бутик-отельИскра, туркомплексРусский дом, база отдыхаСтолица мира, туркомплексЗаимка рыбная, база отдыхаОстров, гостевой дом Маленькая Италия, отельРадуга, база отдыхаЮжная, база отдыхаСеверная, гостиницаSilky Way, бутик-отельИскра, туристический комплексВолгореченск, гостиница Завидово, кемпингВ сосновом бору, комплексЧерная горка, база отдыха Солнечный ветер, астроотельИмпериал, бизнес-отельВеселая деревня, база отдыхаВосток, база отдыхаPerfect На Невском, 51, мини-отельНика, отельТри мушкетера, отельЮхновград, парк-отель Забава, загородный клубДикий Урал, база отдыхаGreen Dacha, база отдыха Карагайский бор, санаторийТуроператор Отрада, автобусный тур в Соль-ИлецкАйсберг Угры, парк-отельАлино, загородный отельЛесная сказка, гост. комплексВеста, отельНиагара, гостиницаУсадьба Ярцевых, база отдыхаУ МишАни, усадьбаБайкал-Майами, гостевой домОзеро Дивное, эко-отельКвамманга 2018, фестивальНэста, гостевой домЧемал, тур-отельРакета, апартаменты Сальвадор, отельAsana Yoga Fest 2018, фестивальСреда, эко-хостелАммонит, гостевой домТуроператор Небо56, автобусный тур в КрасноусольскЖан Поль, мини-отельЯкорь, отельVolkoff Sky, загородный клубArt Hotel, гостиница Amshin, отельВерховье, отельБлагодать, база отдыхаМаргобай, гостевой домНовые озера, комплекс отдыхаАристократ, отельАпартаменты у Приморского паркаZoo, мини-отельАпарт-отель «На Березовой» Туроператор «Глобус-Турс»Ярославна, отельТоропаца, база эко-отдыхаПобеда, база отдыхаНа Кузнецком, мини-отельМедовуха, база отдыхаГостиный двор Большая 12, отельБоярский двор, гостиницаGuest House Ustje, гостевой дом Лазурный берег на Оке, парк-отельАэлита, парк-отельСапфир, отельКедр, усадьбаHotel LOFT PtzМаяк, Эко-отельОлимп-Парк 3*, гостин.комплексЛафер Ренессанс Hotel & SpaSoroka Home, гостевой дом На Первом, база отдыхаTUNING OPEN FEST ’22», фестивальАрхстояние, фестивальЗолотая Юрта, этно-паркМороженое-2022, фестивальGreenway, парк-отельНевский 3, гостевой домИсаково, гостевая деревня

Геномы новых микробных линий, собранных из подледных вод озера Байкал

1. Хэмптон С.Е., Изместьева Л.Р., Мур М.В., Кац С.Л., Деннис Б., Силов Е.А. 2008. Шестьдесят лет экологических изменений в крупнейшем в мире пресноводном озере Байкал в Сибири. Глоб Изменение Биол 14:1947–1958. doi: 10.1111/j.1365-2486.2008.01616.x. [CrossRef] [Google Scholar]

2. Курилкина М.И., Захарова Ю.Р., Галачянц Ю.П., Петрова Д.П., Букин Ю.С., Домышева В.М., Блинов В.В., Лихошвай Ю.В. 2016. Состав бактериального сообщества в водной толще самого глубокого пресноводного озера Байкал, определенный с помощью секвенирования нового поколения. FEMS Microbiol Ecol 92:fiw094. doi: 10.1093/femsec/fiw094. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

3. Галази Г. 1993. Атлас озера Байкал. ГУГК, Москва, Россия: [Google Scholar]

4. Шимараев М., Гранин Н., Жданов А. 1993. Глубокая вентиляция вод Байкала за счет весенних термобаров. Лимнол Океаногр 38:1068–1072. doi: 10.4319/lo.1993.38.5.1068. [CrossRef] [Google Scholar]

5. Шимараев М., Верболов В., Гранин Н., Шерстаянкин П. 1994. Физическая лимнология озера Байкал: обзор. Байкал Междунар. Центр Экол. Рез. [Академия Google]

6. Нагата Т., Такай К., Каванобе К., Ким Д-С, Наказато Р., Гусельникова Н., Бондаренко Н., Мологавая О., Кострнова Т., Друкер В., Сато Ю., Ватанабэ Ю. 1994. Автотрофный пикопланктон в южной части озера Байкал: численность, рост и гибель при выпасе летом. Джей Планктон Рез 16:945–959. doi: 10.1093/планкт/16.8.945. [CrossRef] [Google Scholar]

7. Вайс Р., Кармак Э., Коропалов В. 1991. Глубоководное обновление и биопродукция в озере Байкал. Природа 349:665. дои: 10.1038/349665а0. [CrossRef] [Google Scholar]

8. Katano T, Nakano S-i, Ueno H, Mitamura O, Anbutsu K, Kihira M, Satoh Y, Drucker V, Sugiyama M. 2005. Численность, рост и скорость выпаса пикофитопланктона в Баргузинском заливе оз. Байкал. Акват Эколь 39:431–438. doi: 10.1007/s10452-005-9000-8. [CrossRef] [Google Scholar]

9. Накано С., Митамура О., Сугияма М., Масленников А., Нишибе Ю., Ватанабэ Ю., Друкер В. 2003. Вертикальная структура планктона в центральной котловине оз. Байкал летом 1999, со специальной ссылкой на микробную пищевую сеть. Лимнология 4: 155–160. doi: 10.1007/s10201-003-0100-7. [CrossRef] [Google Scholar]

10. Вотинцев К., Поповская Г. 1979. Своеобразие биотического круговорота в озере Байкал. Доклад Академии Наук СССР 216: 666–669. [Google Scholar]

11. Кожова О. 1987. Фитопланктон озера Байкал: структурно-функциональная характеристика. Arch Hydrobiol Beih 25:19–37. [Google Scholar]

12. Вотинцев К., Мещерякова А., Поповская Г. 1975. Круговорот органического вещества в озере Байкал. Наука, Новосибирск. [Google Scholar]

13. Башенхаева М.В., Захарова Ю.Р., Петрова Д.П., Ханаев И.В., Галачянц Ю.П., Лихошвей Ю.В. 2015. Подледные микроводорослевые и бактериальные сообщества в пресноводном озере Байкал, Россия. Микроб Экол 70:751. doi: 10.1007/s00248-015-0619-2. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

14. Бондаренко Н.А., Белых О.И., Голобокова Л. П., Артемьева О.В., Логачева Н.Ф., Тихонова И.В., Липко И.А., Косторнова Т.Ю., Парфенова В.В., Ходжер Т.В., Ан Т.С., Зо Ю.Г. 2012. Стратифицированное распределение биогенных элементов и экстремофильной биоты в пределах пресноводного льда, покрывающего поверхность озера Байкал. Дж Микробиол 50:8–16. doi: 10.1007/s12275-012-1251-1. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

15. Бондаренко Н., Белых О., Голобокова Л., Артемьева О., Логачева Н., Тихонова И., Липко И., Косторнова Т. Ю., Парфенова В., Ходжер Т. 2013. Химический состав, бактериальные и водорослевые сообщества льда Байкала. Гидробиол J 49:12–26. doi: 10.1615/HydrobJ.v49.i3.20. [CrossRef] [Google Scholar]

16. Белькова Н., Парфенова В., Косторнова Т. Ю., Денисова Л. Ю., Зайчиков Е. 2003. Микробное биоразнообразие в воде озера Байкал. микробиология 72:203–213. дои: 10.1023/A:1023224215929. [CrossRef] [Google Scholar]

17. Михайлов И., Захарова Ю.Р., Галачянц Ю.П., Усольцева М., Петрова Д., Сакирко М., Лихошвай Ю. В., Грачев М.А. Сходство структуры таксономических бактериальных сообществ в фотическом слое трех бассейнов оз. Байкал, различающихся по составу и численности весеннего фитопланктона. Докл Биохим Биофиз 465: 413–419. дои: 10.1134/S1607672915060198. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

18. Acinas SG, Sarma-Rupavtarm R, Klepac-Ceraj V, Polz MF. 2005. Артефакты и предвзятость последовательности, вызванные ПЦР: выводы из сравнения двух библиотек клонов 16S рРНК, созданных из одного и того же образца. Appl Environ Microbiol 71:8966–8969. doi: 10.1128/AEM.71.12.8966-8969.2005. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

19. Kennedy K, Hall MW, Lynch MD, Moreno-Hagelsieb G, Neufeld JD. 2014. Оценка смещения профилей бактериального гена 16S рРНК на основе Illumina. Appl Environ Microbiol 80:5717–5722. doi: 10.1128/АЕМ.01451-14. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

20. Parks DH, Imelfort M, Skennerton CT, Hugenholtz P, Tyson GW. 2015. CheckM: оценка качества микробных геномов, восстановленных из изолятов, отдельных клеток и метагеномов. Геном Res 25:1043–1055. doi: 10.1101/гр.186072.114. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

21. Mizuno CM, Rodriguez-Valera F, Ghai R. 2015. Геномы планктонных Acidimicrobiales : расширение горизонтов морских актинобактерий с помощью метагеномики. mBio 6:e02083-14. doi: 10.1128/mBio.02083-14. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

22. Ghai R, Mizuno CM, Picazo A, Camacho A, Rodriguez-Valera F. 2014. Ключевые роли пресноводных актинобактерий выявлены с помощью глубокого метагеномного секвенирования. Мол Эколь 23:6073–6090. doi: 10.1111/mec.12985. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

23. Hugerth LW, Larsson J, Alneberg J, Lindh MV, Legrand C, Pinhassi J, Andersson AF. 2015. Геномы, собранные в метагеноме, раскрывают глобальный солоноватый микробиом. Геном Биол 16:1–18. doi: 10.1186/s13059-014-0572-2. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

24. Mehrshad M, Amoozegar MA, Ghai R, Fazeli SAS, Rodriguez-Valera F. 2016. Реконструкция генома на основе наборов метагеномных данных выявила новые микробы в солоноватых водах Каспийского моря. Appl Environ Microbiol 82:1599–1612. doi: 10.1128/AEM.03381-15. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

25. Neuenschwander SM, Ghai R, Pernthaler J, Salcher MM. 13 Октябрь 2017. Микродиверсификация вездесущих пресноводных актинобактерий с оптимизированным геномом. ISME J doi: 10.1038/ismej.2017.156. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

26. Кан И, Ким С, Ислам М. Р., Чо Дж. К. 2017. Первые полные последовательности генома линии acI, наиболее распространенной пресноводной актинобактерии, полученные путем полногеномной амплификации культур от разведения до исчезновения. научный представитель 7:42252. дои: 10.1038/srep42252. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

27.

Дрисколл С.Б., Оттен Т.Г., Браун Н.М., Дреер Т.В. 2017. На пути к давно читаемой метагеномике: полная сборка трех новых геномов бактерий, зависящих от диазотрофной цианобактерии, в совместном культивировании в пресноводном озере. Стенд Геномная наука 12:9. doi: 10.1186/s40793-017-0224-8. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

28. Weon H-Y, Song M-H, Son J-A, Kim BY, Kwon S-W, Go S-J, Stackebrandt E. 2007. Flavobacterium terrae sp. ноябрь и Flavobacterium cucumis sp. nov., выделенный из тепличного грунта. Int J Syst Evol Microbiol 57:1594–1598. doi: 10.1099/ijs.0.64935-0. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

29. Scanlan DJ, Ostrowski M, Mazard S, Dufresne A, Garczarek L, Hess WR, Post AF, Hagemann M, Paulsen I, Partensky F. 2009. Экологическая геномика морских пикоцианобактерий. Микробиол Мол Биол Рев 73:249–299. doi: 10.1128/MMBR.00035-08. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

30. Гросс Р., Гусман К.А., Себайхия М.

, Дос Сантос В.А.М., Пипер Д.Х., Коебник Р., Лехнер М., Бартельс Д., Бурместер Дж., Чоудхури Дж.В., Эбенсен Т., Гайгалат Л., Херрманн С., Хачане А.Н., Лариш С., Линк С., Линке Б., Мейер Ф., Морманн С., Накунст Д., Ракерт С., Шнайкер-Бекель С., Шульце К., Форхолтер Ф.-Дж., Евса Т., Энгл Дж. Т., Goldman WE, Puhler A, Gobel UB, Goesmann A, Blocker H, Kaiser O, Martinez-Arias R. 2008. Недостающее звено: Bordetella petrii наделена как метаболической универсальностью экологических бактерий, так и чертами вирулентности патогенных бордетелл. Геномика BMC 9:449. дои: 10.1186/1471-2164-9-449. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

31. Lonhienne TG, Sagulenko E, Webb RI, Lee K-C, Franke J, Devos DP, Nouwens A, Carroll BJ, Fuerst JA. 2010. Эндоцитозоподобное поглощение белка бактерией Gemmata obscuriglobus. Proc Natl Acad Sci U S A 107:12883–12888. doi: 10.1073/pnas.1001085107. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

32. Vieira S, Luckner M, Wanner G, Overmann J. 2017. Luteitalea pratensis род. ноябрь, сп. ноябрь новый член подразделения 6 Acidobacteria, выделенный из пастбищной почвы умеренного пояса. Int J Syst Evol Microbiol 67: 1408–1414. дои: 10.1099/ijsem.0.001827. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

33. DeBruyn JM, Nixon LT, Fawaz MN, Johnson AM, Radosevich M. 2011. Глобальная биогеография и количественная сезонная динамика Gemmatimonadetes в почве. Appl Environ Microbiol 77:6295–6300. doi: 10.1128/AEM.05005-11. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

34. Zeng Y, Baumbach J, Barbosa EGV, Azevedo V, Zhang C, Koblížek M. 2016. Метагеномные доказательства присутствия фототрофных бактерий Gemmatimonadetes в различных средах. Представитель Environ Microbiol 8:139–149. дои: 10.1111/1758-2229.12363. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

35. Zeng Y, Feng F, Medová H, Dean J, Koblížek M. 2014. Функциональные фотосинтетические реакционные центры 2-го типа обнаружены у редкого бактериального типа Gemmatimonadetes. Proc Natl Acad Sci U S A 111:7795–7800. doi: 10.1073/pnas.1400295111. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

36. Zeng Y, Selyanin V, Lukeš M, Dean J, Kaftan D, Feng F, Koblížek M. 2015. Характеристика микроаэрофила, бактериохлорофилла a -содержащая бактерия Gemmatimonas phototrophica sp. nov., и измененные описания родов Gemmatimonas и Gemmatimonas aurantiaca . Int J Syst Evol Microbiol 65:2410–2419. doi: 10.1099/ijs.0.000272. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

37. DeBruyn JM, Fawaz MN, Peacock AD, Dunlap JR, ​​Nixon LT, Cooper KE, Radosevich M. 2013. Gemmatirosa kalamazoonesis род. ноябрь, сп. nov., представитель редко культивируемого бактериального типа Gemmatimonadetes. J Gen Appl Microbiol 59: 305–312. doi: 10.2323/jgam.59.305. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

38. Falkner KK, Measures CI, Herbelin SE, Edmond JM, Weiss RF. 1991. Геохимия главных и малых элементов озера Байкал. Лимнол Океаногр 36:413–423. doi: 10.4319/lo.1991.36.3.0413. [CrossRef] [Google Scholar]

39. Грачев М. 2002. О современном состоянии экологической системы озера Байкал. СО РАН, Новосибирск, Россия. [Google Scholar]

40. Salcher MM, Neuenschwander SM, Posch T, Pernthaler J. 2015. Экология пелагических пресноводных метилотрофов, оцененная с помощью кампании мониторинга и изоляции с высоким разрешением. ИСМЕ J 9:2442. doi: 10.1038/ismej.2015.55. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

41. Hoetzinger M, Schmidt J, Jezberová J, Koll U, Hahn MW. 2017. Микродиверсификация пелагических видов Polynucleobacter в основном обусловлена ​​приобретением геномных островов из частично межвидового генофонда. Appl Environ Microbiol 83: e02266–16. doi: 10.1128/AEM.02266-16. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

42. Hahn MW, Scheuerl T, Jezberová J, Koll U, Jezbera J, Šimek K, Vannini C, Petroni G, Wu QL. 2012. Пассивный, но успешный способ планктонной жизни: геномный и экспериментальный анализ экологии свободноживущей популяции полинуклеобактерий. PLoS Один 7:e32772. doi: 10.1371/journal.pone.0032772. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

43. Джезбера Дж., Джезберова Дж., Брандт У., Хан М.В. 2011. Повсеместное распространение асимбиотического подвида Polynucleobacter necessarius является результатом экологической диверсификации. Окружающая среда микробиол 13:922–931. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02396.x. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

44. Jezberová J, Jezbera J, Brandt U, Lindström ES, Langenheder S, Hahn MW. 2010. Повсеместное распространение Polynucleobacter necessarius ssp. asymbioticus в неподвижных пресноводных местообитаниях неоднородного 2000 км ² район. Окружающая среда микробиол 12: 658–669. doi: 10.1111/j.1462-2920.2009.02106.x. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

45. Giovannoni SJ, Thrash JC, Temperton B. 2014. Последствия оптимизации теории микробной экологии. ИСМЕ J 8:1553. doi: 10.1038/ismej.2014.60. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

46. Ghai R, McMahon KD, Rodriguez-Valera F. 2012. Нарушение парадигмы: космополитические и обильные пресноводные актинобактерии имеют низкий GC. Представитель Environ Microbiol 4:29–35. doi: 10.1111/j.1758-2229.2011.00274.x. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

47. Giovannoni SJ, Tripp HJ, Givan S, Podar M, Vergin KL, Baptista D, Bibbs L, Eads J, Richardson TH, Noordewier M, Rappe MS, Short JM, Кэррингтон Дж. К., Матур Э. Дж. 2005. Оптимизация генома космополитической океанической бактерии. Наука 309: 1242–1245. [PubMed] [Google Scholar]

48. Джованнони С.Дж., Бричги Т.Б., Мойер С.Л., Филд К.Г. 1990. Генетическое разнообразие бактериопланктона Саргассова моря. Природа 345:60–63. дои: 10.1038/345060a0. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

49. Моррис Р.М., Раппе М.С., Коннон С.А., Вергин К.Л., Зибольд В.А., Карлсон К.А., Джованнони С.Дж. 2002. Клада SAR11 доминирует в сообществах бактериопланктона на поверхности океана. Природа 420:806. doi: 10.1038/nature01240. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

50. Grote J, Thrash JC, Huggett MJ, Landry ZC, Carini P, Giovannoni SJ, Rappé MS. 2012. Оптимизация и сохранение основного генома среди сильно различающихся членов клады SAR11. mBio 3:e00252-12. doi: 10.1128/mBio.00252-12. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

51. Herlemann DP, Woelk J, Labrenz M, Jürgens K. 2014. Разнообразие и численность «Pelagibacterales» (SAR11) в градиенте солености Балтийского моря. Сист Аппл Микробиол 37: 601–604. doi: 10.1016/j.syapm.2014.09.002. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

52. Oh HM, Kang I, Lee K, Jang Y, Lim S-I, Cho JC. 2011. Полная последовательность генома штамма IMCC9063, принадлежащего к подгруппе 3 SAR11, выделенного из Северного Ледовитого океана. J Бактериол 193:3379–3380. doi: 10.1128/JB.05033-11. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

53. Zaremba-Niedzwiedzka K, Viklund J, Zhao W, Ast J, Schyrba A, Woyke T, McMahon K, Bertilsson S, Stepanauskas R, Andersson SG. 2013. Одноклеточная геномика выявляет низкие частоты рекомбинации у пресноводных бактерий клады SAR11. Геном Биол 14:R130. doi: 10.1186/gb-2013-14-11-r130. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

54. Salcher MM, Pernthaler J, Posch T. 2011. Динамика сезонного цветения и экофизиология пресноводных сестринских бактерий SAR11, «которые правят волнами» (LD12). ИСМЕ J 5:1242. doi: 10.1038/ismej.2011.8. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

55. Элеви Бардавид Р., Орен А. 2012. Кислотно-смещенные изоэлектрические точечные профили белков гиперсоленого микробного мата: адаптация к жизни при высоких концентрациях соли? экстремофилы 16: 787–792. doi: 10.1007/s00792-012-0476-6. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

56. Oh S, Zhang R, Wu QL, Liu W-T. 2014. Черновая последовательность генома нового вида клады SAR11, широко распространенного в тибетском озере. Геном объявляет 2(6):e01137-14. doi: 10.1128/genomeA.01137-14. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

57. Кабельо-Йевес П.Дж., Аро-Морено Дж.М., Мартин-Куадрадо А.Б., Гхай Р., Пиказо А., Камачо А., Родригес-Валера Ф. 2017. Новые геномы Synechococcus реконструированы из пресноводных водоемов. Фронт микробиол 8:1151. doi: 10.3389/fmicb.2017.01151. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

58. Hügler M, Sievert SM. 2010. За пределами цикла Кальвина: автотрофная фиксация углерода в океане. Энн Рев Мар Сай 3: 261–289. [PubMed] [Google Scholar]

59. Martinez-Garcia M, Swan BK, Poulton NJ, Gomez ML, Masland D, Sieracki ME, Stepanauskas R. 2012. Высокопроизводительное секвенирование отдельных клеток идентифицирует фотогетеротрофы и хемоавтотрофы в пресноводном бактериопланктоне. ИСМЕ J 6:113–123. doi: 10.1038/ismej.2011.84. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

60. Seo J-S, Keum Y-S, Li QX. 2009. Бактериальная деградация ароматических соединений. Общественное здравоохранение Int J Environ Res 6: 278–309. дои: 10.3390/ijerph6010278. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

61. Arora PK, Bae H. 2014. Бактериальная деградация хлорфенолов и их производных. Факт микробной клетки 13:31. дои: 10.1186/1475-2859-13-31. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

62. Michaelson LV, Napier JA, Molino D, Faure J-D. 2016. Сфинголипиды растений: их значение в клеточной организации и адаптации. Биохим Биофиз Акта 1861:1329–1335. doi: 10.1016/j.bbalip.2016.04.003. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

63. Gronnier J, Germain V, Gouguet P, Cacas J-L, Mongrand S. 2016. GIPC: гликозилинозитолфосфокерамиды, основные сфинголипиды на Земле. Поведение сигнала установки 11:e1152438. дои: 10.1080/15592324.2016.1152438. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

64. Friedrich CG, Bardischewsky F, Rother D, Quentmeier A, Fischer J. 2005. Прокариотическое окисление серы. Курр Опин Микробиол 8: 253–259. doi: 10.1016/j.mib.2005.04. 005. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

65. Ватанабе Т., Кодзима Х., Фукуи М. 2014. Полные геномы пресноводных окислителей серы Sulfuricella denitrificans skB26 и Sulfuritalea hydroivorans sk43H : генетическое понимание пути окисления серы бетапротеобактериями. Сист Аппл Микробиол 37:387–395. doi: 10.1016/j.syapm.2014.05.010. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

66. Könneke M, Bernhard AE, de La Torre JR, Walker CB, Waterbury JB, Stahl DA. 2005. Выделение автотрофного аммиакокисляющего морского археона. Природа 437:543. дои: 10.1038/nature03911. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

67. Daims H, Lebedeva EV, Pjevac P, Han P, Herbold C, Albertsen M, Jehmlich N, Palatinszky M, Vierheilig J, Bulaev A, Kirkegaard RH, von Берген М., Раттей Т., Бендингер Б., Нильсен П.Х., Вагнер М. 2015. Полная нитрификация бактериями Nitrospira. Природа 528:504. дои: 10.1038/nature16461. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

68. Alonso-Sáez L, Waller AS, Mende DR, Bakker K, Farnelid H, Yager PL, Lovejoy C, Tremblay J-É Potvin M, Heinrich Ф., Эстрада М., Риманн Л., Борк П., Педрос-Алио С., Бертилсон С. 2012. Роль мочевины в нитрификации полярными морскими археями. Proc Natl Acad Sci U S A 109: 17989–17994. doi: 10.1073/pnas.1201914109. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

69. Sharma AK, Sommerfeld K, Bullerjahn GS, Matteson AR, Wilhelm SW, Jezbera J, Brandt U, Doolittle WF, Hahn MW. 2009. Гены актинородопсина обнаружены в различных пресноводных местообитаниях и среди культивируемых пресноводных актинобактерий. ИСМЕ J 3:726. doi: 10.1038/ismej.2009.13. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

70. Man D, Wang W, Sabehi G, Aravind L, Post AF, Massana R, Spudich EN, Spudich JL, Béjà O. 2003. Диверсификация и спектральная настройка морских протеородопсинов. ЭМБО J 22: 1725–1731. дои: 10.1093/emboj/cdg183. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

71. Mizuno CM, Rodriguez-Valera F, Kimes NE, Ghai R. 2013. Расширение морской виросферы с помощью метагеномики. Генетика PLoS 9:e1003987. doi: 10.1371/journal.pgen.1003987. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

72. Martín-Cuadrado AB, López-García P, Alba JC, Moreira D, Monticelli L, Strittmatter A, Gottschalk G, Rodríguez-Valera F. 2007. Метагеномика глубокого Средиземноморья, теплой батипелагической среды обитания. PLoS Один 2:e914. doi: 10.1371/journal.pone.0000914. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

73. Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T. 1989. Молекулярное клонирование: лабораторное пособие. Лабораторный пресс Колд-Спринг-Харбор, Колд-Спринг-Харбор, Нью-Йорк. [Google Scholar]

74. Peng Y, Leung HC, Yiu S-M, Chin FY. 2012. IDBA-UD: ассемблер de novo для данных одноклеточного и метагеномного секвенирования с очень неравномерной глубиной. Биоинформатика 28:1420–1428. doi: 10.1093/биоинформатика/bts174. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

75. Hyatt D, Chen G-L, LoCascio PF, Land ML, Larimer FW, Hauser LJ. 2010. Prodigal: распознавание прокариотических генов и идентификация сайта инициации трансляции. БМК Биоинформатика 11:1. дои: 10.1186/1471-2105-11-1. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

76. Lowe TM, Eddy SR. 1997. tRNAscan-SE: программа для улучшенного обнаружения генов транспортной РНК в геномной последовательности. Нуклеиновые Кислоты Res 25:955–964. doi: 10.1093/нар/25.5.0955. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

77. Навроцкий Е. 2009. Поиск и выравнивание структурной гомологии РНК с использованием моделей ковариации. кандидатская диссертация Вашингтонский университет в Сент-Луисе, Сент-Луис, Миссури. [Google Scholar]

78. Навроцкий Е.П., Эдди С.Р. 2010. ssu-align: инструмент для структурного выравнивания последовательностей рРНК SSU. http://eddylab.org/software/ssu-align/.

79. Хуанг Ю., Гилна П., Ли В. 2009. Идентификация генов рибосомных РНК в метагеномных фрагментах. Биоинформатика 25:1338–1340. doi: 10.1093/биоинформатика/btp161. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

80. Татусов Р.Л., Натале Д.А., Гаркавцев И.В., Татусова Т.А., Шанкаварам У.Т., Рао Б.С., Кирютин Б., Гальперин М.Ю., Федорова Н.Д., Кунин Е.В. 2001. База данных COG: новые разработки в филогенетической классификации белков из полных геномов. Нуклеиновые Кислоты Res 29:22–28. doi: 10.1093/нар/29.1.22. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

81. Haft DH, Loftus BJ, Richardson DL, Yang F, Eisen JA, Paulsen IT, White O. 2001. TIGRFAM: ресурс семейства белков для функциональной идентификации белков. Нуклеиновые Кислоты Res 29: 41–43. doi: 10.1093/нар/29.1.41. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

82. Rice P, Longden I, Bleasby A. 2000. EMBOSS: Европейский пакет открытого программного обеспечения для молекулярной биологии. Тенденции Жене 16: 276–277. doi: 10.1016/S0168-9525(00)02024-2. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

83. Lê S, Josse J, Husson F. 2008. FactoMineR: пакет R для многофакторного анализа. Программное обеспечение J Stat 25:1–18. [Google Scholar]

84. Альтшул С.Ф., Мэдден Т.Л., Шеффер А.А., Чжан Дж., Чжан З., Миллер В., Липман Д.Дж. 1997. Gapped BLAST и PSI-BLAST: новое поколение программ поиска белковых баз данных. Нуклеиновые Кислоты Res 25:3389–3402. doi: 10.1093/нар/25.17.3389. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

85. Кирс М., Мойр Р., Уилсон А., Стоунз-Хавас С., Чунг М., Старрок С., Бакстон С., Купер А., Марковиц С., Дюран С. , Тьерер Т., Эштон Б., Мейнтис П., Драммонд А. 2012. Geneious Basic: интегрированная и расширяемая настольная программная платформа для организации и анализа данных о последовательностях. Биоинформатика 28: 1647–1649. doi: 10.1093/биоинформатика/bts199. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

86. Edgar RC. 2010. Поиск и кластеризация на несколько порядков быстрее, чем BLAST. Биоинформатика 26:2460–2461. doi: 10.1093/биоинформатика/btq461. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

87. Lassmann T, Sonnhammer EL. 2005. Kalign — точный и быстрый алгоритм множественного выравнивания последовательностей. БМК Биоинформатика 6:1. дои: 10.1186/1471-2105-6-1. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

88. Капелла-Гутьеррес С., Силья-Мартинес Х.М., Габальдон Т. 2009. trimAl: инструмент для автоматической обрезки выравнивания в крупномасштабном филогенетическом анализе. Биоинформатика 25:1972–1973. doi: 10.1093/биоинформатика/btp348. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

89. Прайс М.Н., Дехал П.С., Аркин А.П. 2010. FastTree 2 — приблизительно деревья максимального правдоподобия для больших выравниваний. PLoS Один 5:e9490. doi: 10.1371/journal.pone.0009490. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

90. Сегата Н., Бёрниген Д., Морган Х.С., Хаттенхауэр К. 2013. PhyloPhlAn — это новый метод улучшенного филогенетического и таксономического размещения микробов. Нац Коммуна 4:2304. дои: 10.1038/ncomms3304. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

91. Паес-Эспино Д., Элоэ-Фадрош Э.А., Павлопулос Г.А., Томас А.Д., Хантеманн М., Михайлова Н., Рубин Э., Иванова Н.Н., Кирпидес Н.С. 2016. Раскрытие вирома Земли. Природа 536: 425–430. дои: 10.1038/nature19094. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

92. Coutinho FH, Silveira CB, Gregoracci GB, Thompson CC, Edwards RA, Brussaard CP, Dutilh BE, Thompson FL. 2017. Морские вирусы, обнаруженные с помощью метагеномики, проливают свет на вирусные стратегии в океанах. Нац Коммуна 8:15955. дои: 10.1038/ncomms15955. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

93. Roux S, Brum JR, Dutilh BE, Sunagawa S, Duhaime MB, Loy A, Poulos BT, Solonenko N, Lara E, Poulain J, Pesant С., Кандельс-Льюис С., Димьер С., Пичераль М., Сирсон С., Крюо С., Альберти А., Дуарте С.М., Газоль Дж.М., Вейг Д., Координаторы океанов Тары, Борк П., Ацинас С.Г., Винкер П., Салливан М. Б. 2016. Экогеномные и биогеохимические последствия некультивируемых глобально распространенных океанских вирусов. Природа 537:689–693. doi: 10.1038/nature19366. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

94. Buchfink B, Xie C, Huson DH. 2015. Быстрое и чувствительное выравнивание белков с помощью DIAMOND. Нат Методы 12:59–60. doi: 10.1038/nmeth.3176. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

95. Saitou N, Nei M. 1987. Метод соседнего соединения: новый метод реконструкции филогенетических деревьев. Мол Биол Эвол 4: 406–425. [PubMed] [Google Scholar]

96. О С., Каро-Кинтеро А., Цементзи Д., ДеЛеон-Родригес Н., Луо С., Порецкий Р., Константинидис К.Т. 2011. Метагеномное понимание эволюции, функции и сложности планктонных микробных сообществ озера Ланье, пресноводной экосистемы умеренного пояса. Appl Environ Microbiol 77:6000–6011. doi: 10.1128/AEM.00107-11. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

97. Тояма Д., Киши Л.Т., Сантос-Хуниор К.Д., Соареш-Коста А. , де Оливейра ТКС, де Миранда Ф.П., Энрике-Сильва Ф. 2016. Метагеномный анализ микроорганизмов в пресноводных озерах бассейна Амазонки. Геном объявляет 4:e01440-16. doi: 10.1128/genomeA.01440-16. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

98. Eiler A, Zaremba-Niedzwiedzka K, Martinez-García M, McMahon KD, Stepanauskas R, Andersson SG, Bertilsson S. 2014. Структурирование продуктивности и солености микропланктона, выявленное методом сравнительной пресноводной метагеномики. Окружающая среда микробиол 16: 2682–2698. doi: 10.1111/1462-2920.12301. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

99. Peura S, Sinclair L, Bertilsson S, Eiler A. 2015. Метагеномное понимание стратегий аэробной и анаэробной трансформации углерода и азота в бореальных озерах. научный представитель 5:srep12102. дои: 10.1038/srep12102. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

100. Кабельо-Йевес П.Дж., Гай Р., Мехршад М., Пиказо А., Камачо А.